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Name : nfrE (HD0615) Accession : NP_873156.1 Strain : Haemophilus ducreyi 35000HP Genome accession: NC_002940 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 477456 - 479351 bp Length : 1896 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTCCCAGAGTTGGGTTATTTTTCATTAATAGTGGCGGCAGTTAGTGCTTCATTACAAGTGCTATTGTCTGTATTCGG CGAATTATTTAAACGCTCACATTATTTATCTTTCAATGCTTTTTTTAGTCGGCTACAAGCGCTATTTTGTACTTTTGCAT TTGGCGTGCTTGGTTATGCATTTATCATCGACGATTTTTCTATTATCTATGTTGCACACCATTCAAATACGCAATTACCT GATTTTTTTAAATTTGCAGCGAGTTGGGGCGGGCATGAAGGGTCAATGTTATTTTGGTTAACTATTTTGACCATTTGGAC GGCAGTCTTTAGCTTTTTTGCTAATAAATCTGACCGCTTATTTTATGATCGCACCTTGGCAATACTTGGGTTAATTAGCC TCGGTTTCTTGTTATTTATTTTATCTGTTTCTAATCCGTTTGAACGTAATTTCCCTCCACCGCCTGAAGGGCGTGATTTA AATCCAATGTTACAAGATATTGGTTTAATTTTGCATCCGCCGTTACTTTATATTGGCTATGTTGGTTTTGCGGTCAGTTT TGCGATGGTTGTAGCCAGTTTAATGTCGGGAGTGTTAGACGCTGCGGTCAGTCGTTGGATTCGTCCTTGGGTCATGATTT CTTGGGGGCTATTAACCGCCGGGATTATTTTGGGGGCTTGGTGGGCTTATTATGAATTAGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTT TGGGATCCGGTTGAAAATGCTTCATTAATGCCGTGGTTGTTAGGAACCGCATTATTACATAGTTTAATTGTGACTGAACA ACGTGGTATTTTCAGTTATTGGACCATTTTACTCGCAATTTTTGCCTTTGCCTTAAGTTTACTTGGCACTTTTATTGTTC GCTCTGGTATATTAACCTCAGTTCATGCATTTGCCGTGGATTCTGATCGCGGTATTGCATTATTGATTTTATTTTTTAGT TTAAGTTTTATTGCATTAGCGCTGTTTGCCTTAAAAGTAAGAGTCTGGCCGGGCAGAGTACATTTTCAGCTTTTTTCAAA AGAAGTCGCTTTTTTATTGATTAATGGCTTGTTAACCGTTGCAACTTCAACCGTGGCGCTGGGTACTTTTTATCCGATGA TTTTTACGGCAATGGGGTGGGGATCTATTTCTGTTGGCGCACCTTATTTCAATAGTATTTTTGCACCTTTAGCATTGCTA TTAATGTCAGTTATGGGATTAGCGGTGGTTTTATGTTGGAAACAGGTTGCCACTAGCGTGATTTTGATCAGATTATGGCT CTTACCCATTGCATTTAGTTTAGCTTGTAGTTTGATTTATTTTACTATTCAAACGAATAATGTGCATCAATTTAGTCTAT TGCCTATCGTATTTGTTGGACTGGCTATTTGGATTATTATTAGCCATTTCCCTTATCGGCGATATATGTGGAAAATTCAA CCGCTCGCAATGCGATTAGCACATATTGGCTTTGCAATTTGTGTAATTGGGGCAATAATGAATAGTTATTATGGCGATGA AATAAGTGTACGTTTGAAGCCACAACAACAAGCGTCATTAGCCGGTTTTAATTTTAATTATCAGGCTTATCGTGATGTGA TTGGACCAAACTATACCGCAGAACGTGCTATTTTTACTATAGAAAAATCGCACAAGCAGTTAGCCACCGTGAAACCAGAA CGTCGTTATTATGATGTAAGAACAATGACTATGGCAGAAGTCGGTCTTTATCACGCGGGTTTAGATGATGTTTATATTGT GATGGGCGATAAATTAGGTGATTTTGAATATGCGTTCCGTTTACACTATAAACCTTACGTGAGTGCATTATGGCTAGGTG GCATCATGATGATGCTTGCCTCGTTTTTAGCTTTATTAGGATATCGTGGAAAATAA Protein sequence : MLPELGYFSLIVAAVSASLQVLLSVFGELFKRSHYLSFNAFFSRLQALFCTFAFGVLGYAFIIDDFSIIYVAHHSNTQLP DFFKFAASWGGHEGSMLFWLTILTIWTAVFSFFANKSDRLFYDRTLAILGLISLGFLLFILSVSNPFERNFPPPPEGRDL NPMLQDIGLILHPPLLYIGYVGFAVSFAMVVASLMSGVLDAAVSRWIRPWVMISWGLLTAGIILGAWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGTALLHSLIVTEQRGIFSYWTILLAIFAFALSLLGTFIVRSGILTSVHAFAVDSDRGIALLILFFS LSFIALALFALKVRVWPGRVHFQLFSKEVAFLLINGLLTVATSTVALGTFYPMIFTAMGWGSISVGAPYFNSIFAPLALL LMSVMGLAVVLCWKQVATSVILIRLWLLPIAFSLACSLIYFTIQTNNVHQFSLLPIVFVGLAIWIIISHFPYRRYMWKIQ PLAMRLAHIGFAICVIGAIMNSYYGDEISVRLKPQQQASLAGFNFNYQAYRDVIGPNYTAERAIFTIEKSHKQLATVKPE RRYYDVRTMTMAEVGLYHAGLDDVYIVMGDKLGDFEYAFRLHYKPYVSALWLGGIMMMLASFLALLGYRGK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 7e-88 | 43 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-76 | 41 |
