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Name : LJ0774 (LJ0774) Accession : NP_964628.1 Strain : Lactobacillus johnsonii NCC 533 Genome accession: NC_005362 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lactacin F ABC transporter permease component Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 670866 - 673025 bp Length : 2160 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTATTCAAATATAAATCTGTTTATGTACCTCAAGTAGATGAGATGGATTGCGGAGTTGCTTGTCTAGCAATGATCTT AAAGCAGTATCAATCTCGTGTGTCTTTAGCACATTTGCGTCACGAAGCTCGCACAAATCTTGAAGGCACAACTGCGCTGG GACTAGTTAAAACAGCACAGAAATTTAATTTTAAAACTGAAGCCGTAAAAGCTGATATGTCTCTTTTTAATGAGGATACT ATTCAATACCCTTTTATCGTGCATGTTCTTAAGCAAGGAGAATTACTTCATTATTACGTAGTTCTTAAAAATACTAAGAA TTACTTAGTAATTGCCGATCCTGATCCATCAGTTGGCATAATAAAGATGCCTAAAGATAAATTTGCTCAAGAATGGACTG GTATTGCGCTTTTTATGGTTCCGAATGAAGATTTTGAACCAATTAAAGAAAAGAAAAATAACCTATGGTCTCTCTTTCCA TATATGTTTAAGCAAAAGCGGCTGATGATTAATATCATTTTAGCCGCTTTATTAATGACAATAATTAGTATTTGTAGTTC ATACTTTGTGCAAGGAATAATCGATACTTATATTCCCGATGGAACTTATCAGACTCTTTCAATTTTAGCTGTTGGACTAT TAATTGCTTATATTTTTAATTCAATCTTTTCTTATGGACAGAATTTTTTATTAAATGTTCTAGGTCAAAGATTAAGTATT GATTTAAACCTCCAATATATAAGGCATATTTTTGAATTGCCAATGGAATTCTTTGTGACTAGAAGAACTGGTGAAATAAC CTCACGTTTCTCTGATGCAAGTAGAATTATTGATGCTCTAGCAAGTACTGTTATTTCACTTTTCTTAGACTTAGCGATTG TAATTGTAATGGGACTAGTGTTAGCTGCTCAAAATACAACATTATTTGGGATCACATTATTAGCTTTACCAGTGTATGCG ATAGTAATTCTAGGATTTACTAAGAAATTTGAAAAATTAAATGATGAACAGATGGAGAGTAATGCAGTACTAAGTTCTTC AGTTATCGAAGATATTCAAGGTATTGAAACTATCAAAGCTCTCAATAGTGAAGATACAAGATATCGCAGAATCGATAGTC AATTTGTAAACTATTTAAAGAAGTCATTTAAATATAGTAAGACTGAGAGTTTGCAGACGGCCTTAAAGACATTTATTCAA CTATCTCTTAATGTAATTATTTTATGGGTTGGAGCAAGAGTAGTGATGCAAGGAGAGATGAGTATTGGTCAATTAATGAC TTTTAATGCATTACTATCTTATTTCATTGACCCACTTCAAAATATTATTAACTTACAACCTCGGCTTCAATCTGCGAGTG TTGCACAAAATAGATTGAACGAGGTTTATCAGGTGCAAAGTGAATTTAATGCAGATACTTCTATCCAGAACTCAGCTGCT TTAGAAGGAATGATTGAATACAAGCATGTTGATTATCGATATGGTTATGGTACTGATGTTTTAAAAGATATTAATCTAAA AATTAAGCCAGATGAAAAATTAGCAATTGTTGGGATGAGTGGATCAGGAAAATCGACGATGGTTAAGTTACTCGTTGATT TCTTTTCACCAAGTAAGGGAGAAGTAACTTTAAATGGTCATGCAACTAGTGAAGTTAATAAACATACCTTACGCTCGTAT GTTAACTATGTTCCTCAAACGCCATATATCTTTTCTGGAACAGTTAAGGAGAATTTATTACTGGGATGTAGAGCTGATAT TAGCGAAGAAGAGGTAATTAAAGCCTGTCAGATTGCTGGCATTGATCAGGAGATAGCTAATTTGCCCCTACAATTTGAGA CAAAGTTAGATGAGAATGCGAAGATTTTATCAGGTGGACAAAAGCAGAGATTAACTATTGCTAGAGCATTACTTTCGCCA GCAAAAGTTTTTATCTTTGATGAAGTAACAAGTGGTTTAGATACAATTACAGAAAAAAGAGTAGTTGACAATCTTATGAA ACTAAAAGACAAGACAATCATTTTTATTGCACACCGTCTAGCCATTGCGGAACGTGCAGATAAGGTCGTTGTAATTGACA AGGGGCAGATTGTTGAAGAAGGAAGTCATGAAGAGCTTATGGAGCAACATGGTTTTTATTATGACTTAGTAAAGGGATAG Protein sequence : MLFKYKSVYVPQVDEMDCGVACLAMILKQYQSRVSLAHLRHEARTNLEGTTALGLVKTAQKFNFKTEAVKADMSLFNEDT IQYPFIVHVLKQGELLHYYVVLKNTKNYLVIADPDPSVGIIKMPKDKFAQEWTGIALFMVPNEDFEPIKEKKNNLWSLFP YMFKQKRLMINIILAALLMTIISICSSYFVQGIIDTYIPDGTYQTLSILAVGLLIAYIFNSIFSYGQNFLLNVLGQRLSI DLNLQYIRHIFELPMEFFVTRRTGEITSRFSDASRIIDALASTVISLFLDLAIVIVMGLVLAAQNTTLFGITLLALPVYA IVILGFTKKFEKLNDEQMESNAVLSSSVIEDIQGIETIKALNSEDTRYRRIDSQFVNYLKKSFKYSKTESLQTALKTFIQ LSLNVIILWVGARVVMQGEMSIGQLMTFNALLSYFIDPLQNIINLQPRLQSASVAQNRLNEVYQVQSEFNADTSIQNSAA LEGMIEYKHVDYRYGYGTDVLKDINLKIKPDEKLAIVGMSGSGKSTMVKLLVDFFSPSKGEVTLNGHATSEVNKHTLRSY VNYVPQTPYIFSGTVKENLLLGCRADISEEEVIKACQIAGIDQEIANLPLQFETKLDENAKILSGGQKQRLTIARALLSP AKVFIFDEVTSGLDTITEKRVVDNLMKLKDKTIIFIAHRLAIAERADKVVVIDKGQIVEEGSHEELMEQHGFYYDLVKG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 2e-123 | 41 |
