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Name : nrfE (VF_1550) Accession : YP_204933.1 Strain : Genome accession: NC_006840 Putative virulence/resistance : Unknown Product : heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : 4.4.1.- Position : 1733089 - 1734975 bp Length : 1887 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGCTGAAATTGGACAGTTTTGGTTAATAACCACTATGGTGTTGTCTGCTGTTGCTTGTGTGACAGCAAGTTACGG TATTTTTAGAAATGAAGACAATTGGGCCGTATCTATTTTCCCACTTTCATTATTAACAGCTCTTTTTTGTATTTTATCCA TATCTGCTTTAGGTTATGGGTTTTATATTGATGACTTTTCTATTCGATATATAGCCGAGCACTCTAATTCTGCATTACCT GTATTTTTTAAAATTGCTGCGATTTGGGGTGGGCATGAAGGTTCATTACTATTTTGGGTATTAACACTCACCTTATGGGT TGGCTTAATTACATTAAAAAGAAAAAGCATTGAGCAATCTTATTTAGTACGTGTTCTTTTAATATTAAATGGATTAATTG TTATCTTTTCAGCCTTTACTTTATTTGCATCTAATCCTTTTATTATTTATGCCAATACGCCTTTAGAAGGACGAGATTTG AATCCAATGTTACAAGATATTGGATTGATATTTCATCCCCCATTGTTATATCTCGGTTATGTTGGTTTTGCTGCTACCTT TTCATTTGCACTCGCTGCATTAATGATGAAAAAAGTGCCATCTCAATGGGTCGGCTATGCGAGAAACTGGACATTGCTTG CTTGGTCATTGCTTACTGCTGGGATCAGTCTTGGCTCATGGTGGGCCTATTATGAGTTAGGTTGGGGTGGATGGTGGTTT TGGGACCCAGTAGAAAACGCTTCTTTGTTGCCTTGGTTAACATCCACCGCATTACTACACACATTAATTGCTAGTCATAA GAGAAAGCTATTACTAAAAGCATCGATTATTTTGGCATTAGTGACTTTTTGTTTGAGTATCTTAGGGACTTTTGTGGTTC GCTCAGGGGTATTAACGTCGGTTCATGCGTTTGCTGTCGATCCAACAAGAGGCATCATATTATTACTAATTTTGTTTATT GTAATGTTGCTCTCTTTTAGCCTTTATACAGTAAAAAGCAGACAAATTAACAGTGAACCCATCCAACATTTTATCAGTCG TGATTTTCTATTTTTAGTGTTGTGTGGCTTATTCGCAATTGCAACGGTGACGGTATTACTTGGCACGTTTTATCCTATGA TTTTTCAGATCTTAGGGTTAGGGAATATTTCGGTAGGGGCACCTTATTTTAATTTACTTTTTGTTCCAATGGCGCTTATT GCACTCGGTATGATGGCGTTATCGATTTTTGTGCAATGGAATAAGAAAGCAGAGATGGCAACAATAAAAAATACAGCCAT ATTCATTGGTAGTTCAGTTATTAGTGGAATGCTGATTTATACACTTCAATATGATTGTATTTACGTTATTCCTCTTATTG TGTGGATCTTATCTATTGCCGTTATTATTGGAACGGTGTGGGAAATAAAACGATCTAAAGGTAAAAATATAAGCATGGCA ATCGCGCATATTGGTGTGGCTGTGGTTATGATTGGCGCTGCGATGAACAGTTATCATTCATTTGAAACCAGTGCAAAAAT GGAACCTGGAATGAGTGCGAAACTTGCGAATTATAATATCCATTATAAAGATACTGAGCTATTAGTTGGTGCTAATTATA CAGCAGAGCAAGCGAATTTACGTATTTATGAAAATGGGAAAGAAATAGCGAATGTTCACCCTCAACGTCGACATTATCAA GTACGAGTGATGAACATGAGTGAGCCGGCAATGCACTGGTTTTGGCGCGGCGATATATACGTTACACTGGGCGAAAAATT AAAAGATGGAAGTTTTGCGTTACGATTGCAATATAAAGCGTACGTGAGGTGGATTTGGTTTGGCTCATTGTTAATGTGTG TTGGAGGGGTATTCGCTATGGTTAAAAGAAAGAGAAAAACAGCATGA Protein sequence : MIAEIGQFWLITTMVLSAVACVTASYGIFRNEDNWAVSIFPLSLLTALFCILSISALGYGFYIDDFSIRYIAEHSNSALP VFFKIAAIWGGHEGSLLFWVLTLTLWVGLITLKRKSIEQSYLVRVLLILNGLIVIFSAFTLFASNPFIIYANTPLEGRDL NPMLQDIGLIFHPPLLYLGYVGFAATFSFALAALMMKKVPSQWVGYARNWTLLAWSLLTAGISLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLLPWLTSTALLHTLIASHKRKLLLKASIILALVTFCLSILGTFVVRSGVLTSVHAFAVDPTRGIILLLILFI VMLLSFSLYTVKSRQINSEPIQHFISRDFLFLVLCGLFAIATVTVLLGTFYPMIFQILGLGNISVGAPYFNLLFVPMALI ALGMMALSIFVQWNKKAEMATIKNTAIFIGSSVISGMLIYTLQYDCIYVIPLIVWILSIAVIIGTVWEIKRSKGKNISMA IAHIGVAVVMIGAAMNSYHSFETSAKMEPGMSAKLANYNIHYKDTELLVGANYTAEQANLRIYENGKEIANVHPQRRHYQ VRVMNMSEPAMHWFWRGDIYVTLGEKLKDGSFALRLQYKAYVRWIWFGSLLMCVGGVFAMVKRKRKTA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-81 | 41 |
