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Name : PBPRA0952 (PBPRA0952) Accession : YP_129165.1 Strain : Genome accession: NC_006370 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1050769 - 1052757 bp Length : 1989 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTCCTGAAATAGGGCAATTTGCCCTTATTGTTGCGTTGGGGCTATCAGCTTTGGCCAGCATCTATCCATTGTATGG TGCCTCTATTGGTAATCAGCCAATGATGCGTATGGCACGACCGTTGTCATACGGCGCTTTCGGCATGCTGGTATTGTCGT TTTTTGCCTTGTGCTGGTCTTTCTATACGAATGATTTTACGGTGACGTATGTCGCGAGTAATTCAAACAGCTTATTGCCT TGGTATTACCGAGTTACGGCCGTATGGGGTGGGCACGAAGGTTCCCTTCTATTATGGGTGTTGATTCAAGCTGGTTGGGC TGCAGCTGTTGCGCGCTTTAGCCGCGATATGCCTCTTGAATCTGTGGCGCGTGTTTTGGCTGTTATGGGAATGATTTCAG TGGGTTTCCTTCTGTTTATCATTGTTACCTCTAACCCATTCTTACGTCTACTGCCTTATTTCCCTGTAGATGGTCGCGAT CTTAATCCTCTTCTACAAGACCCAGGTTTGATTATTCACCCGCCTATGCTTTACATGGGATACGTGGGTTTCTCTGTTGC ATTCTCTTTTGCTATTGCTTCATTAATGACTGGTCGTCTTGATACTGCATGGGCTCGTTGGTCTCGTCCTTGGACAATTG CAGCATGGTCATTTTTAACAGTAGGTATCGCGCTAGGTTCGTGGTGGGCTTACTATGAACTTGGTTGGGGTGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAATGCTTCTTTCATGCCTTGGTTGGCAGGTACTGCGTTAATGCACTCATTAGCGGTTACCGA GAAACGTGGCACGTTTAAAGCATGGACCGTTTTATTAGCTATTTCAGCTTTTTCTTTAAGCTTGTTAGGTACGTTCTTAG TTCGTTCAGGTGTTTTAGTCTCGGTTCACGCATTCGCGTCTGATCCGGCTCGTGGCATGTTTATTCTAGGCTTCTTGATC GTTGTTATTGGTGGCTCATTGCTGCTATACGCTTTACGCGGTGGCAAAATCAAATCACGCGGTAGTTACAGTTTATTCTC CCGCGAAAATTTACTGCTTTCCAACAACATCTTGTTAATTGCGGCATTGTTAGTGGTGCTTATTGGTACGTTATTACCGT TAGTTCACAAACAAATAGGGTTAGGTTCCGTCTCTATTGGTGTGCCTTTCTTCAATACCTTGTTTACATGGTTAATGATT CCGTTTGCCTTTCTTTTAGGTATCGGTCCGTTGGTTCGTTGGAAGCGTGACGAAGTCGCTAATGTACGTAAACCAATGCT GATTTCTGGTGCAATAACGTTACCTTTGGCCTTTGCATGTATTGCCATTTTTACTGATTCATTAGAACCAATGGCTGTAC TTGGTTTAACAATGTCTATTTGGATCGTCACAATGCACGGCTTTGAGTTATATCAACGTGCAACGCACCGCCATACCTTC ATGAAGGGTGTAGGTAAGTTGGGTCGCAGCCATTGGGCAATGATATTGGGTCATATGGGTCTAGCGGTATCGGTTATCGG TATAACACTAGTCTCGAATTACGATCTAGAACGTGATGTTCGTTTAGCACCAGGTGAAACAACGCAAGTTCAAGGTTACG ATTTCTACTTTGACGGCTTACGTGATGCCGATGGACCAAACTACGATGGTTACATTGCAGACTTCACTGTTACGCGTAAT GGTAAGTCGGTAACGACATTGCATGCTGAGAAACGCTTCTACAGTACTACTGGGTCAATGATGACTGAAGCGGCTATTGA TAGTGGTGTTACCCGCGACCTGTATGTTGCGATGGGTGAGAAACTGGATGATCACGCTTGGGCTGTGCGTATTTACTACA AACCGTTTATTAATTGGATCTGGTTTGGTGCCGCATTAATGGGGCTTGGTGGTGCAATTGCAATTAGTGATAAACGCTAC CGTTTTCGTAAAAAAGCAAGTGAGAAAACAGGGTCAACAATTAAGCAAGCAGAGGTAACTAATGAATAA Protein sequence : MIPEIGQFALIVALGLSALASIYPLYGASIGNQPMMRMARPLSYGAFGMLVLSFFALCWSFYTNDFTVTYVASNSNSLLP WYYRVTAVWGGHEGSLLLWVLIQAGWAAAVARFSRDMPLESVARVLAVMGMISVGFLLFIIVTSNPFLRLLPYFPVDGRD LNPLLQDPGLIIHPPMLYMGYVGFSVAFSFAIASLMTGRLDTAWARWSRPWTIAAWSFLTVGIALGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASFMPWLAGTALMHSLAVTEKRGTFKAWTVLLAISAFSLSLLGTFLVRSGVLVSVHAFASDPARGMFILGFLI VVIGGSLLLYALRGGKIKSRGSYSLFSRENLLLSNNILLIAALLVVLIGTLLPLVHKQIGLGSVSIGVPFFNTLFTWLMI PFAFLLGIGPLVRWKRDEVANVRKPMLISGAITLPLAFACIAIFTDSLEPMAVLGLTMSIWIVTMHGFELYQRATHRHTF MKGVGKLGRSHWAMILGHMGLAVSVIGITLVSNYDLERDVRLAPGETTQVQGYDFYFDGLRDADGPNYDGYIADFTVTRN GKSVTTLHAEKRFYSTTGSMMTEAAIDSGVTRDLYVAMGEKLDDHAWAVRIYYKPFINWIWFGAALMGLGGAIAISDKRY RFRKKASEKTGSTIKQAEVTNE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 6e-157 | 61 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 9e-140 | 53 |
