Gene Information

Name : ECP_0242 (ECP_0242)
Accession : YP_668178.1
Strain : Escherichia coli 536
Genome accession: NC_008253
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : V : Defense mechanisms
COG ID : COG2274
EC number : -
Position : 266932 - 268371 bp
Length : 1440 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGGTAACTATCATATCGGGGATGGTGAATGTAGATTTAGAGTCGTGTGTTCTTCACCAGATGTATGTGAAGTAGGAGG
TTACAAGGTTCCTTTTGACAGTTACCAGACTTTAGATAGTGAAAGACAGTACAGTTCAACGGTATGGGCGCGTGGATGCA
GAGCTTTAAATGTTGGTTCAGTGATTGCTGGAACTCAAAGTAATGCCGGTAAAGGTGTCATATCCGGTACATCTCAAGGA
ACGGGTGACTGTGTTATTTTAACGGGAAGTCCGACTGTAACAATAGAAGGGAAACCTGTTGCTTATCATGGTTCAGTTGT
TGGGATTAATAACCACAACTGCCTTGGTAAATTGTATACCAAAATAAAATCACCAATGATTTCTGTCATTGATAGAACTT
TTAATTATGAAAGGACTGCTGAAGTAATACACGATTTACTGCTTCTGAAGGATCTCCTCTCTGTTGGTAATATTTTTGAC
GGAGATATTTCACCTGAGGTTAAAAATGATTTATTTCAAATAAAAGATCCTGACCAATCATGGGGGGAGTTTTTTTCAAT
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TTACTCAAATGGGGAATGGAGCAATCACCACTTTACATGGTGTGGCGGATTTAGCCTTAGTTACATTCGATGCTCTGTTA
GATACGGCAACGGCAACGGTTGCTTGCCCGATAGGCGAAGATGGGTTATGTGAACAGGCAAATATAAATTTAAATGAAAA
AGAACAGGCTTTATTTAATATTAGTAATTCATTGATAAATGGGCAAGCATGGGATGCACTTAAAAAAATGATAATGGATA
CAAATAATGGTGATCAGATTGCTCTGGAGCATTTTGCCAGCTTTTTATGGGGCTTTATGATACCCGCAAAAATACCAGAA
GAAAATATCTCTGGGAAAGTATTTGTAGAGCCAGTAGTTTTAGAAGGTGGTGCTGGTGGCAATTGGACAGTATTTGATGA
GGTTTTAGATTCAAATGTAATAAAGCAATTGACTTTAACAGGCTGTGGAGCGGCCTGTGGGGAAATGTTGCTTAGGGATA
GGTATATTTTTGTCACGCAAAATGTAATTGGAACAGAATTAACATCTATGACGTCGCTGGCAAACAAGCTTAATAAATTT
GATGTCGGCTGGGAAGGGAATGCAGTGAACGAATCTAGTTTATATGCCCTCAGTAATACTGGTTCATGGGGAGCAATGAT
GTGGGATTCTGGAAGTAAAGTAGGGCATTGGGTACTTGTTAAGGGTGTTGATGATGCTGGGAATGTGATAATATATGATC
CATATCAAGGGAGTCGATATCTGATGACTGAACAGGAATTTAAGGAGGTATGGAATGGGCATAGTGTTTACAAACCATAA

Protein sequence :
MGNYHIGDGECRFRVVCSSPDVCEVGGYKVPFDSYQTLDSERQYSSTVWARGCRALNVGSVIAGTQSNAGKGVISGTSQG
TGDCVILTGSPTVTIEGKPVAYHGSVVGINNHNCLGKLYTKIKSPMISVIDRTFNYERTAEVIHDLLLLKDLLSVGNIFD
GDISPEVKNDLFQIKDPDQSWGEFFSIKNIRESLRNGIEGDKSQIREWFGENTLTQMGNGAITTLHGVADLALVTFDALL
DTATATVACPIGEDGLCEQANINLNEKEQALFNISNSLINGQAWDALKKMIMDTNNGDQIALEHFASFLWGFMIPAKIPE
ENISGKVFVEPVVLEGGAGGNWTVFDEVLDSNVIKQLTLTGCGAACGEMLLRDRYIFVTQNVIGTELTSMTSLANKLNKF
DVGWEGNAVNESSLYALSNTGSWGAMMWDSGSKVGHWVLVKGVDDAGNVIIYDPYQGSRYLMTEQEFKEVWNGHSVYKP

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_1753 YP_851431.1 hypothetical protein Not tested PAI II APEC-O1 Protein 0.0 99