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Name : ccmF (VF_1819) Accession : YP_205202.1 Strain : Genome accession: NC_006840 Putative virulence/resistance : Unknown Product : heme lyase, CcmF subunit Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : 4.4.1.- Position : 2054132 - 2056090 bp Length : 1959 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATCGCAGAACTTGGTCACTTTGCAATGATTGCTTCATTAGGGCTTGCCGTCCTTTTGAGCATATTACCTATGTATGG CGCAAGCCGTGGTAATAAAGCATTAATGCAGAGTGCAAGACCATTAGCTTGGGGGATGTTTTTACTTCTAAGTTTATCAT TTGGAATTTTAATGTGGGCTTTCTACGTTAATGATTTCACTCTTCAGTATGTAGCAAGTAACTCAAACAGCTTATTACCT TGGTACTATCGTTTAACCGCGGTTTGGGGTGCGCATGAAGGTTCACTATTACTTTGGGTATTAATCCAAGCTGGTTGGAC TGTTGCTGTAGCGACATTCAGCCGTGGTATGCCACAAGAATCTGTTGCGCGTGTATTAGCAGTAATGGGGTGGATCACCG TTGGTTTCTTACTGTTTATTATTTTAACCTCTAACCCATTCTTACGTACTCTGCCTTATTTCCCAATTGATGGTCGTGAC TTAAACCCGCTGCTTCAAGATCCAGGTTTAATTATTCACCCTCCAATGCTTTACATGGGTTATGTTGGTTTCTCTGTTGC ATTCTCTTTTGCAATTGCTTCATTAATGACAGGGCGTTTAGATACGGCTTGGGCTCGTTGGTCTCGTCCTTGGACTATCG CTGCATGGTCATTCCTAACGGTAGGTATCTCTCTAGGTTCTTGGTGGGCGTACTATGAACTTGGCTGGGGTGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAACGCATCATTTATGCCTTGGCTTGTTGGTACTGCATTAATGCACTCATTAGCAGTAACAGA AAAGCGTGGTACGTTTAAAGCATGGACCGTATTACTGGCGATTTCAGCGTTCTCATTAAGCTTATTAGGCACATTCTTAG TTCGTTCTGGTATTTTAGTATCAGTTCACGCCTTTGCATCAGATCCTTCTCGAGGCATGTTTATCCTCGGTTTCTTGGTG ATGGTTATTGGTGGTTCACTATTACTGTTTGCCTTAAAAGGTGCATCAGTTCGTGTTCGAGGTAACTTCTCTCTGTTCTC TCGTGAGAATGCGTTATTAGCAAATAACATTTTATTAGTTACAGCATTAGTTGTGGTACTTGTTGGTACTTTATTACCAC TGGTTCATAAGCAACTAGGCTTAGGCTCTGTTTCAATTGGTGCTCCATTCTTCGACATGCTATTTGCATGGTTGATGATC CCATTTGCTTTCCTACTGGGTATTGGTCCACTAATTCGTTGGAAGAAAGACAAACTAAGCAACCTATCAAAACGTCTTGT GATTTCTGGTGCGATAACTGTACCGCTTGCTGCGTTAATGATGGTGATGTTTGCTGATAAATTCCAATTCATGCCGTATT TAGGCTGGATGATGGCGATTTGGATTGTGATTTTACATGGATTTGAGTTGTATGAACGTGCTACGCACCGTCACTCATTC TCTGTGGGTATTACTAAGCTAGGACGCAGTCACTGGGCTATGATTTTTGCTCATATTGGTCTTGCCGTTACGATTATCGG TATTGCTATGGTGCAAAACTACAGTATTGAAAAAGATGTACGTTTAGCGCCAGGTGAACACATTGAAATGAATGGCTACC AGTTCTATTTCGCAGGTGTTAGAGATACAGATGGTCCTAACTATGATGGTTATACCGCTGATTTTGATATTACATTAGAT GGTAAAGCGATTAATACATTGCACGCTGAAAAACGTTTTTATGAAACTGCAGGTTCTATGATGACAGAAGCAGCGATTGA TCGTGGTTTTACTCGTGACTTATACATCGCAATGGGTGAGCGTTTAGATGACAACCGTTCATGGGCTGTACGTATTTACT ACAAACCATTCGTTCGTTGGATCTGGGCTGGTTCATTGTTTATGGCATTTGGTGGTGCATTAGCTATGTCTGATAAACGC TATCGTTTCCGTAAAAATGCTAAAAAACAGGAAGCTTAA Protein sequence : MIAELGHFAMIASLGLAVLLSILPMYGASRGNKALMQSARPLAWGMFLLLSLSFGILMWAFYVNDFTLQYVASNSNSLLP WYYRLTAVWGAHEGSLLLWVLIQAGWTVAVATFSRGMPQESVARVLAVMGWITVGFLLFIILTSNPFLRTLPYFPIDGRD LNPLLQDPGLIIHPPMLYMGYVGFSVAFSFAIASLMTGRLDTAWARWSRPWTIAAWSFLTVGISLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASFMPWLVGTALMHSLAVTEKRGTFKAWTVLLAISAFSLSLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPSRGMFILGFLV MVIGGSLLLFALKGASVRVRGNFSLFSRENALLANNILLVTALVVVLVGTLLPLVHKQLGLGSVSIGAPFFDMLFAWLMI PFAFLLGIGPLIRWKKDKLSNLSKRLVISGAITVPLAALMMVMFADKFQFMPYLGWMMAIWIVILHGFELYERATHRHSF SVGITKLGRSHWAMIFAHIGLAVTIIGIAMVQNYSIEKDVRLAPGEHIEMNGYQFYFAGVRDTDGPNYDGYTADFDITLD GKAINTLHAEKRFYETAGSMMTEAAIDRGFTRDLYIAMGERLDDNRSWAVRIYYKPFVRWIWAGSLFMAFGGALAMSDKR YRFRKNAKKQEA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 4e-156 | 61 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-142 | 53 |
