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Name : ccmF (HI1094) Accession : NP_439251.1 Strain : Haemophilus influenzae Rd KW20 Genome accession: NC_000907 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C-type biogenesis protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1156609 - 1158555 bp Length : 1947 bp Strand : + Note : similar to SP:P33927 PID:405921 GB:U00096 PID:1788524 DNA sequence : ATGATTGCTGAATTAGGAAATTACGCACTTGCTTTAAGTTTAGCTGTATCGCTTATGTTGGCGATTTTCCCTTTGTGGGG GGCGGAAAAGGGCAATGCACAATTAATGGCATTAGCTCGCCCAATGACTTATGGTTTATTTGCAAGCCTAAGCATTGCTT TTGCTGCGCTATTTTATTTATTCGCAGTCAATGATTTTAGCGTGCAATATATTGTAAATAATTCTAATACTACTTTACCC ATTTATTATCGTTTATCTGCGGTATGGGGTTCCCATGAAGGCTCTTTGTTACTGTGGATTTGGTTACTGGCGGTTTGGTC ATTTGCCGTTGCTTTATTGAGTAAACATTTACCCCAAGAAGCGGTTGCTCGCGTGCTTGGTATTATGGGGATTATTAGCG TCGGTTTTGTATTGTTCGTCTTGTTTACCTCAAATCCTTTCACGCGTACTTTCCCTGATTTCCCAGTGGATGGAAAAGAA CTTAACCCAATGTTGCAAGATGTAGGCTTGATTTTCCACCCTCCATTACTTTATATGGGCTATGTGGGTTTTTCGGTGGC ATTTGCGTTTGCGATAGCATCCTTAATGACTGGAAAATTAGATTCAGCTTGGGCTCGTTGGTCACGTCCTTGGACGCTTG CTGCTTGGGTGTTTTTAACTTTAGGTATCGTACTCGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTTGGCTGGGGGGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAACTCATCGTTTATGCCGTGGCTTGCTGGTACTGCATTGATTCACTCTCTTTCTGTGACAGA AAAACGTGGTTCTTTCAAAGCTTGGACGGTATTACTTGCGATTTTAGCCTTTTCACTTTGTCTGCTCGGCACATTCTTAG TTCGTTCTGGTATCTTAGTTTCAGTTCACGCATTTGCATCGGATCCAACTCGTGGTTTGTATATTTTGGCTTACCTCGTT GTGGTAATTGGCGGTTCGCTTGCTCTCTATGCGTATAAAGGCAGTCAAATTCGTTCTCGTGATAATGCAGAACGCTATTC ACGTGAAAGTATGTTGTTATTAAATAATATCTTATTAATGACCGCACTTTGCGTTGTATTCTTAGGAACGTTGTTACCAC TTGTTCACAAACAACTTGGTTTAGGCTCTATTTCTATTGGTGCGCCGTTCTTTGATCAAATGTTCTTAATTATTATGACA CCATTTGCATTATTGCTTGGTATTGGACCTTTAGTGAAATGGCGTAGAGACCAATTTTCTGCAATTCGTACGCCTGTTGT TATCTGCGTATTTGTTATGCTGATTGCAGGTTTTGCGTTACCTTATTTCTTGCAAGATAAAATTACCGTGAGTTCAGTGC TTGGTTCAATGATGACTGTGATTATTGCGTTACTTGCGCTTTATGAATTGCAACAACGTGCGACGCATCGTGAATCATTC TTTGTTGGCGTACGCAAACTATCTCGTTCTCATTGGGGAATGATGTTAGCTCACTTAGGCGTAGCAATGACTGTTTGGGG GATCGCGTTTAGCCAAAACTTTAGCGTAGAACGTGATGTGAGAATGAAAGTTGGCGAGAGCGCACAAATTGGTCGTTACG ATTTTAAATTCACTGGTGTGACGGATGAAAATGGTCCAAACTATATTGGTGGAAAAGCTCAAATTGATATTTCTAAAGAT GGGCAACCAGAGGCGAGTTTATTCGCAGAAAAACGTTTTTACACAGTAAGTCGGATGTCTATGACAGAAGCCGCTATTGC TGGTGGTTTAACTCGTGACCTTTATGTGGCACTTGGCGAAAAACTTGAGGATAATTCTTGGGCGTTACGCTTATATTACA AGCCATTTATTCGCTGGATTTGGATTGGCGGCTTATTTATGGCGTTAGGTGGATTGTTGTGCATGTTCGATCGACGCTAT CGGTTTAATGTGTTGTTGAAGAAATAA Protein sequence : MIAELGNYALALSLAVSLMLAIFPLWGAEKGNAQLMALARPMTYGLFASLSIAFAALFYLFAVNDFSVQYIVNNSNTTLP IYYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLAVWSFAVALLSKHLPQEAVARVLGIMGIISVGFVLFVLFTSNPFTRTFPDFPVDGKE LNPMLQDVGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGKLDSAWARWSRPWTLAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENSSFMPWLAGTALIHSLSVTEKRGSFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV VVIGGSLALYAYKGSQIRSRDNAERYSRESMLLLNNILLMTALCVVFLGTLLPLVHKQLGLGSISIGAPFFDQMFLIIMT PFALLLGIGPLVKWRRDQFSAIRTPVVICVFVMLIAGFALPYFLQDKITVSSVLGSMMTVIIALLALYELQQRATHRESF FVGVRKLSRSHWGMMLAHLGVAMTVWGIAFSQNFSVERDVRMKVGESAQIGRYDFKFTGVTDENGPNYIGGKAQIDISKD GQPEASLFAEKRFYTVSRMSMTEAAIAGGLTRDLYVALGEKLEDNSWALRLYYKPFIRWIWIGGLFMALGGLLCMFDRRY RFNVLLKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 9e-158 | 63 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 3e-136 | 55 |
