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Name : Rmag_1006 (Rmag_1006) Accession : YP_904183.1 Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm Genome accession: NC_008610 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein-export membrane protein SecD Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0342 EC number : - Position : 1072310 - 1074157 bp Length : 1848 bp Strand : - Note : TIGRFAM: protein-export membrane protein, SecD/SecF family; protein-export membrane protein SecD; PFAM: SecD/SecF/SecDF export membrane protein; KEGG: tcx:Tcr_1331 protein-export membrane protein SecD DNA sequence : ATGAATCATTACTCAAGGCTTAAGAATGCATTGATTATATTTGTTTTATTGCTTTCAATGTTGTACGCGTTGCCAAATAT ATTCGGCTCTGATTTAGCAGTTCAAGTATCAAGTGTAGGAAATACTTTGATTGTTGACCAAGATTTGAATAAAATTAAAA ATGTATTAAAAGCTCAACAAATTGAGTTTAAATCTGTTGAATTAACCAATCAAAGAATTTTGGTGCGGTTTAAGGATAAT ACACAACAGCTTTTAGCTAAAGACGTGCTTAAGCAGGCATTAGGCCGTCGTTACGTGGTGGCGTTAAATTTAGCGCCTTC TGTGCCAGTTTGGCTGACAATCCTTGGCGGTAAAGCCATGTCGCTTGGTTTGGACCTTAGGGGCGGTGTGTATTTCTTAT TAGAAGTTGATATGGAGACGGTAATTTCAGCTTTAATGAACAAAGTATATAATGAGCTTCGTGTTTTATTGCGTAAGGAT AGACTATACAAGAGTATCAAGCAAGAAAATGGTAGTATTGTTATTCGTTTTAAACACGCTGAATTAAAAGACAAAGCAGC TCAGTTAATTAAATTAGAATTGGGTGATTTAGTGATGCTTGATAATAATTCGGATGAATTATCGTTAAATATAGGTATTA GCGAAAGTGCACAAAGACAAGCTAAAAAAAGTGCACTTAAACAAAATATTACAACATTGCGTAATCGAGTTAATGAGTTA GGCGTGACAGAACCAATTATTCAACAAAGCTCAGAGCGTATTATGGTCCAACTGCCAGGTGTACAAGATACAGCCAGAGC AAAAGAGATTTTAGGTACGGTGGCAACTTTAGAATTTAGACTGGTTGATGAAAAAAATGACCCACAAATTGCCATCCAAT CGGGACGTGTGCCAATTGGTTCAAAACTCTATTATTTTAAAGATGGCAGCCCTTTATTGTTAAAGGATCGCGTTATCACA ACGGGTGAGAATATTACGGGTGCGGCGTCTAGTATTGATCAAGAAAATAACATTCCAATGGTGAATATCACACTTGATAG TATTGGTGGTAGAGCAATGCTTAACACAACTAAAAAATACTTACATCATCGTATGGCAGTTGTCTTTATTGAAAATAAGG TTGAAACCATAATTAAAAATGGAAAAACCATTAAGAAACATACCACCACTAGAGATATTATTAATGCTGCCACAATTCAG AGTGCGTTTTCATCACGATTTCAAATTACAGGGATTGACAGTGCTCGGGAAGCTCGTAATTTAGCGTTATTATTAAGGGC AGGCTCACTCTCGGCACCAATTGAAATTATTGAGGAACGCACCATTGGCCCAAGTCTTGGTGCGGATAATATTACTAAAG GCATGACATCAGTATTGGTTGGGTTTGTTTTGGTTTTGTTATTTATGGCTATACGTTACCGTATATTTGGAATTGTGGCC AATGTGGCTTTGACATTTAATTTGGTGATGATTGTGTCTGTTTTGTCTTTATTACAAGCCACACTGACATTGCCAGGTAT TGCAGGTATTGTACTCACAGTAGGTATGGCGGTAGATGCCAATGTATTAATTTTTGAGCGTATTAAAGAAGAATTGTGCG TAAATAGCAAAATTCAAAAAGCCATTTCAAACGGCTATGATAAAGCGTTACTGACCATTGCAGATGCTAATATTACAACA TTAATTGCAGCATTAGTTTTATTTAGTTTTGGTACCGGGCCAATTAAAGGCTTTGCGATTACCTTGTCAATTGGTATTGT TACTTCCATGTTTACAGCCATTATTGTCTCACGTGCAATCATTAATAAAATATACGGTGGTAAAAAGTTAGAGGAGATTT CAATATGA Protein sequence : MNHYSRLKNALIIFVLLLSMLYALPNIFGSDLAVQVSSVGNTLIVDQDLNKIKNVLKAQQIEFKSVELTNQRILVRFKDN TQQLLAKDVLKQALGRRYVVALNLAPSVPVWLTILGGKAMSLGLDLRGGVYFLLEVDMETVISALMNKVYNELRVLLRKD RLYKSIKQENGSIVIRFKHAELKDKAAQLIKLELGDLVMLDNNSDELSLNIGISESAQRQAKKSALKQNITTLRNRVNEL GVTEPIIQQSSERIMVQLPGVQDTARAKEILGTVATLEFRLVDEKNDPQIAIQSGRVPIGSKLYYFKDGSPLLLKDRVIT TGENITGAASSIDQENNIPMVNITLDSIGGRAMLNTTKKYLHHRMAVVFIENKVETIIKNGKTIKKHTTTRDIINAATIQ SAFSSRFQITGIDSAREARNLALLLRAGSLSAPIEIIEERTIGPSLGADNITKGMTSVLVGFVLVLLFMAIRYRIFGIVA NVALTFNLVMIVSVLSLLQATLTLPGIAGIVLTVGMAVDANVLIFERIKEELCVNSKIQKAISNGYDKALLTIADANITT LIAALVLFSFGTGPIKGFAITLSIGIVTSMFTAIIVSRAIINKIYGGKKLEEISI |
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| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-108 | 45 |