Gene Information

Name : CPS_2009 (CPS_2009)
Accession : YP_268739.1
Strain : Colwellia psychrerythraea 34H
Genome accession: NC_003910
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : anion transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 2079740 - 2081191 bp
Length : 1452 bp
Strand : -
Note : identified by match to protein family HMM PF00939; match to protein family HMM TIGR00785

DNA sequence :
ATGACAGATATTCAAGACAAAGCAACGCCATTGCGTATGCTCGTATTAGGGCCAGCATTAATGCTGTTCACCTTATTAGT
TCCTTCTCCCTTTGAAGGTATGTCTGCAGATGCATGGCACACCCTAGGTTTAGCATTGTGGATGGCCACTTGGTGGATAT
CTGAAGCAACCCCTGTTTCAGTTACCGCTTTTTTACCCTTAATCGTTGCGCCAATTGTTGGCATAGCACCCATTAAGGTA
ACAACATCGTCTTATGCACACCCTTTAATATTCCTTTTCCTTGGAGGATTTTTTATCTCCATAGCGATGGAACGATGGAA
CTTACATAAACGAATTGCCTTAAAAGCAATGTCGTTATGTAGCACTAAACCCAGCCACCAAATTGGCGGGTTAATGCTTG
TCACTGCTTTCTTATCAATGTGGATGTCTAATACAGCAACCGCAGTCATGATGTTGCCTATCGCCTTATCTATTATCGAG
ATGGTTAAGCAGAAGCAAAATGGTAGTACCCCTGAAAACTTTTCAAAACCAATGTTATTAGCTATTGCTTTTTCTGCAAG
TATTGGTGGCTTAGCGACCTTGATTGGTACTCCTCCTAATGCGCTGATGGCGGCTTATTTAGCTGATAGCTACAACATTG
AAATCGGCTTTGCCCAATGGATGATTATCGGCGTACCGTTAAGTGCAGTATTGTTGGTATTGTGTTGGTTTATTCTTACC
AAGGTTTGTTACCAAGTTAATGAAGGGGAACGAGTTGATACAAACAGTATGTTCCAAGAGAAACTTCAGGAATTAGGGAA
AATGAACAAAGGCGAGAAACTCGTACTGTTTTTCTTTGCTTTTGCTGCTATCAGTTGGATATTTAGACCATTAATAGCCA
AAATGACTGGGCTAGCTATATCGGATACCGGCATCGCTATGTTCGTGGCTTTGTTATTATTTGTTGTACCTGTTGACCGG
AAAAAAGATATCCGTATTTTAGCTTGGGAAGACACTAAGAAGTTACCTTGGGGTGTATTGTTGCTTTTCGGTGGTGGATT
AGCCTTAGCCAGTTTAATCAAAAAATCAGGACTAGCGGGTTACATAGCCACACAGCTTGAAGCAACGTCTAATATTCCTG
TTATTGCTGCCGTTTTAGTCGTTACTATTACTATATTATTCTTGACTGAAGTAACAAGTAATACGGCAACAGCTGCTAGT
TTCTTACCTTTATTAGGACCAATAGCTGTGACCTTAACTGATGGACCTTTAATGTTAGTTATCCCTGCCGCATTAGCTGC
TAGTTGTGCCTTTATGATGCCAGTGGCAACACCGCCAAATGCTATCGTATTTAGCTCCGGAGAATTACGTATTGCCGACA
TGGCCAGAGCAGGTTTCTGGCTTAATATCGCAGCTATATTTATGATCGTTTTATTGATGTTAACTACAGTACCTATGGTC
TTTAACTTATAA

Protein sequence :
MTDIQDKATPLRMLVLGPALMLFTLLVPSPFEGMSADAWHTLGLALWMATWWISEATPVSVTAFLPLIVAPIVGIAPIKV
TTSSYAHPLIFLFLGGFFISIAMERWNLHKRIALKAMSLCSTKPSHQIGGLMLVTAFLSMWMSNTATAVMMLPIALSIIE
MVKQKQNGSTPENFSKPMLLAIAFSASIGGLATLIGTPPNALMAAYLADSYNIEIGFAQWMIIGVPLSAVLLVLCWFILT
KVCYQVNEGERVDTNSMFQEKLQELGKMNKGEKLVLFFFAFAAISWIFRPLIAKMTGLAISDTGIAMFVALLLFVVPVDR
KKDIRILAWEDTKKLPWGVLLLFGGGLALASLIKKSGLAGYIATQLEATSNIPVIAAVLVVTITILFLTEVTSNTATAAS
FLPLLGPIAVTLTDGPLMLVIPAALAASCAFMMPVATPPNAIVFSSGELRIADMARAGFWLNIAAIFMIVLLMLTTVPMV
FNL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
DIP0179 NP_938571.1 hypothetical protein Not tested Not named Protein 1e-71 44