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Name : lysS (Bfl262) Accession : NP_878559.1 Strain : Candidatus Blochmannia floridanus Genome accession: NC_005061 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 280221 - 281678 bp Length : 1458 bp Strand : + Note : COG caterory=J DNA sequence : ATGAGTAAATTTGAAAAAGAACAAATTGCTTTTCCTAATGATTTTCGGCGTAATTATATTTCTGATCAATTACATCAAAA ATATGATCATAAAACTAATACAGAATTGATTCATCTTAATGTAAAAGTTAGTGTCGCAGGTCGTATAATGACTCGTCGGA TTATGGGAAAATCATCTTTTATGACATTACGTGATGGAGGAGGTTGTATTCAGTTATATTTTACTATTCATGATATGAAA TCACAGACGATGTATTTTAAGGTTATAAAAACATGGGATATAGGAGATTTAATTGGAGTGAAAGGAGTATTATTTAAAAC TCGTACTGGAGAATTATCAATACATTGCAAGGAAATGGTTTTATTAACTAAATCGTTGAGATCATTACCAGATAAATTTC ATGGATTACGTAATATAGAAACGAAATATCGTCAAAGGTATTTAGATTTAATAGTTAATGAAGAATCTATGAAAACATTT AAAATACGTTCTTTAATTATATCTGAAATACGTCGTTTTATGCATCAACATCATTTTATAGAAGTAGAAACTCCTATGAT GCATCATATTCCTGGAGGTGCATTAGCTCGACCTTTTGTTACATATCATAATAAATTAAACATGAATATGTATCTTCGTA TTGCTCCAGAATTATATTTAAAAAAATTAATAATTGGAGGTTTTGAAAAAATATTTGAAATAAATCGTAATTTTCGTAAT GAAAGTATATCTCCATATCATAATCCTGAATTTACTATGATGGAAATTTATGAAGCGTATGTTGATTATAATAATATGAT AATTTTTGTTCAGGAATTATTTCGAACATTAACAGAACGGATTCTCAGGAAGAGTGTTATTGAATATGGTGATTATAGTT TAGATTTTGAAAAACCTTTTATTAAAATGAGTATAAAAGAAGCTATTATGTATTATTTACCAGATATTCGAACAAAAAAT ATCGATGATATATTAGTTGTTTTTGATATCTTAAAATTTTTTAAAGTACCCAGTGATAATCAATGGACATTAGAAAAGTT GCATATGGTTCTTTTTGAAGAGATAGTATCAAAAAAAATTATTCAACCAACTTGTATTACTCATTATCCAATAGAAGTAT CCCCATTAGCTCGTTGCAGTAATGATAATGCAAAAATTGCTGATCGATTTGAGTTATTTATTGCTGGTCATGAAATAGGA AATGGATTTTCGGAGTTAAATGATCCGGATGATCAACGTAATCGATTTTTAAAGCAAGCAACAGAAAAAATGATTAATAA TGATATTGATCAAGATGAATCAAATATGCCTTATGATAAGGATTATATAGTTGCATTAGAGTATGGTTTACCGCCAACAG CAGGTGTCGGTATAGGTATTGATCGTTTAGTAATGTTGTTAACTAATAAACATAATATTCGGGATGTAATTTTATTTCCA ACTTTACGATCAAAGTAA Protein sequence : MSKFEKEQIAFPNDFRRNYISDQLHQKYDHKTNTELIHLNVKVSVAGRIMTRRIMGKSSFMTLRDGGGCIQLYFTIHDMK SQTMYFKVIKTWDIGDLIGVKGVLFKTRTGELSIHCKEMVLLTKSLRSLPDKFHGLRNIETKYRQRYLDLIVNEESMKTF KIRSLIISEIRRFMHQHHFIEVETPMMHHIPGGALARPFVTYHNKLNMNMYLRIAPELYLKKLIIGGFEKIFEINRNFRN ESISPYHNPEFTMMEIYEAYVDYNNMIIFVQELFRTLTERILRKSVIEYGDYSLDFEKPFIKMSIKEAIMYYLPDIRTKN IDDILVVFDILKFFKVPSDNQWTLEKLHMVLFEEIVSKKIIQPTCITHYPIEVSPLARCSNDNAKIADRFELFIAGHEIG NGFSELNDPDDQRNRFLKQATEKMINNDIDQDESNMPYDKDYIVALEYGLPPTAGVGIGIDRLVMLLTNKHNIRDVILFP TLRSK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 2e-129 | 54 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | NP_878559.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 1e-129 | 54 |
