Gene Information

Name : ccmF (lpg0861)
Accession : YP_094896.1
Strain : Legionella pneumophila Philadelphia 1
Genome accession: NC_002942
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome C biogenesis protein CcmF
Function : -
COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones
COG ID : COG1138
EC number : -
Position : 935335 - 937287 bp
Length : 1953 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGATAGCGGAATTAGGGCTGTTTTTTTTGGTTTTGGCTTTAGTGGCTTCTTTGATGTTAGCTTTGATCCCATTGGCGGG
TTTGCAATTCAATCGGAAAGACTGGATTGATTCCTCCAGGAATTATGTCGTGCTGCAATTTTTATTTGTGGCATGTGCTT
ACCTATGTCTCACGGCCTGTTTTTTGATGGATGATTTTTCGGTGATCTATGTGCTGAATAATTCCAGCTTATTGCTCCCA
TGGTTTTATAAATTTTGTGCTGTGTGGGGTGGGCATGAAGGTTCCATGCTGTTATGGGTCGCTATCCTTAGTTTTTGGAT
GATCCTGGTTTGTTTTTTTAGCTCAAGCCTTGATACGGAAATGCGCGCTCGGGTATTAGTTATTTTAGGTTGGCTAAGTA
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GCAACGCCAGCAATTTAAAGCGTGGACCATGTTGCTTGCAATCGCTGCTTTTTCTTTAAGTTTAATTGGTACTTTTCTTG
TTCGCTCTGGAGTTTTAACTTCAGTTCATGCCTTTGCGGTTGATCCTCAGCGGGGATTATATATTCTGGGATTTTTGTTA
TTCGTCATTGGGGGTTCTTTAACATTGTTTCTTTTCAGAGCCCAAACCTTGCAAGTCAATAAACATCCTGGCTTATTATC
CCGAGAAAGTGCGTTGTTGTTAAACAATGTGTTTTTAGTGGTTATTATGCTGACGGTATTAATGGGCACGGTTTATCCAT
TGCTGGTGGAAGGGTTAGGGTTAGGTAAATTATCCGTTGGAGCGCCCTATTTTAATGCAGTATTTGTTCCATTAATGATT
CCTTTATTGTTGCTAATGGGGTTAGGTGTCCGTTTGAAATGGCAGAATGATTGTTGGAGGGATGTCTTCAGAAAGCTAAA
TCGTATTTTTTTGCTTAGTCTGATATTGCCTGTCATTTTACTATTCTGTACCTCAACTGAAATACACCTTACAGCCCTTT
TGGGATTAATTTTGGCATTCTGGGTTTTGTTGAGTACTGCTAATGCGGCGTATCACAAAGTCAGGGATAGAGGGGTGGCA
GGAGTTGGACAGGCTTATTGGGGGATGGTTTTGGCTCATTGTGGTGTCGCAGCAACAGTGATTGGCATTGCTGTTTCTTC
AGCTTATGGCGTACAAGATGATGTACGTATGTCTCCTGGCAAGCAAGTGAATCTGCTGGATTATCAGATTGGATTCATTA
ATCAGACTCCGTTGAATGGCCCAAATTACAAAGGGACAAGGGCTGAGTTTTCAATACAATATCAGAATAAAACCAGGAAA
ATTTTTCCTGAAAAAAGAGTGTATACCATTGGACAAATGCCAATGACTGAGTCTGCGATTGATGTTACTCCTTTCCGAGA
TATTTACATTGCTTTGGGGGAACCACTGTCTGAGGATGCCTGGTCGGTACGTATTTATTATAAACCGTTGGTCCGCTGGA
TTTGGGCTGGCGGATTTATGATTTTAGCCGGAGGCGTTTTGGCATTAACAGATAGAAGGTATTACAGAAAAAGGCAAGTA
ACGGTAATGTCAGTGCGGGAGATCAAGATATGA

Protein sequence :
MIAELGLFFLVLALVASLMLALIPLAGLQFNRKDWIDSSRNYVVLQFLFVACAYLCLTACFLMDDFSVIYVLNNSSLLLP
WFYKFCAVWGGHEGSMLLWVAILSFWMILVCFFSSSLDTEMRARVLVILGWLSIGFILFLLMTSNPFLRQFQVLNTQGRD
LNPLLQDPGFLFHPPMLYMGYVGFCVAFAFAIAALWAGKVETSWSKWTRPWTLAAWCCLTAGITLGSWWAYRELGWGGWW
FWDPVENASFMPWLVGTALLHSLAVTEQRQQFKAWTMLLAIAAFSLSLIGTFLVRSGVLTSVHAFAVDPQRGLYILGFLL
FVIGGSLTLFLFRAQTLQVNKHPGLLSRESALLLNNVFLVVIMLTVLMGTVYPLLVEGLGLGKLSVGAPYFNAVFVPLMI
PLLLLMGLGVRLKWQNDCWRDVFRKLNRIFLLSLILPVILLFCTSTEIHLTALLGLILAFWVLLSTANAAYHKVRDRGVA
GVGQAYWGMVLAHCGVAATVIGIAVSSAYGVQDDVRMSPGKQVNLLDYQIGFINQTPLNGPNYKGTRAEFSIQYQNKTRK
IFPEKRVYTIGQMPMTESAIDVTPFRDIYIALGEPLSEDAWSVRIYYKPLVRWIWAGGFMILAGGVLALTDRRYYRKRQV
TVMSVREIKI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ccmF YP_217241.1 cytochrome c-type biogenesis protein Not tested SPI-12 Protein 2e-114 52
ccmF AAN62106.1 putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF Not tested PAGI-2(C) Protein 1e-122 51