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Name : HI0936 (HI0936) Accession : NP_439096.1 Strain : Haemophilus influenzae Rd KW20 Genome accession: NC_000907 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C-type biogenesis Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 994238 - 996145 bp Length : 1908 bp Strand : - Note : similar to SP:P32710 GB:X72298 PID:581146 GB:U00096 PID:1790511 DNA sequence : ATGCTTCCAGAACTTGGCTTTTTCCTTCTTTTACTCGCAACAGCTAGCGCGTTTTTCCTTGCGTTAGTGCCTCAATTTGG GTTATTCAAAAAAAATCCGACTTTAATTAATGCTGCTTGGCCGCTTAGTTATATTTTTACCCTTGCGACGACGTTATCAA TTGGTTTGCTTGCTTATTCTTTTGCGGTGGATGATTTCACCCTTGAATATGTAGCGGCACATTCTAATTCCCAATTACCT ACATTTTTTAAAGTGGCTGCCACTTGGGGAGGACATGAAGGTTCAATGTTGTTTTGGTTATTTTCATTGAGTTTATGGCT TGCTGCTTTTGCTTTTTTTAATCGAAAAAATGACCGCACTTTTTCTGCTCAATCTTTATCTTTATTGGGATTGATTTGCT TTGGTTTTGCGGTGTTTATTTTATTTTATTCCAATCCATTTGGACGCATTTTCCCAGCACCCGCAGAAGGGCGCGATCTC AATCCAATGTTGCAAGATGTGGGATTAATTTTCCATCCACCTTTACTATATGTTGGCTATGTGGGCTTTGCGGTAAATTT TGCAATGAGTTTGAGTGCGTTGATTTATAACCAATCTGCACGACAAATTGCCCGCTCAATGCGTGGATGGGTGTTGGTTT CTTGGTTATTTTTAACCATTGGCATTGTGCTTGGTGCTTGGTGGGCTTATTACGAACTTGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTC TGGGATCCCGTAGAAAATGCGTCTTTAATGCCTTGGTTGCTTGGTTTGGCATTATTACACAGTTTAATGGCGACGGAAAA ACAAGGCGTATTTAGTTATTGGACAACGCTTTTTTCTCTGCTTGCTTTTGCCTTTAGCGTATTAGGCACGTTTATTGTTC GTTCTGGCGCACTCACTTCTGTGCATGCTTTTGCATTGGATAACACGCGCGGTTATGTGTTGTTATTAATTTTCTTTGTT TTGACAGCGTTAGCCTTTGGTTTATTCGCTTTACGAGCGGGAAGTTCATCAGAAAGTGCGGTGAAATTTCAGTTCATTTC TAAATCGGGTGGCATTTTATTACTGAATATTTTGCTGACCATTGCGACGGTTTCTACCTTTTTAGGTACCTTTTACCCGA TGTTATTCCAAGCGATGAATTGGGGCTCAATTTCGGTGGGAAGTCCTTATTTTAATAGTATTTTCTTCCCCATTATTACG GCGATTTTAATCTTAATGGTAATTGTGCTTAGCATACGTAAGGGGCAATTTGATCGCACATTATTGATACGTTGTGGGTG GTTGCTTATTCCGTCTTTAATTCTTGCAGGCCTAATGATTTGGCAACAGCTACGAAATAATTCTGCATTACATTTCCATG CTTTCGCCTTTGTGTTATTAACTCTTGCGATTTGGCTTTTATTCGTCACGTTATGGCAAAATTGGCGACAAATTCGCTTG TCTCAATTTGGGATGATTTTAGCACACTGTGGCGTGGCGATTGTGACTATTGGTGCGGTGATGAGTGGGTATTTTGGCAG TGAAATTGGTGTGCGTTTAGCACCGCAACAAAGTCAAACGTTAGGGCAATATGAATTTCATTATCGCCAATTTTCTAATG AAATTGGGCCAAACTTTACGGCAGAAGTCGCCTTTTTTGACGTAACTAAAAATGGTAAACCTTATGCAGAAATTATCCCA GAACGCCGTTATTACGATGTACGAACAATGACAATGAGTGAAGTGGGGCTTGATGGTGGTTTTTGGGGCGATTTATATAT TGTGATGGGCGATTCTCTTGGCAAAGGGGAATTTACTTTCCGCTTACATTATAAACCACTGATTCGTTGGCTTTGGGCGG GCGGTATTTTAATGGCCTTTGGCGCACTTTTTAGCGTTTTCGGATTACGCAGAAAACAGGAAAAATAA Protein sequence : MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNPTLINAAWPLSYIFTLATTLSIGLLAYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP TFFKVAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV LTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT AILILMVIVLSIRKGQFDRTLLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRNNSALHFHAFAFVLLTLAIWLLFVTLWQNWRQIRL SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEVAFFDVTKNGKPYAEIIP ERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAFGALFSVFGLRRKQEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-82 | 43 |
