|
Name : Sde_1871 (Sde_1871) Accession : YP_527343.1 Strain : Saccharophagus degradans 2-40 Genome accession: NC_007912 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 2360769 - 2362796 bp Length : 2028 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTTCCTGAGTACGGTCATCTTGCGCTAATTATGGCGCTATTACTTAGTTTATGTTTATCCATAATCCCCATGGCGGG TAGCTACAACGGTAAGCTGGTGTGGATGGCCTCTGCGCGATCTTTATCCACCGGCATGTTTGTGTTTGTTGCAATCTCAA TAGTGTTGCTTGGCGTTTCGTTCTATCAGGACGATTTCACTGTAGCCTATGTCGCCAATCACTCGAATTCATTGCTGCCT GTGGTGTACAAAATATGTGCCGTTTGGGGCGGGCACGAGGGTTCAATGCTGCTGTGGGTGTTAATGCTTGCAGGTTGGAC TTTAGCGGTAACTATTTTTAGCCGCGAATTACCGCTAGATTTTCAAGCTAGGGTGCTTTCAGTACTCGGCATGGTGTCGT TTGGCTTTATTTTGTTTATTTTGCTCACCTCAAACCCATTTGACCGAATATTGCCCTTACCGCCTGTGGATGGCGCTGAC TTAAACCCATTCTTACAAGACCCCGGCTTTATCTTCCATCCGCCAATGCTGTATATGGGCTATGTTGGCTTTGCTGTTAT TTTTGCATTCAGTATTGCGGCATTGCTAAGTGGCCGGTTAGATAGCGCCTGGGCAAGATGGTGTAGGCCTTGGGGTAATT TGGCGTGGTGCTTTTTAACGCTGGGTTTAACACTTGGAAGTTGGTGGGCGTACTACGAGCTAGGTTGGGGTGGCTGGTGG TTCTGGGACCCAGTTGAAAACGCAGCCTTTATGCCTTGGTTGGTGGGTACCGCATTTATCCATAATTTGGCGGTGTCGGA AAAGCGTGGGTTATTTAAAAACTGGACCCTATTTTTAGCTATTTTTGGCTTCTCGCTGAGCTTGTTGGGCACGTTACTAG TGCGCTCGGGCTTGCTTACATCCGTTCATGCTTTTGCCAGTGATCCGTCGCGCGGGGTATTTATTGGGGCATTCTTATTT ATTGTGATTCTTGCCTCGCTCATACTATTTGCTATGCGGGCGCCTCTGGTTAAATCAAAAACAGGTTTTGCGCTGCTATC GCGCGATGCGTTTTTATTGCTAAACAGTGTGGTGTTTATTGTTTCTGCTTCCATTGTATTGCTAGGCACACTTTACCCTG TAGTGTTGTTGCTACTTGGGTTGGGCGCTGTGTCGGTGGGCGAGCCATACTTTAATATCTTTTTCTCTATATTAATGAGC ATTGCCGCCATAGCTACCGGTATTGGCATGGTGCTTAATTGGAAAAAGACCGAAGCTAAAAGAATGCGTGACTGGGTTAA GTCGCCCGCGTTGTATGCGCTTTGGTTGGGTACCGCATTGCCGGGCATGATAGCCGATGAATATTCTTGGGCTGCGGCGG TTTCTATTGCGCTTGGCAGCTGGGTTATTTTGTCTTGTTTGTTCGATCTAGTACGTAAAACCCGCAATGCTGCGAGTGTG TGGATTGGAATGGGCAAGCTAACGGCTACGTACTACGGCATGATTGTGGCGCATATTGGCTTTGGTATATGCCTATTGGG TGTGTGTTTAGATACCATTTACGATGATCAGCGTGATCTACGGTTAGAGCTAGGTAAGCCCGCGTTTGCTGGCCACTTAG AGTATGAGCTTGTTGATGTAAGCCGCGTAAGAGGGCCAAACTATAATGGCGAGCGAGCCGAAGTTATAGTGCGCAAAGAC GGCGAGACAATAAGCATTCTGCACCCAGAAAAGCGCGCTTATTTTTCTGGTGGCAATATAATGAGTGAAGTGGCTATCGA CCCTGGCTTTTTTTACGATATTTATATTGCGCTGGGGGAAAAGCTAGACAATACCTCGTGGAGTATGCGTATTCACTACA AACCGGTAGTGCGTTGGATATGGTTTGGCGCAGTGTTTATGGCGCTGGGTGGCCTTATAGCTATTACAGATAAACGCTAC AAGCGCAAAAAAACTGTTGCTGTAAAAAATGCAGTGGGTGAAGACGCAAAAGCTGGCGATGCCGATGCGAAGCCCATACT TGCCACTGCCAAACAACAACCCGAGTAA Protein sequence : MLPEYGHLALIMALLLSLCLSIIPMAGSYNGKLVWMASARSLSTGMFVFVAISIVLLGVSFYQDDFTVAYVANHSNSLLP VVYKICAVWGGHEGSMLLWVLMLAGWTLAVTIFSRELPLDFQARVLSVLGMVSFGFILFILLTSNPFDRILPLPPVDGAD LNPFLQDPGFIFHPPMLYMGYVGFAVIFAFSIAALLSGRLDSAWARWCRPWGNLAWCFLTLGLTLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENAAFMPWLVGTAFIHNLAVSEKRGLFKNWTLFLAIFGFSLSLLGTLLVRSGLLTSVHAFASDPSRGVFIGAFLF IVILASLILFAMRAPLVKSKTGFALLSRDAFLLLNSVVFIVSASIVLLGTLYPVVLLLLGLGAVSVGEPYFNIFFSILMS IAAIATGIGMVLNWKKTEAKRMRDWVKSPALYALWLGTALPGMIADEYSWAAAVSIALGSWVILSCLFDLVRKTRNAASV WIGMGKLTATYYGMIVAHIGFGICLLGVCLDTIYDDQRDLRLELGKPAFAGHLEYELVDVSRVRGPNYNGERAEVIVRKD GETISILHPEKRAYFSGGNIMSEVAIDPGFFYDIYIALGEKLDNTSWSMRIHYKPVVRWIWFGAVFMALGGLIAITDKRY KRKKTVAVKNAVGEDAKAGDADAKPILATAKQQPE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-115 | 51 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 6e-118 | 50 |
