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Name : ccmF (lpl0892) Accession : YP_126251.1 Strain : Legionella pneumophila Lens Genome accession: NC_006369 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1003901 - 1005853 bp Length : 1953 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATAGCGGAATTAGGGCTGTTTTTTTTGATTTTGGCTTTAGTGGCTTCTTTGATGTTAGCTTTGATCCCATTGGCGGG TTTGCAATTCAATCGGAAAGACTGGATTGATTCCTCCAGGAATTATGTCGTACTGCAATTTTTATTTGTTGCATGTGCTT ACCTATGTCTCACGGCCTGTTTTTTGATGGATGATTTTTCGGTGAACTATGTGCTGAATAACTCCAGCTTATTGCTCCCA TGGTTTTATAAATTTTGTGCTGTGTGGGGTGGGCATGAAGGTTCCATGCTGTTATGGGTCGCTATCCTTAGTTTTTGGAT GATCCTGGTTTGTTTTTTTAGCTCAAGCCTTGATACGGAAATGCGCGCTCGGGTATTAGTTATTTTAGGTTGGCTGAGCA TTGGCTTTATTCTTTTTTTGTTAATGACTTCCAATCCTTTCTTGCGCCAATTTCAAGTATTGAATACACAGGGCCGTGAT CTGAATCCATTGCTGCAAGATCCTGGCTTTTTATTCCATCCTCCTATGTTGTACATGGGATATGTAGGGTTTTGTGTCGC TTTTGCTTTTGCTATTGCCGCCTTGTGGGCAGGGAAAGTAGAAACCAGTTGGTCTAAATGGACCAGACCCTGGACTCTGG CTGCCTGGTGTTGTTTAACCGCGGGAATTACTTTAGGCAGTTGGTGGGCTTATAGAGAATTAGGTTGGGGTGGTTGGTGG TTTTGGGATCCTGTAGAAAACGCTTCTTTTATGCCCTGGCTGGTTGGTACGGCACTATTGCATTCTTTGGCAGTTACAGA GCAACGCCAGCAATTTAAAGCGTGGACCATGTTGCTTGCAATCGCTGCTTTTTCTTTAAGTTTAATCGGTACTTTTCTTG TTCGCTCTGGAGTTTTAACTTCAGTCCATGCCTTTGCGGTTGATCCTCAGCGGGGATTATATATTCTGGGATTTTTGTTA TTCGTCATTGGGGGTTCTTTAACATTGTTTCTTTTCAGAGCCCAAACCTTGCAAGTCAATAAACATCCTGGCTTATTATC CCGAGAAAGTGCGTTGTTATTAAATAATGTGTTTTTAGTGGTTATTATGCTGACGGTATTAATGGGCACGGTTTATCCAT TGCTGGTGGAAGGGTTAGGGTTAGGTAAATTATCCGTTGGAGCGCCCTATTTTAATGCGGTATTTGTCCCATTAATGATT CCTTTATTGTTGCTAATGGGGTTAGGTGTCCGTTTGAAATGGCAGAATGATTGTTGGCGGGATGTCTTCAGAAAGCTAAA TCGTATTTTTTTGCTTAGTCTGATATTGCCTGTCATTTTACTATTCTGTACCTCAACTGAAATACACCTTACAGCCCTTT TGGGATTAATTTTGGCATTCTGGGTTTTGTTGAGTACTGTTAATGCGGCGTATCACAAAGTCAGGGATAGAGAGATGGCG GGAGTTGGACAAGCTTATTGGGGGATGGTTTTGGCTCATTGTGGTGTTGCAGCAACAGTGATTGGCATTGCTGTTTCTTC AGCTTATGGCGTACAAGATGATGTACGTATGTCTCCTGGCAAGCAAGTGAATCTGCTGGATTATCAGATTGGATTCATTA ATCAAACTCCGTTGAATGGCCCAAATTACAAAGGGACAAGGGCTGAGTTTTCAATACAATATCAGAATAAAACTAGGCAA ATTTTTCCTGAAAAAAGAGTGTATACCATTGGACAAATGCCAATGACTGAGTCTGCGATTGATGTGACTCCTTTTCGAGA TATTTATATTGCTTTGGGGGAGCCACTGTCTGAGGATGCTTGGTCGGTACGTATTTATTATAAACCGTTGGTCCGCTGGA TTTGGGCTGGCGGATTTATGATTTTAGCCGGAGGTGTTTTGGCATTAACAGATAGAAGGTATTACAGAAAAAGGCAAGTA ACGGTAATGTCAGGGCGGGAGATCAAGATATGA Protein sequence : MIAELGLFFLILALVASLMLALIPLAGLQFNRKDWIDSSRNYVVLQFLFVACAYLCLTACFLMDDFSVNYVLNNSSLLLP WFYKFCAVWGGHEGSMLLWVAILSFWMILVCFFSSSLDTEMRARVLVILGWLSIGFILFLLMTSNPFLRQFQVLNTQGRD LNPLLQDPGFLFHPPMLYMGYVGFCVAFAFAIAALWAGKVETSWSKWTRPWTLAAWCCLTAGITLGSWWAYRELGWGGWW FWDPVENASFMPWLVGTALLHSLAVTEQRQQFKAWTMLLAIAAFSLSLIGTFLVRSGVLTSVHAFAVDPQRGLYILGFLL FVIGGSLTLFLFRAQTLQVNKHPGLLSRESALLLNNVFLVVIMLTVLMGTVYPLLVEGLGLGKLSVGAPYFNAVFVPLMI PLLLLMGLGVRLKWQNDCWRDVFRKLNRIFLLSLILPVILLFCTSTEIHLTALLGLILAFWVLLSTVNAAYHKVRDREMA GVGQAYWGMVLAHCGVAATVIGIAVSSAYGVQDDVRMSPGKQVNLLDYQIGFINQTPLNGPNYKGTRAEFSIQYQNKTRQ IFPEKRVYTIGQMPMTESAIDVTPFRDIYIALGEPLSEDAWSVRIYYKPLVRWIWAGGFMILAGGVLALTDRRYYRKRQV TVMSGREIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 9e-122 | 51 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-113 | 50 |
