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Name : Rmag_0313 (Rmag_0313) Accession : YP_903562.1 Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm Genome accession: NC_008610 Putative virulence/resistance : Unknown Product : FAD linked oxidase domain-containing protein Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0277 EC number : - Position : 340995 - 342425 bp Length : 1431 bp Strand : + Note : PFAM: FAD linked oxidase domain protein; KEGG: psp:PSPPH_3252 glycolate oxidase, GlcD subunit DNA sequence : ATGAAAGTCATACAGCAACTTTTAACACAATTACCTAAGGGGATTGTCCTTACGGGTAAGGAAAACACTCGTCCGTTTGA GTGTGATGGTCTAAGTATGTATAGGCAAAATCCTTTGGCGGTGGTATTACCAGAGAATATTGCGCAAATTAAGCAAGTAT TGAAAATTTGCAAAGTCAATAATACACCAGTGGTAACACGGGGTGCGGGGACGGGTTTGGCAGGTGGAGCAATGCCGCTT GAAAAATCAATTGTATTGGGCTTATCTAAGTTGAATCGGGTGATATTAATTGATGTGAAAAATCGGCTGGCTATAGTTGA GCCTGGTGTAAGAAATATCGCCATTAGTGAAGCAGTGGCACAGCACTGCCTTTATTATGCGCCTGATCCATCAAGTCAAA TTATTTGTACAATTGGCGGAAATGTGGCTGAAAATTCTGGCGGAGTGCATTGTTTAAAATATGGATTAACGGTGCATAAT GTTAAGGCAATTAAAATACTAACCATTGATGGTGATGAGTTAATACTATCTCGTCAAGATGATGGACTGGGATTGTTAGC ACTTATGAATGGTTCAGAAGGTTTGCTGGGCATTATTATTGAAATTACAGTTAAACTTACACCAACACCTGTCCTTGCTA GAGTGGTAATGGCAGGATTTGGCTCTGTTAGAGATTGTGCCAATGTAGTGTCAGATATTATTAGGGATGGTATTATTCCT GCTGGGTTAGAAATGATGGATAGTTTTGCTATTGAGGCAGCTGAAAGGTTTGCTAAAGTTGGTTATCCACTAGATGCTAA GGCGTTATTGCTTTGTGAGCTTGATGGCACACAAGCACAAGTGCAATCAGAACTTGATCGTGTATTAAAAGTCTTATCAA GTGCATCGACTTTGAAAGTATCTGAAGGCGAAGAAGAGCGACTTAATTTTTGGAAAGGACGTAAGTCTGCTTTTCCTGCA GTAGGCAGATTGTCCCCTGATTATTATTGTATGGATGGCACGATTCCAAGGCGACATCTAGCAGATATGTTAGAAAAAAT CAATGAGTTGAGTAGGAAATATCAACTCAGAGTCGCCAATGTTTTTCATGCAGGTGATGGCAATTTGCACCCGCTTATTT TGTACGATGCAAATATAGAAGGTGAATCAGAAAAAGTGGAAGAATTCGGCACTGAGATTTTAAAACTTAGCGTAGATATG GGTGGCACTATCACAGGGGAGCATGGGGTGGGTGTTGAAAAATTAAATGCTATGTGTCATCAATTCAATGCAAAAGAATT GGCAATTTTTCACAAAATTAAATCTGTATTTGACCCTAAGTCTTTGCTCAATCCTGGAAAAGCTGTGCCAGAATTACATC GTTGTGCAGAATTGGGTGCGATGCATGTACATCATGGCAAATTGCCTTATCTTGAATTGGAACGCTTTTAA Protein sequence : MKVIQQLLTQLPKGIVLTGKENTRPFECDGLSMYRQNPLAVVLPENIAQIKQVLKICKVNNTPVVTRGAGTGLAGGAMPL EKSIVLGLSKLNRVILIDVKNRLAIVEPGVRNIAISEAVAQHCLYYAPDPSSQIICTIGGNVAENSGGVHCLKYGLTVHN VKAIKILTIDGDELILSRQDDGLGLLALMNGSEGLLGIIIEITVKLTPTPVLARVVMAGFGSVRDCANVVSDIIRDGIIP AGLEMMDSFAIEAAERFAKVGYPLDAKALLLCELDGTQAQVQSELDRVLKVLSSASTLKVSEGEEERLNFWKGRKSAFPA VGRLSPDYYCMDGTIPRRHLADMLEKINELSRKYQLRVANVFHAGDGNLHPLILYDANIEGESEKVEEFGTEILKLSVDM GGTITGEHGVGVEKLNAMCHQFNAKELAIFHKIKSVFDPKSLLNPGKAVPELHRCAELGAMHVHHGKLPYLELERF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-132 | 58 |
