Gene Information

Name : Sputw3181_0550 (Sputw3181_0550)
Accession : YP_961955.1
Strain : Shewanella sp. W3-18-1
Genome accession: NC_008750
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : anion transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 601346 - 602746 bp
Length : 1401 bp
Strand : +
Note : TIGRFAM: anion transporter; PFAM: sodium/sulphate symporter; Citrate transporter; TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit; KEGG: she:Shewmr4_0455 anion transporter

DNA sequence :
ATGTCTTTAACGCAATCAACTACAGTTCCACCAAATAAGACACCTGCAACAGCGGGGCTAGATAAGAAAAAAATGCTGAT
TTTAGCGATTGATATCATCCTATTATTTGCACTCTACTATGGTTTACCCTTCGAGCAAGGAGTCAATACTGGGCTAGCCA
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GTGTTTTTTGGGGTATTTCAAACCCAAGAGGCCATGAGTAATTTTGCTAACCCTATTATTTATTTATTTTTTGGTGGTTT
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TATCGCTTACTCGGCCAACATCGGTGGAATTGGCACTTTGGTTGGTAGCCCTCCGAATGCGATTGCAGCCGCTCAGGCAG
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TGGTACTTTAAGCCAGATCTATCGGTGAAATGCGATCTTAATCTTGAAGATCAACAGCTCACTTTCCAAGGTAAATTTAC
CCTTCTTATCTTCCTTGCGACTGTATGTTGCTGGATTTTCAGTGTGCCTTTAGCCAAGGCGTTAGGGGGCATCTCTCAGT
TTGATACCATAGTCGCCTTGGGAGCCGTTGTTTTACTCTCAGGCTTAGGATTGGTTGGTTGGAAGAAGATTGAATCGACA
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TTTAGCGCACTGGATGACGGATATTTTTGGCAGCACCCATATGTCATTATTCGTTTTTGCGGTAATCGCTTTCGTGGTGA
TGTTAACGGAATTTGCCAGTAATACGGCGAGTGCTGCACTGTTAGTGCCTGTTTTTGCCGCTATTGCAGAGGCGTTAGGT
GTATCCCCTGTGATGTTATCTGTCTTGATTGGTATCGCTGCTTCCTGTGCTTTTATGCTGCCTGTTGCGACGCCACCCAA
TGCTATCGTGTATGGCTCTGGTCATATTAAGCAATCAGAAATGGTGCGGGTGGGTATGATAATTAACTTTATCAGTATGA
TTGTATTAGGGATTATCGCCCATACCTTCTGGGATGTATAA

Protein sequence :
MSLTQSTTVPPNKTPATAGLDKKKMLILAIDIILLFALYYGLPFEQGVNTGLAILVFAAVLWLTEAIHISITAILVPILA
VFFGVFQTQEAMSNFANPIIYLFFGGFVLAAALHHQKIDTLIAQKLLLASKGKLSIACLMLFGVTALLSMWISNTATAAM
MLPLALGILQQLDRDKYHNTYVFLLLGIAYSANIGGIGTLVGSPPNAIAAAQAGLSFSDWLKFGIPTVILMMPMMLIALY
WYFKPDLSVKCDLNLEDQQLTFQGKFTLLIFLATVCCWIFSVPLAKALGGISQFDTIVALGAVVLLSGLGLVGWKKIEST
TDWGVLILFGGGLTLSAVLKTTGTSVFLAHWMTDIFGSTHMSLFVFAVIAFVVMLTEFASNTASAALLVPVFAAIAEALG
VSPVMLSVLIGIAASCAFMLPVATPPNAIVYGSGHIKQSEMVRVGMIINFISMIVLGIIAHTFWDV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf77 AAO17231.1 Orf77 Not tested tcd island Protein 1e-103 59