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Name : cycK (BARBAKC583_0432) Accession : YP_988750.1 Strain : Bartonella bacilliformis KC583 Genome accession: NC_008783 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CycK Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 434255 - 436234 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF01578 DNA sequence : GTGCTCATTGAATTGGGTCATATTTTTTTAGCCACAGTATTTGCAGTGAGTTTACTGCAGGTATTTTTATCCATTTTTGG TGTTGTGAGAGAAGAATATTCATTGATGCAGGCAGTGGTATCACTGACTTATATTCTCTTCATATTATTGCTTTTGTCCT TTTTGATTATTGTTCACGCTTATGTAATATCTGACTTTTCTGTTTTGAATGTTGTTAGGAATTCTCATTCAGAAAAACCA ATGCTTTATAAGATTGTTGGGGTTTGGGGTAATCATGAAGGATCAATGTTATTATGGGTTTTAATCTTAGCTTTTTTTAG TTTATTGGTTGCTTTGTTTGGACAAAAATTACCAGTGCAATTTAAGGCATCAGTCTTAGGTTGCCAAAGTTTGATAACAA GTGCTTTTCTTTTATTTATTCTTTTTTTATCCAATCCATTTTTACGGATTAATCCACCAGCGTTGCAAGGAAGTGATCTT AATCCTGTTTTACAAGATATTGCTTTAGCCATTCATCCGCCGCTTCTTTATTTAGGCTATGTTGGTTTCTCGGTTTGTTT TTCTTTTTCGGTAGCTGCATTGATTACAGGATATGTCGATAGGGTTTGGGCACGTTGGGTACGGCCGTGGGTTCTTCTCG CATGGATTTTTTTGACACTTGGTATTATGGTTGGGTCATATTGGGCTTACTATGAGTTGGGTTGGGGTGGTTATTGGTTT TGGGATCCTGTTGAGAATGTTTCATTCATGCCATGGCTTGCTGGAACAGCTCTTTTGCACTCTATTCTTGTTCTTGAAAA GCGGGGTGCGCTGAAAAACTGGACTTTATTTTTAGCTATTCTTACTTTTTCACTTTCTCTTATGGGAACTTTTCTTGTTC GTTCAGGTATTTTAATATCTGTTCATAGCTTTGCTGTTGATCCAGCACGTGGATGGGCACTTCTTTCTATTTTGTTTTTT TTCACAGGGAGCGCTTTTTTGCTTTTTGCTTTGCGGGCACCTATTTTGAAAACAGATGGATTTTTTTTGCCAATTTCGCG AGAGGGATTTATTGTTTTAAATAATTTATTTCTCACAACAGCAACAGCAACAATATTGATTGGTACGCTATATCCCTATT TTTTTGAGACGTTAACTGGGCAAAAAATTTCTGTAGGTGCTGCTTTTTTTAACCTTACATTTGGGCCTTTAATGGTGCCG CTATTATTTTTTGTTCCATTTGGACCGATTATAGCGTGGAAGCGTGGTGATTTACTAGCGGTTTTTGAACGATTATGGTT TGTGTTTTTACTATCCTGTATAGCCTGCTTTATAACATTTTATGCAGCATCTTGGCGTGATATTTTTTGCGCTTTAGGAG TGGGGCTTTCAGTTTTCGTTTTTTTGGGTGGTTTGGCTGATCTTTGGGTAAAAAGTGGCCATAGAAAGACACCTTTTTTT GTACGGATTAAGAGGTTTTTAGGATTACCATGGTCCGTTTTTGGTGCCGCGTTAGCACATATGGGATTAGGTATCACACT GTTTGGTATTGTTTATTCTTCACTTTTTGGACAAGAACGTATCTTAGTCATGAAAATAGGCGATAGTATTACGATGGCTG ATAAAGTAATACGTTTTGATGAAGTGCGGAATGTCGCTGGATCAAACTATTCTGCAATGCAGTTTGATTTTAAAATATAT GAAAATCAAAACTCAATACACACTATGACAGCATCAAAACGATTTTATTCTAGTCAAAATATATCAACAACGAAAGTTGG TATTCAAAGTTATGGTTTTTCTCAATTTTATATTGTGCCAGGTCGTATTGATGACCAAGGTCTTGCTTTGCATATATGGT GGAAACCTTATGTGATTTGTATTTGGTTCGGTGCCTTTATGATGGCAATAGGTGGGTGTTTTTCTCTTTTAAATTATTGG TCTCGGATAAATATACGTCAACGGAGGGGTATTGGCTTCAAACGCACTGAGAAGGGATGA Protein sequence : MLIELGHIFLATVFAVSLLQVFLSIFGVVREEYSLMQAVVSLTYILFILLLLSFLIIVHAYVISDFSVLNVVRNSHSEKP MLYKIVGVWGNHEGSMLLWVLILAFFSLLVALFGQKLPVQFKASVLGCQSLITSAFLLFILFLSNPFLRINPPALQGSDL NPVLQDIALAIHPPLLYLGYVGFSVCFSFSVAALITGYVDRVWARWVRPWVLLAWIFLTLGIMVGSYWAYYELGWGGYWF WDPVENVSFMPWLAGTALLHSILVLEKRGALKNWTLFLAILTFSLSLMGTFLVRSGILISVHSFAVDPARGWALLSILFF FTGSAFLLFALRAPILKTDGFFLPISREGFIVLNNLFLTTATATILIGTLYPYFFETLTGQKISVGAAFFNLTFGPLMVP LLFFVPFGPIIAWKRGDLLAVFERLWFVFLLSCIACFITFYAASWRDIFCALGVGLSVFVFLGGLADLWVKSGHRKTPFF VRIKRFLGLPWSVFGAALAHMGLGITLFGIVYSSLFGQERILVMKIGDSITMADKVIRFDEVRNVAGSNYSAMQFDFKIY ENQNSIHTMTASKRFYSSQNISTTKVGIQSYGFSQFYIVPGRIDDQGLALHIWWKPYVICIWFGAFMMAIGGCFSLLNYW SRINIRQRRGIGFKRTEKG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 5e-86 | 41 |
