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Name : LJ0767 (LJ0767) Accession : NP_964620.1 Strain : Lactobacillus johnsonii NCC 533 Genome accession: NC_005362 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lactacin F ABC transporter permease component Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 665125 - 667284 bp Length : 2160 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTATTCAAATATAAATCTGTTTATGTACCTCAAGTAGATGAGATGGATTGCGGAGTTGCTTGTTTAGCGATGATCTT AAAACAATATCATTCTCGTATATCTTTAGCTCATTTACGTCATGAAGCGCGTACTAATCTTGAAGGAACAACTGCTTTAG GGTTAGTTAAAACAGCCCAGAAATTTAATTTAAAAACAGAAGCCGTAAAGGCAGATATGTCTTTATTTAATGATGACGGT ATTCAGTATCCTTTTATTGCTCACGTACTTAAACAGGGAGAATTGCTTCACTATTATGTGGTGCTAAAAAATACTAAAAA TTATTTATTAATTGCCGATCCAGATCCTTCAGTTGGTGTGATAAAAATGCCTAAAGATAGGTTCGCTCAAGAATGGACAG GGATTGCACTCTTTATGGTTCCCAATGAAAACTTTGAACCAATTAAAGAAAAGAAGAATAACCTATGGTCTCTCTTTCCA TATATGTTTAAACAAAAGCGGCTAATGATTAATATCATTCTAGCCGCTTTATTAATGACCATAATTAGTATCTGTAGTTC ATATTTTGTTCAAGGAATAATTGATACTTATATTCCAAGTGGTACTTATCAGACTTTATCAATCTTAGCAGTCGGATTGT TAATTGCTTATGTCTTTAATTCTATCTTCTCCTATGGACAGAATTTTTTGCTAAATGTTTTAGGACAAAGATTAAGTATT GATTTAAATCTTCAATATATTAGACATATTTTTGAATTACCGATGGAATTTTTTGTAACAAGAAGAACGGGTGAAATTAC TTCACGTTTTTCTGATGCAAGTAGAATTATTGATGCTTTGGCAAGTACGGTTATCTCGCTTTTCTTAGATCTATCAATTG TAATCGTAATGGGATTAGTATTAGCGGCTCAGAGTATGACTTTGTTTGGAATCACATTATTGGCTTTACCTATTTATGCA GTTGTAATTCTAGGTTTTACTAAAAAGTTTGAAAAATTAAATAATGAGCAAATGGAAAGTAATGCTGTTTTGAGTTCTTC AGTTATTGAAGACATTCAAGGAATTGAAACAATTAAAGCATTAAATAGTGAGAATACAAGGTATAGAAGAATCGATAGTC AGTTTGTAGATTACCTAAAAAAATCTTTTAAATACAGCAAAACTGAGAGCTTGCAGACAGCACTCAAGACATTTATTCAA TTATCTCTTAATGTAATTATTCTTTGGGTTGGTGCAAAAGTTGTAATGCAAGGACAATTGAGCATTGGTCAGTTGATGAC TTTTAATGCGTTGCTGGCATATTTTATTGATCCACTGCAAAATATTATTAATCTGCAACCGCGACTTCAATCAGCTAGTG TTGCTCAAAATCGATTGAATGAGGTCTATCAAGTAAAAAGTGAATTCAATCAGAAGACTGCTATTGAAGATTGTAAGCTC CTAGAAGGAAATATTGAATATAAGAATGTGGATTATCGCTATGGTTATGGTGCAGATGTCTTAAAAGATATTAATCTAAA AATTAACCAGGGCGAAAAATTAACGATTGTTGGAATGAGTGGATCTGGAAAATCAACAATGGTTAAGTTGTTAGTAGATT TCTTTTCGCCAAGTAAGGGTCAAGTCATTTTAAATGGCCATGCAACAAGTGAGATTAATAAGCATAGCTTGCGATCATAT GTGAATTATGTACCTCAAACCCCATATATCTTTTCTGGAACAGTTAGAGAGAATTTGTTGTTAGGTTGTAGGCCAGATAT CACTGAAGAAGATGTAATAGAGGCTTGTCAGATTGCTGAGATTGACCAAGAAATAGCTAATCTACCTTTGCAATTTGAAA CAAAATTAGATGAAAATGCAAAAATTCTATCTGGTGGACAAAAACAAAGGTTAACAATTGCTCGGGCATTATTATCTCCT GCAAAGGTATTTATCTTTGATGAAGTAACAAGTGGCTTAGATACAATTACTGAGAAGAGAGTAATTGATAATTTGATGAA GCTCAAAGATAAGACAATTATTTTTATCGCACACCGTCTGGCAATTGCGGAACGAGCAGATAAGGTTGTTGTAATTGATC GTGGCCAGATAGTTGAAGAAGGCAGTCACAGCGAATTGATGAATATGCATGGCTTTTATTATGACTTAGTGAAGGGATAG Protein sequence : MLFKYKSVYVPQVDEMDCGVACLAMILKQYHSRISLAHLRHEARTNLEGTTALGLVKTAQKFNLKTEAVKADMSLFNDDG IQYPFIAHVLKQGELLHYYVVLKNTKNYLLIADPDPSVGVIKMPKDRFAQEWTGIALFMVPNENFEPIKEKKNNLWSLFP YMFKQKRLMINIILAALLMTIISICSSYFVQGIIDTYIPSGTYQTLSILAVGLLIAYVFNSIFSYGQNFLLNVLGQRLSI DLNLQYIRHIFELPMEFFVTRRTGEITSRFSDASRIIDALASTVISLFLDLSIVIVMGLVLAAQSMTLFGITLLALPIYA VVILGFTKKFEKLNNEQMESNAVLSSSVIEDIQGIETIKALNSENTRYRRIDSQFVDYLKKSFKYSKTESLQTALKTFIQ LSLNVIILWVGAKVVMQGQLSIGQLMTFNALLAYFIDPLQNIINLQPRLQSASVAQNRLNEVYQVKSEFNQKTAIEDCKL LEGNIEYKNVDYRYGYGADVLKDINLKINQGEKLTIVGMSGSGKSTMVKLLVDFFSPSKGQVILNGHATSEINKHSLRSY VNYVPQTPYIFSGTVRENLLLGCRPDITEEDVIEACQIAEIDQEIANLPLQFETKLDENAKILSGGQKQRLTIARALLSP AKVFIFDEVTSGLDTITEKRVIDNLMKLKDKTIIFIAHRLAIAERADKVVVIDRGQIVEEGSHSELMNMHGFYYDLVKG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 6e-124 | 42 |
