Name : nrfE (NTHI1107) Accession : YP_248635.1 Strain : Haemophilus influenzae 86-028NP Genome accession: NC_007146 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein NrfE Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1053892 - 1055799 bp Length : 1908 bp Strand : - Note : Similar to: HI0936, NRFE_HAEIN DNA sequence : ATGCTTCCAGAACTTGGCTTTTTCCTTCTTTTACTCGCAACAGCTAGCGCGTTTTTTCTTGCGTTAGTGCCTCAATTTGG GTTGTTCAAAAAAAATTCGACTTTAATTAATGCTGCTTGGCCGCTTAGTTATATTTTTACCCTTGCGACGACGTTCTCAA TTGGTTTGCTTACTTATTCTTTTGCGGTGGATGATTTCACCCTTGAATATGTAGCGGCACATTCCAACTCTCAATTACCT ACATTTTTTAAAGTGGCTGCCACTTGGGGAGGACATGAAGGTTCAATGTTGTTTTGGTTATTTTCATTGAGTTTATGGCT TGCTGCTTTTGCTTTTTTTAATCGAAAAAATGACCGCACTTTTTCCGCTCAATCTTTATCTTTATTGGGATTGATTTGCT TTGGTTTTGCGGTGTTTATTTTATTTTATTCCAATCCATTTGGACGCATTTTCCCTGCTCCCGCAGAAGGGCGCGATCTC AATCCAATGTTGCAAGATGTGGGATTAATTTTCCATCCGCCTTTATTATATGTTGGCTATGTGGGCTTTGCGGTAAATTT TGCAATGAGTTTGAGTGCGTTGATTTATAACCAATCTGCACGACAAATTGCCCGCTCAATGCGTGGATGGGTGTTGGTTT CTTGGTTGTTTTTAACCATTGGCATTGTGCTTGGTGCTTGGTGGGCATATTACGAACTTGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTC TGGGATCCCGTAGAAAATGCGTCTTTAATGCCTTGGTTGCTTGGGTTAGCGTTATTACACAGTTTAATGGCGACGGAAAA ACAAGGCGTATTTAGTTATTGGACAACGCTTTTTTCTCTGCTTGCTTTTGCCTTTAGCGTATTAGGCACGTTTATTGTTC GTTCTGGCGCGCTCACTTCTGTGCACGCCTTTGCATTGGATAACACGCGCGGTTATGTGTTGTTATTAATTTTCTTTGTT TTGACAGCGTTAGCCTTTGGTTTATTCGCTTTACGAGCGGGAAGTTCATCAGAAAGTGCGGTGAAATTTCAGTTCATTTC TAAATCGGGTGGCATTTTATTACTGAATATTTTGCTGACCATTGCGACGGTTTCTACCTTTTTAGGTACCTTTTACCCGA TGTTATTCCAAGCGATGAATTGGGGCTCAATTTCGGTGGGAAGTCCTTATTTTAATAGTATTTTCTTCCCCATTATTACG GCGATTTTAATCCTAATGGTAATTGTGCTTAGCATACGTAAGGGGCAATTTGATCGCACATTATTGATACGTTGTGGGTG GTTGCTTATTCCGTCTTTAATTCTTGCAGGCCTAATGATTTGGCAACAGCTACGCCATAATTCTGCGTTGAATTTTCACG CTTTCGCTTTTGTGTTATTAACTCTTGCGATTTGGCTTTTGTTGGTCACTTTATGGCAAAATTGGCGACAAATTCGTTTG TCTCAATTTGGTATGATTTTAGCGCATTGTGGCGTGGCGATTGTAACTATTGGTGCGGTAATGAGTGGTTATTTTGGCAG TGAAATTGGTGTGCGTTTAGCACCGCAACAAAGTCAAACGCTGGGACAATATGAATTTCACTATCGCCAATTTTCTAATG AAATCGGACCAAACTTTACGGCAGAAGTCGCCTTTTTTGACGTAACTGAAAATGGTAAACCTTATGCAGAAATTATCCCC GAACGCCGTTATTACGATGTTCGTACAATGACAATGAGTGAAGTGGGGCTTAATGGCGGTTTTTGGGGCGATTTATATAT TGTGATGGGCGATTCTCTCGGCAAAGGGGAATTTACTTTCCGCTTACATTATAAACCACTGATTCGTTGGCTTTGGGCGG GCGGTATTTTAATGGCCTTTGGCGCACTTTTTAGCGTCTTCGGATTACGCAGAAAACAGGAAAAATAA Protein sequence : MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLTYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP TFFKVAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV LTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFISKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT AILILMVIVLSIRKGQFDRTLLIRCGWLLIPSLILAGLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAIWLLLVTLWQNWRQIRL SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMSGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEVAFFDVTENGKPYAEIIP ERRYYDVRTMTMSEVGLNGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAFGALFSVFGLRRKQEK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-81 | 43 |