Gene Information

Name : glcD (alr5269)
Accession : NP_489309.1
Strain : Nostoc sp. PCC 7120
Genome accession: NC_003272
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : glycolate oxidase subunit
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0277
EC number : -
Position : 6285771 - 6287063 bp
Length : 1293 bp
Strand : +
Note : ORF_ID:alr5269

DNA sequence :
GTGGCGGCGGTAGTGAAAATATGTAATCAGTATTCTGTCCCCTTCATTGCACGGGGTTCTGGGACTGGCTTATCTGGTGG
TGCTTTACCATCGGAAGATTCAGTTTTAATTGTTACTTCTTTAATGCGACAAATTCTGAGCGTTGACTTAGATAATCAGC
GTATTATTGTACAACCAGGGGTAATTAACAGTTGGGTGACACAGACTGTTAGTGGTGCTGGATTTTATTATGCGCCAGAC
CCTTCTAGTCAGATTATCTGTTCCATTGGGGGTAACGTTGCGGAAAACTCTGGTGGGGTGCATTGTTTGAAGTATGGTGT
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CTAATTGTTATCCGCGTGATGCAACAGCAATTTTGTTAGTAGAAATTGATGGTTTAGAAGTTGAAGTTGCGGTGAATAAA
CAACGCGTTATAGATATTTGTAAACAGAATGGGGCGCGTAGTGTGACTTCTGCTAGTGACCCAGAAATGAGATTGAAATT
ATGGAAAGGGCGTAAGGCGGCTTTTGCTGCGGCTGGTCATTTAAGCCCAGATTATTATGTGCAGGATGGGGTAATTCCTC
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GCTGGTGATGGTAATCTGCATCCGTTGATTTTGTTTGATAATGCCATTCCTGGTGCATTGGAGAAAGTCGAGGAATTGGG
AGGAGAAATTCTCAAACTTTGTGTGAGAGTCGGCGGTAGCATTTCTGGAGAACATGGGATTGGGGCAGATAAAAAATGTT
ATATGCCTGATATGTTTAGTGATGCTGATTTAGAAACAATGCAGTGGGTACGGCAGGTATTTAACCCCCAAGGTTTGGCT
AATCCGGGAAAGATATTCCCCACACCGCGCACTTGTGGCGAAGCGGCTAACGTAGCTAATCATAAGCAGTTGGAAGGAGT
GGAAAGGTTTTAA

Protein sequence :
MAAVVKICNQYSVPFIARGSGTGLSGGALPSEDSVLIVTSLMRQILSVDLDNQRIIVQPGVINSWVTQTVSGAGFYYAPD
PSSQIICSIGGNVAENSGGVHCLKYGVTTNHVLGLKIVTPEGEIVDLGGQIPESPGYDLTGIFVGSEGTLGIATEITLRI
LKSAESICVLLADFTSVEAAGATVSDIISAGIIPGGMEMMDNVSINAVEDVVATNCYPRDATAILLVEIDGLEVEVAVNK
QRVIDICKQNGARSVTSASDPEMRLKLWKGRKAAFAAAGHLSPDYYVQDGVIPRTQLPYVLQEIEVLSQKFGYPIANVFH
AGDGNLHPLILFDNAIPGALEKVEELGGEILKLCVRVGGSISGEHGIGADKKCYMPDMFSDADLETMQWVRQVFNPQGLA
NPGKIFPTPRTCGEAANVANHKQLEGVERF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcD CAE85245.1 GlcD protein Not tested PAI V 536 Protein 4e-102 52