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Name : abpT (LSL_1910) Accession : YP_536797.1 Strain : Genome accession: NC_007930 Putative virulence/resistance : Virulence Product : AbpT bacteriocin export accessory protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 200809 - 202968 bp Length : 2160 bp Strand : - Note : COG2274 [V] ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain DNA sequence : TTGTTAAGAAAGTATCGAAAAGATTACGTTTCACAAGTAGACGAATCTGATTGTGGCGTGGCTTCGTTGGCTATGATTTT GAAACACTATGGATCAGCACTATCATTAGCGTATTTAAGGAACATTGCTAAGACAACAATGGAGGGGACTACAGCTTTAG GTCTTGTTAAGACAGCACAGGCTTTAGGAATGGAAACACAAGCCGTAAAAGCTGATATGTCTCTTTTTGGAATGAAAGAC ATTACATATCCATTTATTGTACATGTGGTTAAAGAAGAGACGTTATTACATTATTATGTAGTATTGAAAGCAACGCCTAG ATATATTTTAATTGCTGATCCAGCTCCAGATGTAGGGATAACTAAAATGTCGTATGAACGTTTTGAAAAAGAATGGACAG GGATTACTTTATTCATCGTTCCAGGAATTGAATACAAGCCGACAAAAGAGACTAGACAATCATTAATATCACTATTTAGT AAATTATTTAAGCAAAAGCAACTAATAGTTAATATTGTATTGGCAGCTTTGTTAATTACAATTATTAGTATATTGGGATC ATATTTTTTACAGGGAATAATTGATACATATATTCCTAATGGTATGCATAGTACACTGGCAATTATTGCTTTGGGATTAC TAGTAATATATGTGTTCAATTCAATTTTTACATATGCAAGGGATTTTTTATTAGCAATTTTAGGACAACGACTTTCGATT GAAATTATTTTAAGTTATATTAGACATATTTTTGAGTTGCCTATGGAATTTTTTGCGACCAGAAAAACTGGGGAAATAGT TTCTCGTTTCAATGATGCTAGTAAAATTATAGATGCTTTAGCAAGTACTGTGGTATCTATTTTTTTAGATGTAAGTATTG TAGTTATTATGGGAATAATCTTGGCTATTCAAAATCTTAAATTACTAGGAATAACTCTTATCACACTTCCAATTTACACG ATTATTATTCTTACATTTACAAAGGCATTTGAAAGATTGAATAATAAACAAATGGAAAGTAATGCGATACTTAGTTCATC TATTATTGAAGATATTCAAGGAATAGAAACAATAAAAGCCTTAAACAGCGAACAAATGCGTTACCGCAAAATTGATAGTC AATTTGTGGACTATTTGCGTAAATCGTTAGCATATATAAAAACAGACTCGTTGCAACAAGCATTAAAGTTATTTATTCAA CAAACATTAAATGTTATAGTCCTATGGTTAGGGGCAAATCTGGTAATTAGTAATCAACTCTCTATAGGACAATTAATGAC TTTTAACGCACTATTAAGTTATTTTGTGAATCCATTACAAAATATCATAAATTTACAGCCAAAATTGCAGAGTGCAAGGG TAGCTCACAATCGTTTGAATGAGGTTTACTTGGTTGAAAGTGAATTTAAAGATAGAAAGGCTGTTCATGATGTTACTCAA CTTCAAGGAGACATTATATTTAAAGATGTTGATTATCACTATGGTTATGGTGAAAATGTTTTGGATAAGGTTAATTTGAC TTTAAAACAGGGAGAAAAACTAACTATAGTAGGTATGAGTGGCTCTGGCAAATCAACGTTAGTTAAACTATTGGTGAATT TTTTTGCTCCAGTTTCAGGGAGTATAAAACTAAATAATCATGATATTAATAATATTGATAAGCATGCACTGCGTTCCTAT ATTAATTATATACCACAGAATCCATATATTTTTACCGGGACAATAGAAGATAATCTTAGACTAGGTAATCGATCTAATGT GACTGATGAGGATATTCTTATGGCTTGTAAAATAGCAATGATTGATATAGATATAGCGAAGATGCCACTACAATTAAAAA CTGAATTAGATGAAAATGCTAATATTTTATCAGGTGGACAAAAACAAAGAATTACAATTGCTAGAGCCTTATTATCTCCA GCACAAGTATTGATTTTTGATGAATCTACAAGTGGGTTAGATGCTATTACGGAGAAAAAACTAATTGATAATTTAATGAA ATTAAAGTCAAAAACTATAATTTTTATTGCACATAGATTATCTATAGCTAAGCGAACAAATAATATTCTAGTATTAGATA GCGGAAAAATTGTAGAAAAGGGTAGACATGATGAATTATTAGCTAAAAAAGGATACTACTACAATTTAGTTAATAGTTAG Protein sequence : MLRKYRKDYVSQVDESDCGVASLAMILKHYGSALSLAYLRNIAKTTMEGTTALGLVKTAQALGMETQAVKADMSLFGMKD ITYPFIVHVVKEETLLHYYVVLKATPRYILIADPAPDVGITKMSYERFEKEWTGITLFIVPGIEYKPTKETRQSLISLFS KLFKQKQLIVNIVLAALLITIISILGSYFLQGIIDTYIPNGMHSTLAIIALGLLVIYVFNSIFTYARDFLLAILGQRLSI EIILSYIRHIFELPMEFFATRKTGEIVSRFNDASKIIDALASTVVSIFLDVSIVVIMGIILAIQNLKLLGITLITLPIYT IIILTFTKAFERLNNKQMESNAILSSSIIEDIQGIETIKALNSEQMRYRKIDSQFVDYLRKSLAYIKTDSLQQALKLFIQ QTLNVIVLWLGANLVISNQLSIGQLMTFNALLSYFVNPLQNIINLQPKLQSARVAHNRLNEVYLVESEFKDRKAVHDVTQ LQGDIIFKDVDYHYGYGENVLDKVNLTLKQGEKLTIVGMSGSGKSTLVKLLVNFFAPVSGSIKLNNHDINNIDKHALRSY INYIPQNPYIFTGTIEDNLRLGNRSNVTDEDILMACKIAMIDIDIAKMPLQLKTELDENANILSGGQKQRITIARALLSP AQVLIFDESTSGLDAITEKKLIDNLMKLKSKTIIFIAHRLSIAKRTNNILVLDSGKIVEKGRHDELLAKKGYYYNLVNS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 4e-114 | 42 |
