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Name : cycK (BQ03950) Accession : YP_032075.1 Strain : Bartonella quintana Toulouse Genome accession: NC_005955 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein cycK Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 486081 - 488069 bp Length : 1989 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGCTTGTTGAACTGGGTCATATTTTTTTAGCCGCAGCGTTTGCAGTGAGTTTAATGCAGGCATTTTTACCTGCTTTGGG TGTTTGGTGGGAGGATCATTCATTGATGCGAACAGCAGTTCCCTTCACCTATATTACTTTTACATTATTGCTCTTATCTT TTTTGATTATTGTTCATGCCCATATGGTATCTGATTTTTCTGTTTTAAATGTTGTTGAGAATAGCCATTCTGAAAAACCA ATGCTTTATAAGATCACTGGTGTTTGGGGAAATCACGAAGGATCCATGTTGTTATGGGTTTTAAGTCTTGCTTTTTTCAG TACATTGATGGCATTATTTAGCCAACATTTACCAGAACAGTTTAAGACATTAATTTTGGTTTGCCAAAGTTGGATTATAA GTGCCTTTCTTGTATTTGTTCTTTTTTTATCGAATCCATTTTTACGTATTAATCCACCGGCATTGCAGGGAAATGATCTC AATCCTCTTTTGCAAGATATCGCTTTAGCAATTCATCCACCACTTCTTTATTTAGGCTCTGTCGGTTTTTCTCTTTGTTT TTCTTTTGCAGTAGCTGCATTGGTTATGGGACATGTCGATGGGCGTTGGGCGCATTGGGTTCGTCCTTGGCTTCTTCTTG CTTGGTGTTTTTTGACACTAGGCATTATGGTTGGGTCCTATTGGGCTTATTATGAGTTAGGATGGGGTGGTTATTGGTTT TGGGATCCAGTTGAAAATGCTTCGTTTATGCCCTGGCTTTCAGGAACAGCTTTTTTGCATTCTGCTCTTGTTCTGGAAAA GCGGGAAACATTAAAAAGTTGGACTTTATTTTTGGCACTTCTTACTTTTTCTCTTTCTCTTATGGGAACTTTTCTTGTTC GTTCAGGTCTTTTAGTATCTGTTCACAGTTTTGCCATTGATCCAGCACGTGGGCGGGCAATTCTTGCACTTTTATTCTTT TTCACCGGAGGAGCTTTTTTTCTCTTTGCTTTGCGCGTACCCGTTTTAAAAGCAGGTAGATTATTTCGGCCAATTTCACG TGAAGGTTTTATTGTTTTAAATAATCTCTTGCTTACAACAATAACAGCGACAGTATTGATTGGTACGCTCTATCCTTATT TTATTGAGGCATTGACTGGAAAAAAAATTTCTGTAGGTGCCGCTTTTTTTAACATTACCTGTGGTCCTTTAATGATATTA TTGTTGTTGTTGGTTCCGTTTGGATCAATGATGGTATGGAAAAGCGGTGATTTTCTTGCGGTTTTTGAACGGTTGTGGTT TGTTTGCGTATTAGCCTGTGTAGCCTGTTTTATAACGTTTTATGCAACATCTTTGCGTGATATTTTTGCAGCTTTAGGAG TAGGACTTTCAGTTTTTGTTTTTTTAGGCAGTTTAGCTGATCTTTGGAAGAAAAGTGGACATCACAAGTTAGCTTTGTCG GTGCGGTTTAAGAGATTTATTGGATTGCCATGGTCAGTTTTTGGTGCAGCAATGGCACATATGGGATTAGCTGTTACATT GTTTGGTATTGTCTGTGTTGCGACTTTTGCTCAAGAGCGTATTTTAACCATGCACATAGGAGATAGGGTTACAATAGCGG GTAAAACTATTTGCTTTGACAAAGTGCATGAAAGCGCCGGTCCGAATTATTCTGCAATGGAGTTTAATTTTACAGTCTAT GAAAACAAACATGCAGTCCGCAACGTAATAGCATCAAAACGTTTCTATTCAAGCCAGAACATATCAACAACAGAAGTTGG TATTCAAAATCATGGCTTATTATCCCAATTATATATTGCACCGGGCCATATAGATGATCAAGGGCTTGTTGTGCATCTAT GGTGGAAGCCTTACGTGATTTGTGTATGGTTAGGGGCAATAATGATGGCTATGGGGGGGTGTTTTTCTCTTTTTGGTTAT TGGTTTCGCATTGGGTTGCATCGACGGATAGCTTCCCGCTTCAAGTTTTCTGAAAAGGCTTTGAGATGA Protein sequence : MLVELGHIFLAAAFAVSLMQAFLPALGVWWEDHSLMRTAVPFTYITFTLLLLSFLIIVHAHMVSDFSVLNVVENSHSEKP MLYKITGVWGNHEGSMLLWVLSLAFFSTLMALFSQHLPEQFKTLILVCQSWIISAFLVFVLFLSNPFLRINPPALQGNDL NPLLQDIALAIHPPLLYLGSVGFSLCFSFAVAALVMGHVDGRWAHWVRPWLLLAWCFLTLGIMVGSYWAYYELGWGGYWF WDPVENASFMPWLSGTAFLHSALVLEKRETLKSWTLFLALLTFSLSLMGTFLVRSGLLVSVHSFAIDPARGRAILALLFF FTGGAFFLFALRVPVLKAGRLFRPISREGFIVLNNLLLTTITATVLIGTLYPYFIEALTGKKISVGAAFFNITCGPLMIL LLLLVPFGSMMVWKSGDFLAVFERLWFVCVLACVACFITFYATSLRDIFAALGVGLSVFVFLGSLADLWKKSGHHKLALS VRFKRFIGLPWSVFGAAMAHMGLAVTLFGIVCVATFAQERILTMHIGDRVTIAGKTICFDKVHESAGPNYSAMEFNFTVY ENKHAVRNVIASKRFYSSQNISTTEVGIQNHGLLSQLYIAPGHIDDQGLVVHLWWKPYVICVWLGAIMMAMGGCFSLFGY WFRIGLHRRIASRFKFSEKALR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-81 | 41 |
