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Name : Rmag_0272 (Rmag_0272) Accession : YP_903525.1 Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm Genome accession: NC_008610 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 296552 - 298456 bp Length : 1905 bp Strand : + Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein; KEGG: psp:PSPPH_3309 cytochrome c-type biogenesis protein CcmF DNA sequence : ATGTTAATTGAAATTGGACATTTTGCATTAGTGCTTGCCTTTGTGTTTGCAGTGTTACAAGTTGTTTTGCCAACTATAGG CATAATTAAACATGACACCATTCTTTCTGGCTTGTCTAGACCCTTGTTATGGATGCAATTTTTTTGGATTTTAATTGCTT TTGCTATTCTCATGAATGCCTTCTTGGTTGATGATTTTTCTGTTAAATATGTGGCAAATAATTCAAATACACAACTACCC AATATTTTTAAGATGTCAGCCGTTTGGGGTGCGCACGAAGGCTCTTTATTACTATGGGCTTTGATTTTAACTGCTTGGAG CGTAGCAGTGTCTATATTCTCTAGGCGTTTACCTGATGAAGTATTAAACCATATTCTCATTATTCTTGGCTTAATTAGTA TTGGTTTTTTGTTGTTTTTACTGCTAACCTCTAATCCTTTTGAGCGTCTAGATATGGTGCCAATACAAGGGCGTGAGCTT AATCCTTTGTTGCAAGATTTTGGCTTAATTATCCATCCACCAATGCTATATATGGGTTATGTGGGAATGGCAGTTCCATT TGCTTTTGTTTTATCATCACTTATTCGTGGGCAGCTAGATTCTACTTGGTTACGGTGGTCACGCCCTTGGACATTAATCG CATGGGCATTTTTAACATTTGGCATCACACTTGGTTCTTGGTGGGCTTATTACGAGCTTGGTTGGGGCGGTTGGTGGTTT TGGGATCCGGTGGAAAATGCCTCATTTATGCCATGGTTAGTGGCAACAGCATTGGTGCACTCTTTAAGCGTAAGTGAGAA GCGTGGTGTATTTAAACATTGGACTGTACTATTGGCCATTTCTGGATTTTCGTTAAGTTTATTAGGTACATTTCTAGTTA GATCAGGTATTCTTACTTCAGTACACTCATTTGCTGCTGACCCTGCCAGGGGTTTGTTTATTTTGATATTTTTAGTGATT GTGGTTGGTGGTTCGTTGGTACTATATGCTTGGCGTGCTTCACTCATGCAAAGTAATAACACCTTTTCTTTTTTATCAAG AGAGAGCGGTTTACTAGTTAATAATGTCTTATTAGTGGCAGCAATGTCAAGTGTCTTTTTAGGTACGCTCTATCCATTAC TGTTAGATGCATTAGGTTTAGGTAAAATTTCAGTGGGGGCGCCTTATTTTAGTGCAGTGTTCGTGCCTATTATGATTCTG GCACTCTTGGTCATGGTGATTGCTCCTTTTTTACGCTGGAAAAAAGATACCACACAAAGGGTGGCGGGTTTATTAAAGTG GGTGTGGATAGGTGTAGGTTTGTTGTTTGTTATTAGTGCGTTATTGACTGATAATACCTCAGTTTTATTAGCCGTCTTTT TGTTTATTTGGATAGTTATGCATTCACTGGTGCTTTTGTTTCAAAGGTTAAACCAAAAAGGCAGTATGAGTTTTGCTTTC ATTGGCATGATTTTTGCTCATATTGGTATTGCCGTATTCTTATTAGGTGCTACAGTTACAACTCAGTACGGTGTTGAAAA AGATATAAAAATGGACATTGATAAACCAATCACCATAGCAGGTTATGATTTTATTTTTAAAGGTGTGACGCACTTATTTG GTCAAAACTATCAAGGAAATAAAGGTCATGTAGAAGTCTATTTTGAGAATGAGAAAATATCAGATTTAAGACCTGAAAAA CGTCAATATGTCACAGGCATGCCCATGACTGAAGCAGCTATTGATCCATCTTTATATCGTGATATTTATATCGTATTAGG CGAGTCTTTAGAAAATGATTCATGGAGTTTAAGAATTTATTATAAGCCACTCATACGCTGGATTTGGCTAGGGGGGTTAT TGATTACACTGGGTGCGTTATTAGCTGCATTTGACAGAAGGTATCGATTAAGAGTGAAAGAATGA Protein sequence : MLIEIGHFALVLAFVFAVLQVVLPTIGIIKHDTILSGLSRPLLWMQFFWILIAFAILMNAFLVDDFSVKYVANNSNTQLP NIFKMSAVWGAHEGSLLLWALILTAWSVAVSIFSRRLPDEVLNHILIILGLISIGFLLFLLLTSNPFERLDMVPIQGREL NPLLQDFGLIIHPPMLYMGYVGMAVPFAFVLSSLIRGQLDSTWLRWSRPWTLIAWAFLTFGITLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASFMPWLVATALVHSLSVSEKRGVFKHWTVLLAISGFSLSLLGTFLVRSGILTSVHSFAADPARGLFILIFLVI VVGGSLVLYAWRASLMQSNNTFSFLSRESGLLVNNVLLVAAMSSVFLGTLYPLLLDALGLGKISVGAPYFSAVFVPIMIL ALLVMVIAPFLRWKKDTTQRVAGLLKWVWIGVGLLFVISALLTDNTSVLLAVFLFIWIVMHSLVLLFQRLNQKGSMSFAF IGMIFAHIGIAVFLLGATVTTQYGVEKDIKMDIDKPITIAGYDFIFKGVTHLFGQNYQGNKGHVEVYFENEKISDLRPEK RQYVTGMPMTEAAIDPSLYRDIYIVLGESLENDSWSLRIYYKPLIRWIWLGGLLITLGALLAAFDRRYRLRVKE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-115 | 53 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-108 | 50 |
