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Name : YPTB2668 (YPTB2668) Accession : YP_071178.1 Strain : Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 Genome accession: NC_006155 Putative virulence/resistance : Unknown Product : outer membrane fimbrial usher porin Function : - COG functional category : N : Cell motility COG ID : COG3188 EC number : - Position : 3149957 - 3152668 bp Length : 2712 bp Strand : - Note : similar to Xylella fastidiosa XF0081 outer membrane usher protein precursor (33.8% evalue=1.E-137); Pseudomonas aeruginosa PA4084 probable fimbrial biogenesis usher protein (35.2% evalue=1.E-131) DNA sequence : GTGATAAGTCGTCTGATATTAAAAAAGGGAGCTTTGCTAGTGAACCGTACAGATATAGCGTGCTACATAGAAAATAATAT CGGCAAATTAAATTATTTACCCTACAAAGCTTCATTGAGCGTTGCGGTTATTTTTATAGGCTCTGTTTTACTCGTAACTA AGAGTATCTCTGCCGTACCAATGTCTCAGGATACAAATGAGAGCGCAGCAGTGATACCCGTTGAGTTTAACGCCGACTTT ATTCACGGTGGTGGGGTCGATGTCATGCGATTTATGCATGAAAACCCTGTTGCACCAGGAGTATACGATGTCACCGTCAT CATTAATGGCAAAAATCGCGGTAAACACCGTATCCGCTTTGAATTAAGCGAAGGGGAATCTACCGCAGAACCTTGTTTTA CCCTGGAACAGCTTGATTCTATTGGCCTGAAAATTGAAACAAGCGATACAGATTTATTAGTAAACGGAAAAGCAGCACCC AAAGATCAGTGTTACAACTTAAGGGCATTGATTAAAGACAGCCATGTTAACTATAACTCCGGTGATCTTGAACTTTCACT CACCGTACCGCAGTTTAATTTGGTGCATCATCCGCGTGGGTATATTGATTCCAGTTTGTGGGATGCGGGTGGGACAGTTG GTTTTCTGGATTACAACAGTAATGTTTATAGCATCTTTAATGGCCGCTCTAGCAGCGATGTAGGTTCAGATAACTCAAAT AGCTACAACAGTAATATTGGGCTATCAGCCGGTATTAATCTTGGTGAGTGGCGGTTCAGGAAGCGTCTTAATACTACCTG GTCGAATAGCAGTGGTATGCACACTCAGAATCTGTATGGGTATGCCGCGACAGATATTACCGCGTTAAAAAGTCAATTAA CGATTGGGGATACCAATACCCAAGGGAGTTTATTCGACAGTTATGCATTACGTGGTGTGCTATTGGCATCAGATACTCGG ATGTTGCCGGAGGGAATACGTAATTACTCTCCTATCGTCAGAGGGATAGCTGAGACAAATGCCAGAGTGACGGTGACGCA GCGCGGGCAAATTATTTATGAAACGGTGGTCACACCGGGAGCCTTTGAACTGACCGATATCGGCACGATGTCGTACGGCG GTGATTTACAAATGACGATCACGGAGTCTGATGGCCGAACGCGTATCCAAAGGATCCCGTTTTCAGCTCCCCCGATGTTG CTTTACCAAGGGGTGTCCCGGTTCGATTTTTCGGCAGGTCAACTGAATGACAGTTCGATAAACCATAATCCGGCGATTGT CCAAGGGGCATACCATTATGGTTTGGGAAATACGTATACCCTCTATGGTGGGGCACAGGTTGCTGAGAATTATCGTTCGG TTGCGATAGGTAACGCGTTCAATACCCCGTTGGGAGGGGTATCGATGGATATCACACATGCTAAAAGTGAATTAGCGGGT GATCGTCGCTCCAGCGGTAATAGCTATAAAATTGATTACTCCAAATACGTAGGAGAAACCGATACCAACCTGACATTGGC CGCCTATAGATACTCTTCCGGTGGGTATTACAGTTTTAGGGAAGCCAGTCTGGATCGTTATGGGAACAGTAATGGGATTG ATGAAATTGACTTTCGTACCCGTAATCGGTTGTCACTCAGTGTCTCCCAACGCGTAGCGGATAATATGTCAGTTAACCTG AACAGCAGCCTTTATAGCTACTGGGGCAATCAGGATGCATCACAACAATATTCGGTGGGTTTTAATCATTCACTGCGCTT TTTCTCTTATACGGTGAGTGCGATACGCACCAGTAATAGCAGTAATAGCAGTAATGGCGACAATGATCGGGAATATGAAA ATAGTTATATGCTCGCGGTCAGCATACCTATTGGCGGGAGTGGGAAGAATAAACCGCTGTTTAGTTCGCTCTCGACCATG GTTAGCCACAGTGAAGCAGGTGATACACAGTTACAGCTGACTACGAGTGGTAGCCGGGGAGATCAGAACGAGTTGACCTA TGGAATAGGTACGTCATATGGCAACCGTAATGACGCGTCTTCTGAGCAATCAGTGATAGGGAATATGGGTTATCAGTCAT CGGTTGGCCAATTGGGTATGACAGCGTCAGCCAATAATAACGCATCGCGACAGCTTTCTGTTTCGGCAAGCGGCAGCCTG GTGGCTCATCAGGGCGGCGTGATAGCGGGCCCACGACTTGGCGATGCGCCTTTTGCCATCATCAATGCTCAGGGTGCCGG AGGGGCTAAAGTGTTTAATGGCCGCGGTGCAAAGATTGATAGTAATGGATATGCGCTGGTGCCATCACTGACACCGTATC GGGAAAATACCATTGCGATTGATTATAAAGACTTGCCTGAGACAGTCGATATTCTGGAGAACCATAAAGTGGTGGTACCC AGAATGGGCGCGATGATCCCAGTCAAGATGAAAACTATGACAGGTAATCCGATGATGCTTATTGTCAGGGATGAAAATAA AGAGTTTCTTCCTATCGGCACTGATTTATTGGATGCGGATGGGGTGAGTCAAAGTATTGTTGGGCAAGGTGGAATGGCAT TTATTCGTGGATGGGATCCTGTATCGCAACCAATTACAGCAACCTTAAATGGCGGCATAGATAAATGTGTCATTAAACCT GATGCGAAAATCGATACTGCTACAAAGACAGTGCAAATAATACAGTTGGAGGTGATATGTCTTCGTCGCTAA Protein sequence : MISRLILKKGALLVNRTDIACYIENNIGKLNYLPYKASLSVAVIFIGSVLLVTKSISAVPMSQDTNESAAVIPVEFNADF IHGGGVDVMRFMHENPVAPGVYDVTVIINGKNRGKHRIRFELSEGESTAEPCFTLEQLDSIGLKIETSDTDLLVNGKAAP KDQCYNLRALIKDSHVNYNSGDLELSLTVPQFNLVHHPRGYIDSSLWDAGGTVGFLDYNSNVYSIFNGRSSSDVGSDNSN SYNSNIGLSAGINLGEWRFRKRLNTTWSNSSGMHTQNLYGYAATDITALKSQLTIGDTNTQGSLFDSYALRGVLLASDTR MLPEGIRNYSPIVRGIAETNARVTVTQRGQIIYETVVTPGAFELTDIGTMSYGGDLQMTITESDGRTRIQRIPFSAPPML LYQGVSRFDFSAGQLNDSSINHNPAIVQGAYHYGLGNTYTLYGGAQVAENYRSVAIGNAFNTPLGGVSMDITHAKSELAG DRRSSGNSYKIDYSKYVGETDTNLTLAAYRYSSGGYYSFREASLDRYGNSNGIDEIDFRTRNRLSLSVSQRVADNMSVNL NSSLYSYWGNQDASQQYSVGFNHSLRFFSYTVSAIRTSNSSNSSNGDNDREYENSYMLAVSIPIGGSGKNKPLFSSLSTM VSHSEAGDTQLQLTTSGSRGDQNELTYGIGTSYGNRNDASSEQSVIGNMGYQSSVGQLGMTASANNNASRQLSVSASGSL VAHQGGVIAGPRLGDAPFAIINAQGAGGAKVFNGRGAKIDSNGYALVPSLTPYRENTIAIDYKDLPETVDILENHKVVVP RMGAMIPVKMKTMTGNPMMLIVRDENKEFLPIGTDLLDADGVSQSIVGQGGMAFIRGWDPVSQPITATLNGGIDKCVIKP DAKIDTATKTVQIIQLEVICLRR |
