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Name : Sfri_0182 (Sfri_0182) Accession : YP_748883.1 Strain : Shewanella frigidimarina NCIMB 400 Genome accession: NC_008345 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 190402 - 192372 bp Length : 1971 bp Strand : + Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein; KEGG: son:SO0266 cytochrome c-type biogenesis protein CcmF DNA sequence : ATGATTCCAGAACTTGGACATTTCTCGCTAATTCTCGGTTTGGCTTTTGCCTTACTGCTAGCTAGCGTGCCGTTATATGG TTCCGCACGTAAAGACCAGTATCTTGTTCGCTATGCCTGGCCACTGACATACGGAATGTTTTTTTTCATCAGTCTCTCCG TTATAGCGCTAGGGTACAGCTTTGCTGTTGATGATTTCTCTGTGGCTTATGTCGCCCATCACTCTAATTCTCAACTACCA ATATTCTTTAAAATTGCGGCGGTATGGGGTGGTCATGAAGGTTCATTATTATTCTGGGTATTCGCGTTGTCTGTATGGAC TGCATCAGTGGCACTGTTTAGTAAGGGCTTAGAAGAAGTCTTTACTGCAAGGGTGTTATCTGTTTTAGCGATGATCGTTG TTGGCTTCGGTTTATTCATGATCCTAACTTCTAGTCCATTTGAACGGATATTCCCTATTCCTCTAGAAGGGCGAGATTTA AACCCAATGTTGCAAGATGTTGGCTTAATCTTCCATCCGCCAATGTTGTATCTAGGGTATGTGGGTTTCTCGGTATGTTT TGCTTTTGCTATTGCAGCCCTTATGAGTGGCAGACTTGATTCTGCTTGGGCACGCTGGAGTCGTCCTTGGACTTTAGCTG CATGGATATTTCTAACTGGTGGTATTTCACTTGGTTCTTGGTGGGCTTACTACGAATTAGGTTGGGGCGGCTGGTGGTTC TGGGACCCAGTTGAAAATGCATCATTTATGCCTTGGTTAGTCGGTACTGCTTTAGTGCACTCATTAATTGTGACGGAAAA GCGTGGGGCATTCCGTAACTGGACTGTATTGCTGTCTATCTTTGCCTTCTCATTAAGTTTACTCGGCACCTTTATTGTAC GTTCGGGCGTTCTTACTTCAGTGCATTCTTTTGCAGCAGATCCAAGTCGTGGCTTGTTTATCTTGTTGTTGTTAGGTATT GCCATTGGTGGTTCATTAACTTTGTTTGCCTTCCGAGCAAGCGAAATGAGTAGCCCTGCACGATTTGAGCTTAAATCGAA AGAAACCATGTTACTAATCTGTAATGTGTTACTCACTGTTGCGGCAGGTACCGTTTTGCTGGGTACGCTTTATCCGTTAC TGATCGATGCATTAGGCATGGGTAAAATTTCTGTTGGCCCTCCATATTTTAATGCCGTATTTGTCCCTATCGTGTTAGTG CTATTTGGCTTTATGGGTATTGGTCCAATTATTCGCTGGAAGAAATCTAAACCGGGTGAAATTAAAAAGCAGTTACTTGT GCCTGCTATTATCGCGTTAGTGGTTGGTGTGTCGGCTCCATTTGTTGCTGATGGTCAATTTAATGCTTGGGTGATGTGTG GTGTAGCGGCTACAACGTGGATCATGCTATCAACTTTGCGGGCTGCTTATAATATTGTAAGCAACAAAGAAGGTGGTATC AGTCTTAATAAAATGGGCCGTAGCCAATTAGGTATGATCGTCGCTCATTTTGGTATTGCTGTGTCGGTAATGGGCGCAAC TATCGTGTCTAATTACTCGATTGAAAAAAGCGTGCGTATGGGACCAGGAATTAGCCAAGAACTGGCTGGTTATACATTTA AGTATTTAGAAACTAAAAATGTAGTAGGTCCAAACTATACCGCTCAACAAGGTCAAATCGAAATCTACAAAGATGATGAA TTTATTACCTTGTTAAAGCCTGATCGTCGTCAATATAATGTTCGAACTATGGATATGACCGAAGCGGGTATTGATTGGGG ATTGTTCCGCGATTTATATGTCACTATGGGCGATCCAATTAGTTTAACTGAGTTTGCTGTGCGTCTTAATTACAAGCCAT TTGTTCGTTGGTTATGGTTTGGCTCGATCTTCATGATGATAGGTGGGTTCCTTGCAGCATCAGATAAGCGTTATCGTGTG AAGCAGGTTGCAACAGAAGATGCAGCAAAAGCAAAATTAGCGACAGCTTAA Protein sequence : MIPELGHFSLILGLAFALLLASVPLYGSARKDQYLVRYAWPLTYGMFFFISLSVIALGYSFAVDDFSVAYVAHHSNSQLP IFFKIAAVWGGHEGSLLFWVFALSVWTASVALFSKGLEEVFTARVLSVLAMIVVGFGLFMILTSSPFERIFPIPLEGRDL NPMLQDVGLIFHPPMLYLGYVGFSVCFAFAIAALMSGRLDSAWARWSRPWTLAAWIFLTGGISLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASFMPWLVGTALVHSLIVTEKRGAFRNWTVLLSIFAFSLSLLGTFIVRSGVLTSVHSFAADPSRGLFILLLLGI AIGGSLTLFAFRASEMSSPARFELKSKETMLLICNVLLTVAAGTVLLGTLYPLLIDALGMGKISVGPPYFNAVFVPIVLV LFGFMGIGPIIRWKKSKPGEIKKQLLVPAIIALVVGVSAPFVADGQFNAWVMCGVAATTWIMLSTLRAAYNIVSNKEGGI SLNKMGRSQLGMIVAHFGIAVSVMGATIVSNYSIEKSVRMGPGISQELAGYTFKYLETKNVVGPNYTAQQGQIEIYKDDE FITLLKPDRRQYNVRTMDMTEAGIDWGLFRDLYVTMGDPISLTEFAVRLNYKPFVRWLWFGSIFMMIGGFLAASDKRYRV KQVATEDAAKAKLATA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-139 | 55 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-116 | 50 |
