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Name : glcB (SAR11_0510) Accession : YP_265935.1 Strain : Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 Genome accession: NC_007205 Putative virulence/resistance : Unknown Product : malate synthase G Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG2225 EC number : 2.3.3.9 Position : 496262 - 498457 bp Length : 2196 bp Strand : - Note : catalyzes the formation of malate from glyoxylate and acetyl-CoA DNA sequence : ATGGGTGCTATGAAAGAACAATATACAAAAATACACAATCTATCAGTTTCTAATAAATTGCTTAACTTCGTTAATGAAGA GCTGCTTAAAGATACAAATATTTCTTCTGAAAAATTCTGGGAAGGCTTCGACCAAGTAGTTCATGAGCTAGCCCCAAAAA ATAAAGAGCTATTAAAAATAAGAGAAGATTTACAAAAAAAAATAGACGATTGGCATATTGCAAATAAAGGAAATGAAATC AATCTAGAGGAGTATAAAAAATTTTTAAAAGAAATTGATTATTTAAAAGAAGTAGGCCCTGATTTTAAGATCAAAACAAA TAATGTTGATGAAGAAATAACTAGTATTGCTGGACCTCAATTAGTAGTTCCAATCATGAATGAAAGGTATGCACTGAATG CAGCTAATGCTAGATGGATGAGTTTATATGACAGTTTATATGGTACAGATGTAATCGATCAATCTGAGGATAGTCCCACT CAAAGATACGATCCTTTAAGAGGAGAAATGGTTATAAAATATGGAAGAGACTTTTTAGAAAAATATTTTCCTCTAGAAAA TTTTGAATGGCATAATATTACAGCCTTTAAAATTGATAATGGCTCTTTAACAGTATTAAAAGATAGTAATAAATCATCTT TAAAAAATAAAGATAAATATATTGGTCATAGAGGAGAGGCCAATGATCCATCAGCAATAATTTTAAAAAATAATAATCTT CATATAGAAATAATTATAGACCCAAATGCTTTTAGCGCTCAACAAGATCCTGCTAAAATTAGTGATATTATTGTTGAAGC TGCAGTTTCAACTATTTGTGATAATGAAGATAGTGTTGCTGCAGTAGATGCTGATGACAAAGTTATTTGTTATCGTAATT GGCTTGGACTTATGAAAGGTGATTTGAAATCAACTTTTGAAAAAAATGGAAAGACTTATGAGCGTAAATTAAATCCCGAC AGAAGTTATATTTCTAAAGATGGAAAAGGATTAAAGCTACATGGAAGAAGTTTATTATTGGTAAGGAATGTTGGACACCT TATGACTAACTCAGCAATCACTTTAAAAGATGGTTCTGAAATACCAGAAGGTATTATGGATGCCTTTATAACTTCAGCAG CTTGCCTTCATGATATTAAAAAAAAAGGTAATTCTAGAACTGGTTCTATTTATATTGTTAAACCAAAAATGCATGGTCCT GATGAAACCTCATTTACTGATTTAATTTTTACTAAAGTTGAAGAAGTTTTAGGATTGGAAAAATACACTTGTAAAATTGG AATTATGGATGAAGAGAGAAGAACCTCATCTAATTTAAAAGAGTGTATTAGAACACTTCAAAATAGAGTATTTTTTATTA ATACTGGTTTTTTAGATCGTACTGGTGATGAAATGCATACTTCAATGGAAGCTGGTCCTATGATTAAAAAAGGAGATATG AAATCTTCTAAATGGATTGGGGCATATGAAAATAACAATGTAGACATAGGTCTTCAATGTGGTCTTTCTGGTAAGGCTCA AATTGGCAAAGGAATGTGGGCTATGCCGGACAAAATGAAAGAGATGATGGAACAAAAAACTAGCCATCTAAATGCTGGTG CAAATTGTGCTTGGGTTCCCTCACCTACAGCGGCAGCTCTTCATGCTCTTCATTATCATGAAATAAATATTTTTGAGAAA CAGAAAGAAATTCAAAAAAGAGAATCTGCAAAACTGGATGATTTGTTAACAATTCCTGTAGCAGACAGACCAAACTGGTC AATGGAAGAAATTAACTCCGAAATTTCCAATTCTGCACAAACTCTTTTAGGGTATGTCGTCAGATGGATAGATCATGGAG TTGGCTGTTCAAAGGTACCTGATATTAATAATGTTGGTTTGATGGAGGATAGAGCCACTTTAAGAATTTCTTCTCAACAT ATAGCTAATTGGATACATCACGATATTTGTACAAAATCACAAGTTATGGAAGTAATGAAAAAAATGGCAAAAATTGTTGA TGATCAAAATAAAAATGATGGTGCCTATACTCGCTCCGGAAGAGGAAGCTACGAAATGATGTCTGAAAATTTTGAGCAAT CAATTGCTTTTAAGACAGCTTGTGATTTAATCTTTAAAGGTAAAGAGCAACCTTCGGGTTACACAGAACCGTTATTACAT CTAAATCGATTATTAAAGAAATCTAGTCAGAATTAG Protein sequence : MGAMKEQYTKIHNLSVSNKLLNFVNEELLKDTNISSEKFWEGFDQVVHELAPKNKELLKIREDLQKKIDDWHIANKGNEI NLEEYKKFLKEIDYLKEVGPDFKIKTNNVDEEITSIAGPQLVVPIMNERYALNAANARWMSLYDSLYGTDVIDQSEDSPT QRYDPLRGEMVIKYGRDFLEKYFPLENFEWHNITAFKIDNGSLTVLKDSNKSSLKNKDKYIGHRGEANDPSAIILKNNNL HIEIIIDPNAFSAQQDPAKISDIIVEAAVSTICDNEDSVAAVDADDKVICYRNWLGLMKGDLKSTFEKNGKTYERKLNPD RSYISKDGKGLKLHGRSLLLVRNVGHLMTNSAITLKDGSEIPEGIMDAFITSAACLHDIKKKGNSRTGSIYIVKPKMHGP DETSFTDLIFTKVEEVLGLEKYTCKIGIMDEERRTSSNLKECIRTLQNRVFFINTGFLDRTGDEMHTSMEAGPMIKKGDM KSSKWIGAYENNNVDIGLQCGLSGKAQIGKGMWAMPDKMKEMMEQKTSHLNAGANCAWVPSPTAAALHALHYHEINIFEK QKEIQKRESAKLDDLLTIPVADRPNWSMEEINSEISNSAQTLLGYVVRWIDHGVGCSKVPDINNVGLMEDRATLRISSQH IANWIHHDICTKSQVMEVMKKMAKIVDDQNKNDGAYTRSGRGSYEMMSENFEQSIAFKTACDLIFKGKEQPSGYTEPLLH LNRLLKKSSQN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcB | CAE85241.1 | GlcB protein, malate synthase G | Not tested | PAI V 536 | Protein | 0.0 | 56 |
