Name : glcD (alr5269) Accession : NP_489309.1 Strain : Nostoc sp. PCC 7120 Genome accession: NC_003272 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate oxidase subunit Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0277 EC number : - Position : 6285771 - 6287063 bp Length : 1293 bp Strand : + Note : ORF_ID:alr5269 DNA sequence : GTGGCGGCGGTAGTGAAAATATGTAATCAGTATTCTGTCCCCTTCATTGCACGGGGTTCTGGGACTGGCTTATCTGGTGG TGCTTTACCATCGGAAGATTCAGTTTTAATTGTTACTTCTTTAATGCGACAAATTCTGAGCGTTGACTTAGATAATCAGC GTATTATTGTACAACCAGGGGTAATTAACAGTTGGGTGACACAGACTGTTAGTGGTGCTGGATTTTATTATGCGCCAGAC CCTTCTAGTCAGATTATCTGTTCCATTGGGGGTAACGTTGCGGAAAACTCTGGTGGGGTGCATTGTTTGAAGTATGGTGT CACAACAAATCACGTTTTGGGTTTGAAAATTGTCACGCCGGAAGGAGAAATAGTTGATTTAGGTGGACAAATTCCCGAAA GTCCTGGTTATGACTTAACTGGTATATTTGTCGGTTCGGAGGGTACTTTAGGGATTGCTACAGAAATTACCTTGCGGATT CTCAAAAGTGCAGAATCGATTTGTGTGTTATTAGCAGACTTTACCAGTGTGGAAGCGGCTGGGGCGACCGTTTCCGACAT CATCAGCGCGGGGATAATTCCTGGTGGGATGGAAATGATGGATAACGTTAGTATTAACGCGGTGGAAGATGTTGTTGCTA CTAATTGTTATCCGCGTGATGCAACAGCAATTTTGTTAGTAGAAATTGATGGTTTAGAAGTTGAAGTTGCGGTGAATAAA CAACGCGTTATAGATATTTGTAAACAGAATGGGGCGCGTAGTGTGACTTCTGCTAGTGACCCAGAAATGAGATTGAAATT ATGGAAAGGGCGTAAGGCGGCTTTTGCTGCGGCTGGTCATTTAAGCCCAGATTATTATGTGCAGGATGGGGTAATTCCTC GGACTCAATTACCTTATGTGTTGCAGGAAATTGAGGTGTTGAGTCAAAAATTTGGTTATCCAATTGCCAATGTTTTTCAT GCTGGTGATGGTAATCTGCATCCGTTGATTTTGTTTGATAATGCCATTCCTGGTGCATTGGAGAAAGTCGAGGAATTGGG AGGAGAAATTCTCAAACTTTGTGTGAGAGTCGGCGGTAGCATTTCTGGAGAACATGGGATTGGGGCAGATAAAAAATGTT ATATGCCTGATATGTTTAGTGATGCTGATTTAGAAACAATGCAGTGGGTACGGCAGGTATTTAACCCCCAAGGTTTGGCT AATCCGGGAAAGATATTCCCCACACCGCGCACTTGTGGCGAAGCGGCTAACGTAGCTAATCATAAGCAGTTGGAAGGAGT GGAAAGGTTTTAA Protein sequence : MAAVVKICNQYSVPFIARGSGTGLSGGALPSEDSVLIVTSLMRQILSVDLDNQRIIVQPGVINSWVTQTVSGAGFYYAPD PSSQIICSIGGNVAENSGGVHCLKYGVTTNHVLGLKIVTPEGEIVDLGGQIPESPGYDLTGIFVGSEGTLGIATEITLRI LKSAESICVLLADFTSVEAAGATVSDIISAGIIPGGMEMMDNVSINAVEDVVATNCYPRDATAILLVEIDGLEVEVAVNK QRVIDICKQNGARSVTSASDPEMRLKLWKGRKAAFAAAGHLSPDYYVQDGVIPRTQLPYVLQEIEVLSQKFGYPIANVFH AGDGNLHPLILFDNAIPGALEKVEELGGEILKLCVRVGGSISGEHGIGADKKCYMPDMFSDADLETMQWVRQVFNPQGLA NPGKIFPTPRTCGEAANVANHKQLEGVERF |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-102 | 52 |