Gene Information

Name : APECO1_1753 (APECO1_1753)
Accession : YP_851431.1
Strain : Escherichia coli APEC O1
Genome accession: NC_008563
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : V : Defense mechanisms
COG ID : COG2274
EC number : -
Position : 267585 - 269024 bp
Length : 1440 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGGTAACTATCATATCGGGGATGGTGAATGTAGATTTAGAGTCGTGTGTTCTTCACCAGATGTATGTGAAGTAGGAGG
TTACAAGGTTCCTTTTGACAGTTACCAGACTTTAGATAGTGAAAGACAGTACAGTTCAACGGTATGGGCGCGTGGATGCA
GAGCTTTAAATGTTGGTTCAGTGATTGCTGGAACTCAAAGTAATGCCGGTAAAGGTGTCATATCCGGTACATCTCAAGGA
ACGGGTGACTGTGTTATTTTAACGGGAAGTCCGACTGTAACAATAGAAGGGAAACCTGTTGCTTATCATGGTTCAGTTGT
TGGGATTAATAACCACAACTGCCTTGGTAAATTGTATACCAAAATAAAATCACCAATGATTTCTGTCATTGATAGAACTT
TTAATTATGAAAGGACTGCTGAAGTAATACACGATTTACTGCTTCTGAAGGATCTCCTCTCTGTTGGTAATATTTTTGAC
GGAGATATTTCACCTGAGGTTAAAAATGATTTATTTCAAATAAAAGATCCTGACCAATCATGGGGGGAGTTTTTTTCAAT
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TTACTCAAATGGGGAATGGAGCAATCACCACTTTACATGGTGTGGCGGATTTAGCCTTAGTTACATTCGATGCTCTGTTA
GATACGGCAACGGCAACGGTTGCTTGCCCGATAGGCGAAGATGGGTTATGTGAACAGGCAAATATAAATTTAAATGAAAA
AGAACAGGCTTTATTTAATATTAGTAATTCATTGATAAATGGGCAAGCATGGGATGCACTTAAAAAAATGATAATGGATA
CAAATAATGGTGATCAGATTGCTCTGGTGCATTTTGCCAGCTTTTTATGGGGCTTTATGATACCCGCAAAAATACCAGAA
GAAAATATCTCTGGGAAAGTATTTGTAGAGCCAGTAGTTTTAGAAGGTGGTGCTGGTGGCAATTGGACAGTATTTGATGA
GGTTTTAGATTCAAATGTAATAAAGCAATTGACTTTAACAGGCTGTGGAGCGGCCTGTGGGGAAATGTTGCTTAGGGATA
GGTATATTTTTGTCACGCAAAATGTAATTGGAACAGAATTAACATCTATGACGTCGCTGGCAAACAAGCTTAATAAATTT
GATGTCGGCTGGGAAGGGAATGCAGTGAGCGAATCTAGTTTATATGCCCTCAGTAATACTGGTTCATGGGGAGCAATGAT
GTGGGATTCTGGAAGTAAAGTAGGGCATTGGGTACTTGTTAAGGGTGTTGATGATGCTGGGAATGTGATAATATATGATC
CATATCAAGGGAGTCGATATCTGATGACTGAACAGGAATTTAAGGAGGTATGGAATGGGCATAGTGTTTACAAACCATAA

Protein sequence :
MGNYHIGDGECRFRVVCSSPDVCEVGGYKVPFDSYQTLDSERQYSSTVWARGCRALNVGSVIAGTQSNAGKGVISGTSQG
TGDCVILTGSPTVTIEGKPVAYHGSVVGINNHNCLGKLYTKIKSPMISVIDRTFNYERTAEVIHDLLLLKDLLSVGNIFD
GDISPEVKNDLFQIKDPDQSWGEFFSIKNIRESLRNGIEGDKSQIREWFGENTLTQMGNGAITTLHGVADLALVTFDALL
DTATATVACPIGEDGLCEQANINLNEKEQALFNISNSLINGQAWDALKKMIMDTNNGDQIALVHFASFLWGFMIPAKIPE
ENISGKVFVEPVVLEGGAGGNWTVFDEVLDSNVIKQLTLTGCGAACGEMLLRDRYIFVTQNVIGTELTSMTSLANKLNKF
DVGWEGNAVSESSLYALSNTGSWGAMMWDSGSKVGHWVLVKGVDDAGNVIIYDPYQGSRYLMTEQEFKEVWNGHSVYKP

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
APECO1_1753 YP_851431.1 hypothetical protein Not tested PAI II APEC-O1 Protein 0.0 100