Gene Information

Name : Sputcn32_3393 (Sputcn32_3393)
Accession : YP_001184903.1
Strain : Shewanella putrefaciens CN-32
Genome accession: NC_009438
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : anion transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 3949466 - 3950866 bp
Length : 1401 bp
Strand : -
Note : TIGRFAM: anion transporter; PFAM: sodium/sulphate symporter; Citrate transporter; TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit; KEGG: she:Shewmr4_0455 anion transporter

DNA sequence :
ATGTCTTTAACGCAATCAACTACAGTTCCACCAAATAAGACACCTGCAACAGCGGGGCTGGATAAGAAAAAAATGCTGAT
TTTAGCGATTGATATCATCCTATTATTTGCACTCTACTATGGTTTACCCTTCGAGCAAGGGGTCAATACTGGGCTAGCCA
TTCTGGTATTTGCGGCAGTTCTGTGGCTAACAGAAGCTATTCATATCAGCATTACAGCGATTTTAGTCCCTATACTTGCT
GTGTTTTTTGGGGTATTTCAAACCCAAGAGGCCATGAGTAATTTTGCTAACCCTATTATTTATTTATTTTTTGGTGGTTT
CGTGTTGGCCGCGGCTTTGCATCATCAAAAAATTGATACCTTAATCGCGCAAAAGCTGTTGCTAGCCTCAAAGGGGAAAC
TCAGCATAGCTTGTTTGATGTTATTTGGTGTGACAGCATTATTATCTATGTGGATAAGTAACACTGCGACAGCAGCGATG
ATGTTACCGCTAGCCTTAGGGATTTTGCAGCAGTTAGATCGCGACAAATACCACAACACTTACGTATTTTTACTGCTTGG
TATCGCTTACTCGGCCAACATTGGTGGAATTGGCACTTTGGTTGGTAGCCCTCCGAATGCGATTGCAGCCGCTCAGGCAG
GGTTGAGTTTTAGTGATTGGTTAAAGTTTGGTATTCCAACCGTGATTCTGATGATGCCGATGATGTTGATTGCTTTGTAC
TGGTACTTTAAGCCAGATCTATCGGTAAAATGCGATCTTAATCTTGAAGATCAACAGCTCACTTTCCAAGGTAAATTTAC
CCTTCTTATCTTCCTTGCGACTGTATGTTGCTGGATTTTCAGTGTGCCTTTAGCCAAGGCGTTAGGGGGCATCTCTCAGT
TTGATACCATAGTCGCCTTGGGAGCCGTTGTTTTACTCTCAGGCTTAGGGTTGGTTGGTTGGAAGAAGATTGAATCGACA
ACCGATTGGGGTGTATTAATTCTCTTTGGTGGCGGTTTAACCTTAAGTGCCGTGCTTAAAACCACGGGAACGAGTGTCTT
TTTAGCGCACTGGATGACGGATATTTTTGGTAGCACCCATATGTCATTATTCGTTTTTGCGGTAATCGCTTTCGTGGTGA
TGTTAACGGAATTTGCCAGTAATACGGCGAGTGCTGCACTGTTAGTGCCTGTTTTTGCCGCTATTGCAGAGGCGTTAGGT
GTATCCCCTGTGATGTTATCTGTCTTGATTGGTATCGCTGCTTCCTGTGCTTTTATGCTGCCTGTTGCGACGCCACCCAA
TGCTATCGTGTATGGCTCTGGTCATATTAAGCAATCAGAAATGGTGCGGGTGGGTATGATAATTAACTTTATCAGTATGA
TTGTATTAGGGATTATCGCCCATACCTTCTGGGATGTATAA

Protein sequence :
MSLTQSTTVPPNKTPATAGLDKKKMLILAIDIILLFALYYGLPFEQGVNTGLAILVFAAVLWLTEAIHISITAILVPILA
VFFGVFQTQEAMSNFANPIIYLFFGGFVLAAALHHQKIDTLIAQKLLLASKGKLSIACLMLFGVTALLSMWISNTATAAM
MLPLALGILQQLDRDKYHNTYVFLLLGIAYSANIGGIGTLVGSPPNAIAAAQAGLSFSDWLKFGIPTVILMMPMMLIALY
WYFKPDLSVKCDLNLEDQQLTFQGKFTLLIFLATVCCWIFSVPLAKALGGISQFDTIVALGAVVLLSGLGLVGWKKIEST
TDWGVLILFGGGLTLSAVLKTTGTSVFLAHWMTDIFGSTHMSLFVFAVIAFVVMLTEFASNTASAALLVPVFAAIAEALG
VSPVMLSVLIGIAASCAFMLPVATPPNAIVYGSGHIKQSEMVRVGMIINFISMIVLGIIAHTFWDV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf77 AAO17231.1 Orf77 Not tested tcd island Protein 1e-103 59