|
Name : ccmF (HD0792) Accession : NP_873305.1 Strain : Haemophilus ducreyi 35000HP Genome accession: NC_002940 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 626351 - 628309 bp Length : 1959 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTGCAGAATTAGGCAATTATAGCCTTGCCCTTGCGCTAGGCTTGTCAATTTTCTTGGCAATTTTACCGCTTGTAGG TGCGGAGAGACAGCAAACTACACTGATTGGATTAGCAAGGCCACTAACTTGGGCGATGTTTTTAGCGCTCTCTTTATCAT TTTTTGCGTTGTTTTATTTGTTTGCAGTGAATGATTTTAGTGTTCAGTATGTCGTGAATAATTCAAATTCAATGTTGCCT TTGCAGTATCGTTTATCGGCTGTTTGGGGATCGCATGAAGGGTCGATGCTATTGTGGGTATGGTTACTTTCGTTGTGGTC TGTTGCGGTGGCTGCGTTAACACGTCAAATGCCTGAAGACGCGGTAGCAAGAGTATTAAGTGTGATGGGCTTGATTAGCA TTGGTTTTTTAATTTTTATTATTTTTAGTTCAAATCCATTTAATCGAACATTCCCTAATTTTCCTGCTGATGGCCGTGAA TTAAATCCTATGTTACAAGATATTGGGTTGATTTTTCATCCACCTTTGTTATATATGGGCTATGTTGGTTTTTCGGTTGC GTTTGCATTTGCAATTGCTTCGTTAATGACAGGTCGATTGGATACTGCTTGGGCAAGGTGGTCACGACCTTGGACAATCG CCGCGTGGGTCTTTTTAACATTGGGTATCGTGCTAGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAGTTAGGCTGGGGGGGCTGGTGG TTTTGGGATCCGGTTGAAAATGCATCTTTAATGCCGTGGTTGGCTGGCACCGCGTTAATGCATTCTTTAGCGGTAACGGA AAAACGCAGTGCTTTCAAGGCGTGGACAGTCTTATTAGCCATTTTAGCTTTTTCGCTCTGTTTATTAGGCACCTTCTTAG TTCGTTCAGGCATTTTGGTTTCAGTGCATGCGTTTGCTTCGGATCCAACACGTGGTCTATATATTTTGGCTTATTTAGTG TTGGTGATTGGAGGCTCTTTGCTCCTTTATGCATTTCAAGGTTCGAAAATTAGAAGTTTGGATAATTATGAACGTTATTC ACGAGAATCAATGTTATTGATTAATAATATTGTATTAATGGCATTTTTATCCGTGGTCTTTTTAGGTACTATTTTGCCTT TAATTCATAAGCAGATTGGTTTAGGCACGATTTCAATTGGTGCGCCGTTTTTTGATCAGATGTTTTTGATTTTAATGGTG CCATTTGCATTTATTTTAGGTATTGGGCCTTTAGTCAAATGGCGTAGAGATCAGGTTTCAGCTATTAGGCTACCGGTGAT TATTTCATTTGTACTGATGTTGATTCTTGGTGTTGTACTGCCTTATTGGTTTATAGATCGAATAACGATAACCTTGATCC TTGGTGTCATGATGGCGGTTATTATCGTGTTGTTGAGCCTGTATGAGTTGTATCAACGTGCTACACATCGACACAGCTTT CTTGTTGGTATATTTAAGCTTTCTCGTTCGCATTGGGGAATGGTTTTGGCGCATTTAGGTGTGGCAATGTTAGTCTTTGG CATTACGTTTAGTCAAAATTTCAGTATTGAAAAAAATGTACGGATGAAGGTTGGCGATACTGTTCAAATTAAAGATTATG ATTTTACCTTTAAAGGGATAAAAATTACTGACGGTGCTAACTATCAAGGCGGTACTGCTGAAATTGAAGTCCATCATAAT GGTAAATTTGAAGCAACTTTGAATGCGGAAAAACGTTTCTATAATGTCAGTAAAATGGGAATGACTGAAGCTGCGATTGA TTGGGGCTTTAGTCGAGATTTATATGCGGCGTTAGGTGAAAAATTGGAAGATAACTCTTGGGGCGTGCGTTTATATTATA AACCATTTATTCGTTGGATTTGGTTAGGTGGTTTATTTATGGCTCTAGGCGGGGTATTGTGTATGCTAGATAGACGTTAT CGTTTAACATTAGTTAATAAGTCCACTGAGGATCATTAA Protein sequence : MIAELGNYSLALALGLSIFLAILPLVGAERQQTTLIGLARPLTWAMFLALSLSFFALFYLFAVNDFSVQYVVNNSNSMLP LQYRLSAVWGSHEGSMLLWVWLLSLWSVAVAALTRQMPEDAVARVLSVMGLISIGFLIFIIFSSNPFNRTFPNFPADGRE LNPMLQDIGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGRLDTAWARWSRPWTIAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASLMPWLAGTALMHSLAVTEKRSAFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV LVIGGSLLLYAFQGSKIRSLDNYERYSRESMLLINNIVLMAFLSVVFLGTILPLIHKQIGLGTISIGAPFFDQMFLILMV PFAFILGIGPLVKWRRDQVSAIRLPVIISFVLMLILGVVLPYWFIDRITITLILGVMMAVIIVLLSLYELYQRATHRHSF LVGIFKLSRSHWGMVLAHLGVAMLVFGITFSQNFSIEKNVRMKVGDTVQIKDYDFTFKGIKITDGANYQGGTAEIEVHHN GKFEATLNAEKRFYNVSKMGMTEAAIDWGFSRDLYAALGEKLEDNSWGVRLYYKPFIRWIWLGGLFMALGGVLCMLDRRY RLTLVNKSTEDH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-146 | 61 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 4e-126 | 51 |
