Gene Information

Name : citT (MS1915)
Accession : YP_089107.1
Strain : Mannheimia succiniciproducens MBEL55E
Genome accession: NC_006300
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : CitT protein
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 1894457 - 1895869 bp
Length : 1413 bp
Strand : -
Note : Di- and tricarboxylate transporters

DNA sequence :
TTGAGGGTAAACTTTATGAATACGCAAACTTCCGTTTCTCCACCGTCCATCTTCTCTAGAAATTCGCTGATTTTTATGGC
GGATGTGATTATTTTTGCATTGTTATTAGCCTTTCTTCCTTTTGAGCAAAATGTGAATAAAGGTTTGGCGTTACTTGTAT
TTGTGGGTGTGTTATGGCTGACCGAAGCTTTAAACGTTACCGTAACCGCCGTATTAGTGCCGTTACTCGCCATTGGTTTA
GGCTTAGTCACCACTAAAAATGCCTTAGTGGCATTTGCGGATCCGACTATTTTCCTGTTTTTCGGCGGTTTTGCTTTGGC
AACGGCATTACACATCCAAAAATTGGATCGTTTAATTGCTAATCGTATTATGGCTTTGGCAAAAGGGAATTTATTCATTG
CCGTGCTGTATTTGTTTAGTGTGACCGCATTTTTGTCAATGTGGATTAGCAATACGGCGACGGCTGCAATGATGTTACCG
TTAGCAATGGGAATTTTAAGCCAATTGGATCGTGAGCGAGAGCATAATACCTATACTTTTGTTCTGTTAGGTATTGCTTA
TAGCGCGAGTATCGGCGGTATGGGGACATTGGTAGGCAGTCCGCCTAATGCAATTGTCGCCTCTCAGTTGCACCTGACTT
TCTCCGATTGGTTATGGTACGGTATGCCGGTTATGATCATATTAATGCCTTTGATGATCGGTTGTATGTATGTTATTTTC
AAACCAAGACTGAATATACGTTTTACTCAGGATTTTGAAAAAATAGAGATGACAACCCCTAGAATTATTACTTTGCTTAT
CTTTATTTTAACCGCCGTTTTATGGGTGTTCAGTTCCTCCGTAAATCCGATGCTTTCAGGTTTGTTAGGTTTGCCGAAAG
ATATTGCCAGCTTCGATAGCGTGGTTGCATTATTAGCAGCGGCTTTGATTTGTATTTCCGGCGTCGCTTCATGGAAACAG
ATTCAGGATAATACCGAATGGGGCGTGTTGCTGTTGTTTGGCGGCGGCTTGACTTTAAGTGCGGTATTAAAAGATTCCGG
CGCGAGTAAAGTTATGGCTGACGGTATCGTATTCCTTATCCAGGGCGGACATTTTTACGTAATCGGTTTGATTGTTACCG
CCTTTATTGTTTTCTTAACGGAATTTACTTCTAACACCGCAAGCGCCGCCTTATTAGTACCTATTTTTATCTCTATTGCG
CAAGCATTAGGGATGCCGGAGATGGGCTTAGCGTTATTAATCGGTTTAGGTGCATCCTGTGCGTTCATGTTGCCGGTAGC
CACACCGCCGAATGCCATTGTGTTTGGTACAGGTGAGGTTAAACAAAGCGATATGATTCGTGCCGGTGTTGTGCTGAATA
TTCTGTGTATCTTTGTTATCGGTACCATAGGTTATCTATTCTGGTTCGGTTAA

Protein sequence :
MRVNFMNTQTSVSPPSIFSRNSLIFMADVIIFALLLAFLPFEQNVNKGLALLVFVGVLWLTEALNVTVTAVLVPLLAIGL
GLVTTKNALVAFADPTIFLFFGGFALATALHIQKLDRLIANRIMALAKGNLFIAVLYLFSVTAFLSMWISNTATAAMMLP
LAMGILSQLDREREHNTYTFVLLGIAYSASIGGMGTLVGSPPNAIVASQLHLTFSDWLWYGMPVMIILMPLMIGCMYVIF
KPRLNIRFTQDFEKIEMTTPRIITLLIFILTAVLWVFSSSVNPMLSGLLGLPKDIASFDSVVALLAAALICISGVASWKQ
IQDNTEWGVLLLFGGGLTLSAVLKDSGASKVMADGIVFLIQGGHFYVIGLIVTAFIVFLTEFTSNTASAALLVPIFISIA
QALGMPEMGLALLIGLGASCAFMLPVATPPNAIVFGTGEVKQSDMIRAGVVLNILCIFVIGTIGYLFWFG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf77 AAO17231.1 Orf77 Not tested tcd island Protein 1e-86 59