|
Name : APL_1252 (APL_1252) Accession : YP_001053943.1 Strain : Actinobacillus pleuropneumoniae L20 Genome accession: NC_009053 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0471 EC number : - Position : 1438796 - 1440184 bp Length : 1389 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTCAAAAACTACAAAGAGCCCTATGCGAGGCGTTATTATCTTGACGCTCGATTTAATTTTGTTTTTTCTCTTGTTGAA ATGGTTACCTTTTTCTCCGCAAGAAAATAGAGGATTGGCATTGTTAATTTTTGTCGGCATACTTTGGCTGACGGAAGCAT TTAATATTACGGTTACCTCTCTTATGGTACCTATCTTCGCCATCTTCCTGAACGTCTTGTCCACTAAAGCGGCTTTCGCA CCTTTTTCCGAACCTATCATCTTTATGTTTTTTGGCGGCTTTGTTATTGCGGCCGTATTAAATATCCATCAAATCGATCT TTGGATTGCCAACCACGTAATACGGTTAGCGAAAGGCAATTTAAAACGTACCATCATTTACTTATTTGCGGTAACCGCCG GGCTTTCTCTTTTTATTAATAACACCGCAGTTGCCGCTTTGATGTTGCCGCTTTCGTTAGGAATCCTGCATCAATTGGAT TTTAAGGAACATCGTAAAATCTACGTTTTCGTATTGCTTGGTATTGCGTTCAGTTCCAGTATCGGCGGGATGGGAACGGT CGTCGGCTCGGCACCGAATGCGATTTTGGCTTCATATATTAAAGTATCTTTCTCAGAATGGCTCGCTTATGGGATGCCGG TTGCAATTCTATTAATGATTTCAATGGTCATTGCATTACTTGCGGTACTTCGCCCGAATTTTAACGTACCGTTTGAAGCG AAGGTGGAAAATATCCCATTAACGCCTAAACGTTTAACCACGCTAATTGTATTTTGTGTTACGGCGGTTTTACTGACTTT CAGTAGTGCGATTGAACCGATTGTGCGCCAAGTCTTAGAACTAAAAGAATCGATTAAAAGTTTCGATGCGGTGATTGCTA TGGTTGCTGTCGTGGTGCTTTGTATTACCAATACCGCGACATGGTCGCAAATTCAAGAACGTGCCGAATGGGGCGTATTA ATGCTATTCGGCGGTGGTTTAACGCTAGGCATCGTCTTGAAAGATACCGGAGCAAGCAAAATTTTAGCTGACGGTATTGT GAATTATATTGGTAACAAACACTGGTTAATTATGACATTATCAATGGCGGCATTTATTGTTTTCTTAACCGAATTTACCT CTAATACGGCTAGTGCGGCGTTGATGATGCCGATTTTTATTTCCGTCGCCAATTCACTTGGCTTGCCGCCGATTTCATTG GCGGCGATTATCGCTTGCGGTGCGTCTGCCGCTTTTATGTTGCCGATTGCTACGCCGCCGAATGCGATTGTGTTTGCAAC AGGTTATATTAAGCAAAGCGAAATGGTTAAAGTCGGGCTGATTCTGAATTTATTATGTGTTGCGATTTTAGGCTGTATGT CATATTTCTTCTGGACGACGTGGTGGTAA Protein sequence : MSKTTKSPMRGVIILTLDLILFFLLLKWLPFSPQENRGLALLIFVGILWLTEAFNITVTSLMVPIFAIFLNVLSTKAAFA PFSEPIIFMFFGGFVIAAVLNIHQIDLWIANHVIRLAKGNLKRTIIYLFAVTAGLSLFINNTAVAALMLPLSLGILHQLD FKEHRKIYVFVLLGIAFSSSIGGMGTVVGSAPNAILASYIKVSFSEWLAYGMPVAILLMISMVIALLAVLRPNFNVPFEA KVENIPLTPKRLTTLIVFCVTAVLLTFSSAIEPIVRQVLELKESIKSFDAVIAMVAVVVLCITNTATWSQIQERAEWGVL MLFGGGLTLGIVLKDTGASKILADGIVNYIGNKHWLIMTLSMAAFIVFLTEFTSNTASAALMMPIFISVANSLGLPPISL AAIIACGASAAFMLPIATPPNAIVFATGYIKQSEMVKVGLILNLLCVAILGCMSYFFWTTWW |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf77 | AAO17231.1 | Orf77 | Not tested | tcd island | Protein | 3e-92 | 51 |
