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Name : PEPE_0085 (PEPE_0085) Accession : YP_803638.1 Strain : Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 Genome accession: NC_008525 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin-processing peptidase Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 92932 - 95106 bp Length : 2175 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCGGTCTCAAAAATGGCAAAAATTTTATACAGCTCAAGTTGATGAAAATGACTGCGGAGTGGCTGCGCTAAATATGGT TCTTAAGTATTATGGCTCTAATTACACATTGGCACATTTACGTAATCTTGCTAAAACTACTAATGATGGCACCACGGCTC TAGGCATTGTGGAAGCTGCGAAACACCTAAACTTAAACGCCGAAGCTGTGCGTACAGATATAGATTTTTTTTCTGATTTC CAAATAACGTTTCCTGTTATCGTCCATGTTTTAAAAGATAACTATTTACCACACTATTATGTTGTTTATCAAGTCACTAA GACAAGTTTAATTATTGGTGACCCTGATCCAACCGTTAATACTACTACAATATCAAAAGCTCGATTTATCAAAGAATGGA CCAAAATTGCAATTATGATAACTCCAAATATTAAATATAAACCTACAAAAGAGCCACGACATACACTAATTAATTTAGTA CCCTTGTTAATCAAACAAAAAAAATTGATTAGTTTAATTATCAGTGCGGCGTTTTTAACGACATTAATTAGTATTGCTGG TACATATTTTTTTCAATTAATTATTGATACTTACCTACCTCAAATGTTAACCAATACTTTAACGTTAGTTGCTATCGGTC TAATTGCAGCGTATCTTTTTCAAGCAGCTATTAGTTATATCCAAAGCTTACTCACAATTATATTGGGACAACGACTTATG GTTGATATCATTCTGAAATATGTTCACCATCTTTTTAATTTACCCATGGCCTTTTTTGCTACTCGGCATGTAGGTGAAAT AACATCGCGATTTTCTGATGCTAGTAAAATTATTGATGCGCTTGGAAACATTATGATGACGTTATTTTTGGATATGTGGA TTTTAATTGCAGTAGGTGCCTTTTTAGCTTATAAAAATATTATTTTATTTTTAATTTCATTGATTGTAATTCCAATATAT ATAATAATCGTTTGGATATTTAAAAAAACTTTCCATCGGTTAAATCAAGCCACAATGGAAAGTAGTGCTATCGTTAACTC AGCTATTATTGAAAGTTTAAGTGGTATAGAAACCATCAAGGCTTTGACAGGTGAATCAGCCACAAAAAAGAGGATTGACG TTCTTTTTTGTGATTTATTACGAAAAAATTTAGCTTATCAAAAGGCTGATCAAGGACAACAAGCTATTAAAATGGCTACT AAATTGATTTTGACCGTTGTTATCCTCTGGATAGGTACAATTTTTGTAATGCAACATCAACTTTCTTTAGGGCAACTGTT AACCTACAATGCGTTACTTTTGTACTTTCTAACACCGTTAGAAAATATAATTAATTTACAATCTAAATTACAATCAGCAC GAGTAGCAAATAACCGATTAAATGAGATTTATCTTGTTCAGTCTGAATTTTCAAAACCAAGGATGATTAATGAATCCTAT CAATTGAATGGTGATATTACGGTCAATAATGTTAATTTTAAATACGGATATAGTTCTAATACGCTTAAAAATATTTCTTT AACAATTCATCGTAATCAAAAAGTTACGATCGTAGGTATGAGTGGATCTGGTAAAACAACTCTTGCTAAATTATTAATTG GTTTTTACGAGATCCAAGAACAATGTGGTAACATTCAAATTAATCAGCATAATATAAATGATATTAGTCGCAAGGTTCTA CGGCAGTACATCAATTATATCCCTCAGGAACCCTTTATTTTTTCTGGTACCGTTTTAGACAACTTATTATTGGGTAGTCG GCCTAATTTAACCCAAGAAACGATTGATCAAGCTTGTTCTTTTGCTGAAATTAAAGCGGACATTGAAAAATTATCTCAAG GCTACTACACTAAATTAAGCGAAAGTGGTTCTGATTTATCCGGTGGACAAAAACAACGGTTATCAATAGCTCGTGCATTA TTGTCTCCAGCAAAGTGTCTAATTTTTGACGAATCGACTAGTAGCTTAGACACAATTACTGAACACAAGATTATATCTAA TTTGATGGATATGAAGGGTAAAACGATAATTTTTATTGCTCATCGTCTTAACATTGCAGCTCAAACTGATAAAGTCATTG TACTTGATAAAGGGACGGTTGTTGAGCAAGGCTCTCACCAACAACTATTAAATCTTAACGGTTATTACACAAGATTAATT AACAGACAAGGATAG Protein sequence : MRSQKWQKFYTAQVDENDCGVAALNMVLKYYGSNYTLAHLRNLAKTTNDGTTALGIVEAAKHLNLNAEAVRTDIDFFSDF QITFPVIVHVLKDNYLPHYYVVYQVTKTSLIIGDPDPTVNTTTISKARFIKEWTKIAIMITPNIKYKPTKEPRHTLINLV PLLIKQKKLISLIISAAFLTTLISIAGTYFFQLIIDTYLPQMLTNTLTLVAIGLIAAYLFQAAISYIQSLLTIILGQRLM VDIILKYVHHLFNLPMAFFATRHVGEITSRFSDASKIIDALGNIMMTLFLDMWILIAVGAFLAYKNIILFLISLIVIPIY IIIVWIFKKTFHRLNQATMESSAIVNSAIIESLSGIETIKALTGESATKKRIDVLFCDLLRKNLAYQKADQGQQAIKMAT KLILTVVILWIGTIFVMQHQLSLGQLLTYNALLLYFLTPLENIINLQSKLQSARVANNRLNEIYLVQSEFSKPRMINESY QLNGDITVNNVNFKYGYSSNTLKNISLTIHRNQKVTIVGMSGSGKTTLAKLLIGFYEIQEQCGNIQINQHNINDISRKVL RQYINYIPQEPFIFSGTVLDNLLLGSRPNLTQETIDQACSFAEIKADIEKLSQGYYTKLSESGSDLSGGQKQRLSIARAL LSPAKCLIFDESTSSLDTITEHKIISNLMDMKGKTIIFIAHRLNIAAQTDKVIVLDKGTVVEQGSHQQLLNLNGYYTRLI NRQG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 5e-100 | 41 |
