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Name : ccmF (Psyc_1561) Accession : YP_264843.1 Strain : Psychrobacter arcticus 273-4 Genome accession: NC_007204 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1910299 - 1912344 bp Length : 2046 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAATCACAGAATTGGGTTATTTTGCCGTGCTAGCCGCCTTTATGTTGGCGATTTTGCAGGTAGTATTACCAACAAT AGGCGTTATGCGTGACCATGTTGCTTGGCAGCGTTTGGCACCGAGCTTGGCGTGGGCGCAGTTTGCAGCCATGATTACCT CGTTTGGCGCACTAATGGCAGGCTTTTATTTTAATGACTTTAGCCTTGTCTATGTGTCGCAGCACTCGAATACTTTGCTG CCTTGGTATTATAAGCTATCAGCGACGTGGGGCGGGCATGAAGGCTCGCTCCTGCTATGGATGACTATCATGGCAACGTG GTGTGCCTTGGTCTCATACTTTAGTCGTGGTTTACCATTGTCGATGCGCGCGCGCGTATTGGTGATATTAGCCGGTGTAC AGATGATGATGCTGGCAATGCTCATCTTTACCTCGTCACCGTTTGACCGCACTTTACCAAACCTGCCAGTGGATGGTGCT GACCTAAATCCTGTCTTACAAGACTTTGGTCTAATTATCCATCCACCGATGCTGTATATGGGCTATGTTGGTATGGTGGT GCCGTTTGCATTTTGTATGGCAGCATTGTGGGAAGGTCGCTTGGATGCGGTATGGACACGCTGGTCACGTCCATGGGCAT TGGCTGCTTGGGGGTTTTTAACCATCGGTATTGCACTAGGTTCGTGGTGGGCATATTACGAGCTTGGTTGGGGTGGGTGG TGGTTTTGGGATCCAGTAGAAAACGCTTCATTGCTGCCTTGGCTGGCAGGTTTGGCATTGCTACATTCGCTTGCAGTCAC TGAAAAGCGTGGTGTCTTTAAAGCGTGGACGATTATGCTGGCAATTTTTGCCTTTGCATTAAGCTTACTCGGGACATTTT TGGTACGCTCTGGGGTAATTACCTCTGTGCATTCATTTGCCGCAGATCCCACGCGTGGTTTAGTGGTTTTAGCGATTCTT GGGATTATTATTGGTGGTGGTTTATTGATGTTTGCTGTACGTGGCTGGCGTCTTACGATCGAGAGTCAGTATCAGCTGAT TTCACGTGAGTCGTTTTTAGTCATTAACAACGTCATTATTTTGATTGCGACCTTAGTGGTATTACTTGGTACGCTATATC CCATCATTGCCGATGCCTTTAATTTAGGTCAGGTATCCGTAGGTCCTCCGTATTTTAATGCGCTGTTTGTACCGTTGACT TGGCTATTGATGGTAGCAATGGGCATGGGCTCTAATATCCGCTGGAAACAAGACAGCCGTCCGTTATTGGGCGTTGGCAT GGTCATTGCGGCAAGTAGCCTTGTTTTAGCCGCAGTTATTGCCTATTTTGTTAGCCCATCTGCCATGCTCAATATTGGCG TGACGCTAGCGGTGAGTTTTTGGGTATTGTTATGGATGGTAGTTGATTTTAAAGACAAGACCAAAAATGCCCCAAGCTTC TTTAAAGGCTTAGCTAAGCTGCGTTTAAGCTACTGGGGTCAGCAGACAGCTCACATTGGCGTTATTATAGCGGTCATTGG TATTGCCTTTACCAGTACCTTAAGTATTGAGCGCGATGTGGCATTGGGTGAAACGGATACTGTTCATGTGCAAGGGTACG ACTTTGAAATAAAAGACTTCCATGAAGTCAGAGGCAGTAACTTTGATGGTATGCAAGCAGAAGTTGAAGTGACCAAAGAC GGTCGCCCAGTCGTTACTTTATATCCAGAAAAACGTACCTATGTTATCAGTGGTATGCCACTGACTGAGGCAGCGATTGA TGCCAGCCTTATGCGTGATGTGTACGTAGCACTCGGTGAGCCTATCGCTGAAGACGGCAACCAATGGGCGATACGTATTT ACGTGAAGCCATTGATTCGCTGGATATGGCTTGGCGCTATTATTATGGCATTGGGTGGTCTGCTGAGTATGCTTGATAGG CGCTATCGTCTCAAAACAACTAAGACGCCCGCTCAAATCGCAGCGAGTAAGTCAGGTTTTGCGACCGTTGCTGACTTAGA TATTAACAATGCGACAGATGCCACGGCACCAATGGGGGAGAAGTAA Protein sequence : MLITELGYFAVLAAFMLAILQVVLPTIGVMRDHVAWQRLAPSLAWAQFAAMITSFGALMAGFYFNDFSLVYVSQHSNTLL PWYYKLSATWGGHEGSLLLWMTIMATWCALVSYFSRGLPLSMRARVLVILAGVQMMMLAMLIFTSSPFDRTLPNLPVDGA DLNPVLQDFGLIIHPPMLYMGYVGMVVPFAFCMAALWEGRLDAVWTRWSRPWALAAWGFLTIGIALGSWWAYYELGWGGW WFWDPVENASLLPWLAGLALLHSLAVTEKRGVFKAWTIMLAIFAFALSLLGTFLVRSGVITSVHSFAADPTRGLVVLAIL GIIIGGGLLMFAVRGWRLTIESQYQLISRESFLVINNVIILIATLVVLLGTLYPIIADAFNLGQVSVGPPYFNALFVPLT WLLMVAMGMGSNIRWKQDSRPLLGVGMVIAASSLVLAAVIAYFVSPSAMLNIGVTLAVSFWVLLWMVVDFKDKTKNAPSF FKGLAKLRLSYWGQQTAHIGVIIAVIGIAFTSTLSIERDVALGETDTVHVQGYDFEIKDFHEVRGSNFDGMQAEVEVTKD GRPVVTLYPEKRTYVISGMPLTEAAIDASLMRDVYVALGEPIAEDGNQWAIRIYVKPLIRWIWLGAIIMALGGLLSMLDR RYRLKTTKTPAQIAASKSGFATVADLDINNATDATAPMGEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-98 | 49 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-105 | 47 |
