Name : plnG (lp_0423) Accession : YP_004888443.1 Strain : Lactobacillus plantarum WCFS1 Genome accession: NC_004567 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin ABC-transporter, ATP-binding and permease protein PlnG Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 376436 - 378586 bp Length : 2151 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCATTGGAGAAACTATGTTGCGCAAGTTGACGAGATGGACTGTGGGGTCGCAGCTTTAGCAATGATTTTGAAAAATTA TGGTTCGACAACATCATTGGCCTATCTAAGAAATATTGCTAAAACGAGTTTAGAAGGGACTACGGCATTAGGATTAGTAA AAACGGCCGAAAAGTTAGGTTTTGAAACCAAAGCAATTCAAGCAGATATGAGTCTTTTCGAGGTACAAGATTTACCATTG CCATTCATTGTGCATGTTACCAAAAATGGGGATCTACAGCATTTTTATGTCGTTGTAAAAACCTCGAAAACGCATGTCGT GATTGCTGATCCGGACCCAACAGTTGCGGTTATCAGTATGTCAAAGGAACGGTTTGAAAGCGAATGGTCCGGAGTTGCCC TTTTCTTTGCACCGAAGTCGGAATATAAGCCAGTTAAGCAAGATAAGGGCTCACTATGGGGATTTATTCCAAGCTTATTA AAGCAGCGCCGACTGGTTATTAATATTGTGCTTGCTGCAGTTTTAATCACGATTATTAGTATCTGTGGGTCTTATTTCTT ACAAGCGGTGATTGATACTTATATTCCCAATAATATGCACAGTACATTGGCAGTGGTGGCCATTGGTCTAATCGTTTTTT ATACCTTTCAGGCTATCTTTACTTATGCCCAGAATTTTTTATTGGCGGTTTTAGGTCAACGACTTTCGATTGAAATTATT TTAGGCTATATTCGGCACGTCTTTGAATTGCCAATGAGTTTTTTTGCCACTCGGCGGACGGGGGAAATTGTTTCGAGGTT TACGGATGCCAGTAAGATTATTGATGCGTTAGCTAGCACAATTGTTTCGCTGTTTTTAGATGTCAGCATCGTTATTATTA TGGGGGCAATCTTGGTAATCCAGAATATGACACTTTTTTGGATTACGTTACTCTCGTTGCCAATCTACGCGGTTGTCATC TTAGCCTTTAATAAATCCTTTGAACGATTGAATCAAAAGGAAATGGAGAGCAATGCTATTTTGAGTTCAGCCATTATTGA GGATCTTCATGGGATTGAAACTGTTAAGGCGCTGAATGGTGAGACGGAACGTTATCAGAAAATTGATTCAGAATTTGTTG ATTATCTACGTAAGAGTTTAGCCTATCTTAAAGCGGATACTTTGCAACAGGCATTAAAACTGTTTATACAGTTAGTCTTA GAAGTTGTTGTTCTATGGGTGGGCGCCAATCTCGTCATTCATAATCAGTTATCAGTTGGGGAGCTCATGACATATAATGC TTTATTAGCCTATTTTGTTAATCCACTACAGAATATTATTAATTTGCAGACTAAGCTTCAAAGCGCTAAGGTCGCTAACA ACCGGTTAAATGAAGTGTATTTGGTCGCTAGTGAATTTGAGGCGTCACGGCCAATTCATAATGAAAGTCAATTAAATGGT GATATTAAGTTACAAGGGGTCAGCTATCGTTATGGTTACGGTGAAAATGTCTTAGATGATGTTAATTTGACGATTCGACA ACATGATAAGGTTGCAATTGTGGGGATGAGTGGCTCTGGCAAGTCCACGTTAGTTAAATTGCTTATTGATTTTTATCAAC CAAATAGTGGTGATGTCATATTGAATGGCTTCAACGTTAAGAACATCGATAAGCATACATTGCGGACCCATATTAACTAC ATCCCGCAGGAACCATACATCTTTTCAGCGACCATTGAAGAAAATTTAAGATTAGGTAATCGCAGCGGTATTACTGAGAA AGATATTGCGAAGGCTTGCCAATTGGCGTTAATTGATACGGATATTAATAAAATGGCCATGCAATACCAAACTAAGCTAG ATGAGAATGGTAATACACTATCAGGTGGTCAGCGACAACGATTAACGATTGCGAGAGCGTTATTATCACCCGCTCAAGTC TTGATATTTGATGAGTCGACGAGTGGACTGGATGCAATTACTGAAAAACAATTAATTGATAATTTAGTGGCAATGACTGA CAAGACGATTATTTTTATTGCCCACCGGTTGTCGATTGCAAAGCGGACGAATCATATCATCGTTCTGCATGATGGTCGGG TCGCTGAAGAGGGGACCCATGCGGCATTGTTGAATGAACATGGTTACTATTACGACTTGATCAATAGCTGA Protein sequence : MHWRNYVAQVDEMDCGVAALAMILKNYGSTTSLAYLRNIAKTSLEGTTALGLVKTAEKLGFETKAIQADMSLFEVQDLPL PFIVHVTKNGDLQHFYVVVKTSKTHVVIADPDPTVAVISMSKERFESEWSGVALFFAPKSEYKPVKQDKGSLWGFIPSLL KQRRLVINIVLAAVLITIISICGSYFLQAVIDTYIPNNMHSTLAVVAIGLIVFYTFQAIFTYAQNFLLAVLGQRLSIEII LGYIRHVFELPMSFFATRRTGEIVSRFTDASKIIDALASTIVSLFLDVSIVIIMGAILVIQNMTLFWITLLSLPIYAVVI LAFNKSFERLNQKEMESNAILSSAIIEDLHGIETVKALNGETERYQKIDSEFVDYLRKSLAYLKADTLQQALKLFIQLVL EVVVLWVGANLVIHNQLSVGELMTYNALLAYFVNPLQNIINLQTKLQSAKVANNRLNEVYLVASEFEASRPIHNESQLNG DIKLQGVSYRYGYGENVLDDVNLTIRQHDKVAIVGMSGSGKSTLVKLLIDFYQPNSGDVILNGFNVKNIDKHTLRTHINY IPQEPYIFSATIEENLRLGNRSGITEKDIAKACQLALIDTDINKMAMQYQTKLDENGNTLSGGQRQRLTIARALLSPAQV LIFDESTSGLDAITEKQLIDNLVAMTDKTIIFIAHRLSIAKRTNHIIVLHDGRVAEEGTHAALLNEHGYYYDLINS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 5e-130 | 41 |