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Name : Ping_3019 (Ping_3019) Accession : YP_944320.1 Strain : Psychromonas ingrahamii 37 Genome accession: NC_008709 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 3718293 - 3720254 bp Length : 1962 bp Strand : - Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein; KEGG: ppr:PBPRA0952 putative cytochrome c-type biogenesis protein CcmF DNA sequence : ATGTTACCTGAAATTGGTCAAGTTGTGCTGGCAATAGCCTGCATGTTTTCATTATTACAAGTCGTTTATCCGCTCTATGG GATTTATGCTCACCAGCAAAGTGCCATTGAATCTGCTAAGATTTTAACTGTTTTACAGTTTGTTTTTGTTGCTTTGTCAT TTATTATCTTAGCTTATTTGTTTCTGGTTAATGATTTTACGGTGGCTTATATTGCTACCAATTCTAACTCAGCGATGCCC TGGTATTACCGCTTGTCTGCCGTCTGGGGAGCACATGAAGGATCGTTACTTTTATGGGTGCTTCTATTGTCAATGTGGAG TATGGCTGTTGCGCTGATGAGTAAACGCTTACCTGTTGAGTCCGTTGCCCGAGTACTCGCTGTATTAGGTTTATTATCAT TGGGTTTTTACTTATTTGTTTTATTAACCTCGAACCCTTTTGATCGCACTCTCCCCTATTTCCCCGTTGATGGCCGGGAT CTTAACCCGCTACTGCAGGATATTGGCCTTATTTTTCACCCACCTATGCTGTATATGGGTTATGTCGGTTTTTCAGTTGC TTTTGCTTTTGCTATTGCGGCACTAATGGAAGGGCGCCTGGACAGTGCCTGGGCTAAATGGTCCCGTCCTTGGACAATAG CTGCCTGGACCTTCTTAACATTAGGTATCGCATTGGGAAGCTGGTGGGCTTATTACGAATTGGGTTGGGGTGGATGGTGG TTTTGGGATCCCGTTGAAAATGCTTCTTTTATGCCCTGGCTTGCCGGTACGGCTTTAATCCATTCGTTAGCGGTGAGTGA AAAACGGGGTGTTTTTAAATCCTGGACAGTGCTACTTGCGATCAGCGCATTTTCATTAAGCTTGCTGGGCACTTTTTTGG TGCGCTCGGGTGTTTTGGTGTCGGTGCACGCCTTTGCAAGTGACCCTACTCGTGGTCTATTTATATTAACCTATTTGATT TTAGTGATTGGTGGTTCATTATTACTTTACGCAGTACAGGCTTCGAAAGTAAAAAGTCGCGGTCGTTATAGTATTATCTC CCGTGAAACTATGCTGCTCAGTAATAATATTTTATTAATCGCGGCGTTAATTGTGGTTTTATTAGGGACACTATTACCGC TTGTCCATAAAGAAATGGGTTTAGGCAGTATTTCGATTGGTGAACCCTTCTTTAACCGTATATTTACTGTTTTGATTGTA CCCTTTGCACTCTTTTTAGGCGTGGGCTCTTTAGTGCGCTGGCAACGTCAGAATCTAACCGATTTGTTTAAACCAATGGT TATTCTATTAGTCGTTAGTACTTTGTTAACGCTTGTTTTTCTAGGAACTCTTGCCTCCCATTTTACCTGGCTTGCTGTAT TAGGCATCTTTCTGGCTATGTGGATATTGACAGGAACTTGTGTGGAGATTTACCTGCGTTCGACACACCGTTTTAGCCTG TGGACAGGTATGCGTAAATTAGGTAACAGTCATTGGGCAATGACTTTGGGTCATGCCGGATTCGCAATTATGTTAATCGG TATTACGATGACCCAAAATTTCTCTATTGAGCGTGATGTTAAATTAAGCGTAGGAGAAAGTGTTCGCTTTGAGCATTACG ATTTTCATTTTGATGCAGTCAATGACCTGCAGGGCAAAAACTACGGCGGCATTGTCGGGAAATTTACCGTTAAATATGAT CAAAAAACGGTCGCCGTTATGGAGCCTGAAAAAAGAATTTATAATGTGCAAAGAACGGCGATGACCGAAGCCGCTATTGA TTCAGGTTTTACCCGTGATTTGTATATCGCAATGGGTGAAGTATTACCGGACGGGGCTTGGTCTGTACGTGTTTATTATA AATCTTTTATACGTTGGATCTGGTTTGGTCCGATGATGATGGCATTGGCGGGTGTTTTGGTGATCTTTGATCGCCGCTAC CGGGTCAAAAAAGTGCCCGAATCAGCAGCGGAGGTTATCTGA Protein sequence : MLPEIGQVVLAIACMFSLLQVVYPLYGIYAHQQSAIESAKILTVLQFVFVALSFIILAYLFLVNDFTVAYIATNSNSAMP WYYRLSAVWGAHEGSLLLWVLLLSMWSMAVALMSKRLPVESVARVLAVLGLLSLGFYLFVLLTSNPFDRTLPYFPVDGRD LNPLLQDIGLIFHPPMLYMGYVGFSVAFAFAIAALMEGRLDSAWAKWSRPWTIAAWTFLTLGIALGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASFMPWLAGTALIHSLAVSEKRGVFKSWTVLLAISAFSLSLLGTFLVRSGVLVSVHAFASDPTRGLFILTYLI LVIGGSLLLYAVQASKVKSRGRYSIISRETMLLSNNILLIAALIVVLLGTLLPLVHKEMGLGSISIGEPFFNRIFTVLIV PFALFLGVGSLVRWQRQNLTDLFKPMVILLVVSTLLTLVFLGTLASHFTWLAVLGIFLAMWILTGTCVEIYLRSTHRFSL WTGMRKLGNSHWAMTLGHAGFAIMLIGITMTQNFSIERDVKLSVGESVRFEHYDFHFDAVNDLQGKNYGGIVGKFTVKYD QKTVAVMEPEKRIYNVQRTAMTEAAIDSGFTRDLYIAMGEVLPDGAWSVRVYYKSFIRWIWFGPMMMALAGVLVIFDRRY RVKKVPESAAEVI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 8e-126 | 58 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-117 | 52 |
