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Name : citT (MS1378) Accession : YP_088570.1 Strain : Mannheimia succiniciproducens MBEL55E Genome accession: NC_006300 Putative virulence/resistance : Unknown Product : CitT protein Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0471 EC number : - Position : 1384549 - 1385940 bp Length : 1392 bp Strand : + Note : Di- and tricarboxylate transporters DNA sequence : ATGAGTACGGATACGCAAGAAAACGAATCAAGTAAAAACCGCCGCAATATGATTATTCTTATTGCAGATATTGGGTTATT TTTTATTTTATTAAATGTTCTCCCCTTTGATGAAGCGCCAAGAAAAGGACTTTCCCTGTTAGCTTTTGTTGCTGTTCTTT GGCTCACCGAAGCCTTACACGTTACCATCACCGCTCTTTTTGTTCCTATTTTAACTATCGGCTTGGGATTGTTCTCCACC AAAGAAGCGTTAGTGGCTTTCGCCGACCCTACCATCTTTCTGTTTTTCGGTGGATTTGCCTTAGCCGCTGCGTTACACAT TCAAAAAATTGATCGCTTGATCGCCAATAAAATTATGACGATGGCAAAAGGCAATCTGTGCGTCGCCGTCTTATTTTTAT TCTTTGCTACCGCTTTTTTATCTATGTGGATGAGCAATACCGCCACTGCCGCCATGATGATTCCGCTCGCCATGGGGATT ATGAGTAATATGGACAGAGAAAAAGAGCATAACACTTATGTGTTCGTGCTATTAGGTATTGCTTACAGTGCAAGTATCGG CGGTATGGGAACCTTAGTCGGCAGTCCGCCGAATGCGATTGCCGCCTCACAAGTAAATTTAACTTTTGCAGACTGGGTAA AATACGGCGTACCGGTCATGTTATTGCTGTTCCCGATTGTGATCGGCTTGCTTTACTTTAATTTCAGACCGAAATTTAAT CAAACCTTTGATTACCAATTCGAGCAAATCCAATTAACTACTCCGCGAATTATCACCCTGAGTATTTTCGTTCTTGTCGC CTTATTATGGGTTTTAGGATCGGAAATTAACCCTTACATAGCAAGCTTGCTAGGATTAGGCGGTAAAATTGCAAGCTTTG ACAGTATCGTCGGCGTTTCTGCCGCATTATTACTTTGTATCTGCCGGGTTGTGAACTGGGAACAAATTCAGCATCACACC GAATGGGGCGTATTATATCTCTTCGGCGGCGGTTTGACCCTAAGCGCCGTATTAACCCATACCGGTGCGAGTAAAATTAT GGCGGACGGCATTGTCGCCATTATTGAAGGCAAACATTACTACATTATCTGCTTAATTATCGCCTCCTTTATCGTGTTAC TCACGGAATTCACTTCAAATACCGCCAGTGCGGCGTTATTAGTACCGATTTTTATTTCCATTGCCGAATCACTCAATATG TCGCCGCTCGGTTTTGCATTAATTATCGGTTTGGGCGCTTCCTGCGCCTTTATGATGCCGGTGGGGACGCCGCCGAATGC CATTGTGTTCAGTACCGGAATGGTCAAACAGCGCGATATGTTGCGGTCATATAAAATAAACCTAAGCTGTATCATTATCG TTTCGGCTATCGGTTATTTATTCTGGCTGTAA Protein sequence : MSTDTQENESSKNRRNMIILIADIGLFFILLNVLPFDEAPRKGLSLLAFVAVLWLTEALHVTITALFVPILTIGLGLFST KEALVAFADPTIFLFFGGFALAAALHIQKIDRLIANKIMTMAKGNLCVAVLFLFFATAFLSMWMSNTATAAMMIPLAMGI MSNMDREKEHNTYVFVLLGIAYSASIGGMGTLVGSPPNAIAASQVNLTFADWVKYGVPVMLLLFPIVIGLLYFNFRPKFN QTFDYQFEQIQLTTPRIITLSIFVLVALLWVLGSEINPYIASLLGLGGKIASFDSIVGVSAALLLCICRVVNWEQIQHHT EWGVLYLFGGGLTLSAVLTHTGASKIMADGIVAIIEGKHYYIICLIIASFIVLLTEFTSNTASAALLVPIFISIAESLNM SPLGFALIIGLGASCAFMMPVGTPPNAIVFSTGMVKQRDMLRSYKINLSCIIIVSAIGYLFWL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf77 | AAO17231.1 | Orf77 | Not tested | tcd island | Protein | 5e-105 | 57 |
