Name : SMU_286 (SMU_286) Accession : NP_720745.1 Strain : Streptococcus mutans UA159 Genome accession: NC_004350 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ABC transporter ATP-binding protein ComA Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 270628 - 272910 bp Length : 2283 bp Strand : + Note : Best Blastp Hit: sp|Q03727|COMA_STRPN TRANSPORT ATP-BINDING PROTEIN COMA >gi|520738|gb|AAA69510.1| (M36180) comA protein [Streptococcus pneumoniae] DNA sequence : ATGAAACAAGTTATTTATGTTGTTTTAATCGTCATAGCCGTTAACATTCTCTTAGAGATTATCAAAAGAGTAACAAAAAG GGGAGGGACAGTTTCGTCATCTAATCCTTTACCAGATGGGCAGTCTAAGTTGTTTTGGCGCAGACATTATAAGCTAGTAC CTCAGATTGATACCAGAGACTGTGGGCCGGCAGTGCTGGCATCTGTTGCAAAGCATTACGGATCTAATTACTCTATCGCT TATCTGCGGGAACTCTCAAAGACTAACAAGCAGGGAACAACAGCTCTTGGCATTGTTGAAGCTGCTAAAAAGTTAGGCTT TGAAACACGCTCTATCAAGGCGGATATGACGCTTTTTGATTATAATGATTTGACCTATCCTTTTATCGTCCATGTGATTA AAGGAAAACGTCTGCAGCATTATTATGTCGTCTATGGCAGCCAGAATAATCAGCTGATTATTGGAGATCCTGATCCTTCA GTTAAGGTGACTAGGATGAGTAAGGAACGCTTTCAATCAGAGTGGACAGGCCTTGCAATTTTCCTAGCTCCTCAGCCTAA CTATAAGCCTCATAAAGGTGAAAAAAATGGTTTGTCTAATTTCTTCCCGTTGATCTTTAAGCAGAAAGCTTTGATGACTT ATATTATCATAGCTAGCTTGATTGTGACGCTCATTGATATTGTCGGATCATACTATCTCCAAGGAATATTGGACGAGTAC ATTCCTGATCAGCTGATTTCAACTTTAGGAATGATTACGATTGGTCTGATAATAACCTATATTATCCAGCAGGTCATGGC TTTTGCAAAAGAATACCTCTTGGCCGTACTCAGTTTGCGTTTAGTCATTGATGTTATCCTGTCTTATATCAAACATATTT TTACGCTTCCTATGTCTTTCTTTGCGACAAGGCGAACAGGAGAAATCACGTCTCGTTTTACAGATGCCAATCAGATTATT GATGCTGTAGCGTCAACCATCTTTTCAATCTTTTTAGATATGACTATGGTAATTTTGGTTGGTGGGGTTTTGTTGGCGCA AAACAATAACCTTTTCTTTCTAACCTTGCTCTCCATTCCGATTTATGCCATCATTATTTTTGCTTTCTTGAAACCCTTTG AGAAAATGAATCACGAAGTGATGGAAAGCAATGCTGTGGTAAGTTCTTCTATCATTGAAGATATCAATGGGATGGAAACC ATTAAATCACTCACAAGTGAGTCCGCTCGTTATCAAAACATTGATAGTGAATTTGTTGATTATTTGGAGAAAAACTTTAA GCTACACAAGTATAGTGCCATTCAAACCGCATTAAAAAGCGGTGCTAAGCTTATCCTCAATGTTGTCATTCTCTGGTATG GCTCTCGTCTAGTTATGGATAATAAAATCTCAGTTGGTCAGCTTATCACCTTTAATGCTTTGCTGTCTTATTTCTCAAAT CCAATTGAAAATATTATCAATCTGCAATCCAAACTGCAGTCAGCTCGCGTTGCCAATACACGTCTTAATGAGGTCTATCT TGTCGAATCTGAATTTGAAAAAGACGGCGATTTATCAGAAAATAGCTTTTTAGATGGTGATATTTCGTTTGAAAATCTTT CTTATAAATATGGATTTGGGCGAGATACCTTATCAGATATTAATTTATCAATCAAAAAAGGCTCCAAGGTCAGTCTAGTT GGAGCCAGTGGTTCTGGTAAAACAACTTTGGCTAAACTGATTGTCAATTTCTACGAGCCTAACAAGGGGATTGTTCGAAT CAATGGCAATGATTTAAAAGTTATTGATAAGACAGCTTTGCGGCGGCATATTAGCTATTTGCCGCAACAGGCCTATGTTT TTAGTGGCTCTATTATGGATAATCTCGTTTTAGGAGCTAAAGAAGGAACGAGTCAGGAAGACATTATTCGTGCTTGTGAA ATTGCTGAAATCCGCTCGGACATTGAACAAATGCCTCAGGGCTATCAGACAGAGTTATCAGATGGTGCCGGTATTTCTGG CGGTCAAAAACAGCGGATTGCTTTAGCTAGGGCCTTATTAACACAGGCACCGGTTTTGATTCTGGATGAAGCCACCAGCA GTCTTGATATTTTGACAGAAAAGAAAATTATCAGCAATCTCTTACAGATGACGGAGAAAACAATAATTTTTGTTGCCCAC CGCTTAAGCATTTCACAGCGTACTGACGAAGTCATTGTCATGGATCAGGGAAAAATTGTTGAACAAGGCACTCATAAGGA ACTTTTAGCTAAGCAAGGTTTCTATTATAACCTGTTTAATTGA Protein sequence : MKQVIYVVLIVIAVNILLEIIKRVTKRGGTVSSSNPLPDGQSKLFWRRHYKLVPQIDTRDCGPAVLASVAKHYGSNYSIA YLRELSKTNKQGTTALGIVEAAKKLGFETRSIKADMTLFDYNDLTYPFIVHVIKGKRLQHYYVVYGSQNNQLIIGDPDPS VKVTRMSKERFQSEWTGLAIFLAPQPNYKPHKGEKNGLSNFFPLIFKQKALMTYIIIASLIVTLIDIVGSYYLQGILDEY IPDQLISTLGMITIGLIITYIIQQVMAFAKEYLLAVLSLRLVIDVILSYIKHIFTLPMSFFATRRTGEITSRFTDANQII DAVASTIFSIFLDMTMVILVGGVLLAQNNNLFFLTLLSIPIYAIIIFAFLKPFEKMNHEVMESNAVVSSSIIEDINGMET IKSLTSESARYQNIDSEFVDYLEKNFKLHKYSAIQTALKSGAKLILNVVILWYGSRLVMDNKISVGQLITFNALLSYFSN PIENIINLQSKLQSARVANTRLNEVYLVESEFEKDGDLSENSFLDGDISFENLSYKYGFGRDTLSDINLSIKKGSKVSLV GASGSGKTTLAKLIVNFYEPNKGIVRINGNDLKVIDKTALRRHISYLPQQAYVFSGSIMDNLVLGAKEGTSQEDIIRACE IAEIRSDIEQMPQGYQTELSDGAGISGGQKQRIALARALLTQAPVLILDEATSSLDILTEKKIISNLLQMTEKTIIFVAH RLSISQRTDEVIVMDQGKIVEQGTHKELLAKQGFYYNLFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 4e-127 | 41 |