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Name : Sputcn32_3724 (Sputcn32_3724) Accession : YP_001185231.1 Strain : Shewanella putrefaciens CN-32 Genome accession: NC_009438 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 4340521 - 4342500 bp Length : 1980 bp Strand : - Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein; KEGG: shm:Shewmr7_0229 cytochrome c-type biogenesis protein CcmF DNA sequence : ATGATCCCAGAACTTGGACACTTTTCGTTGATAATCGGAGTGGCTTTTGCCTTTCTGCTCGTCAGCGTTCCCCTTATTGG TGTTGCCCGTAAAGATCAATATCTTGTGAGGTATGCTTGGCCGTTAGCTTACGGAATGTTCTTTTTTATCAGTTTATCCG TTGTTTCACTTGGTTATAGCTTTGCTGTTGATGATTTCTCCGTCGCTTATGTGGCTCATCACTCTAACTCCCAGTTACCT ATCTTCTTTAAGATTGCGGCCGTATGGGGCGGTCACGAAGGGTCGCTGCTATTTTGGGTGTTTTCATTAGCAACTTGGGC CGCTTCTGTTGCTTTATTCAGTAAAGGTTTAGAAGAAGTGTTCACCGCACGTGTACTTGCAGTTCTGGCAGTAATCGTGA TTGGTTTTAGTTTGTTTATGTTGCTCACATCAAGCCCATTTGAGCGTTTATTCCCCATGCCTGCAGAAGGTCGTGACTTA AACCCAATGCTGCAGGATGTGGGCTTAATATTCCATCCACCTATGCTGTATTTGGGCTATGTTGGTTTTTCTGTAAGCTT TGCTTTTGCTATTGCGGCATTGATGAGTGGACGTCTTGATTCTGCATGGGCTCGTTGGTCTCGTCCTTGGACCTTGGCTG CATGGGTATTCCTCACGGGCGGTATTTCTTTAGGCTCTTGGTGGGCATATTACGAATTAGGCTGGGGTGGTTGGTGGTTC TGGGATCCTGTTGAGAATGCCTCTTTCATGCCTTGGTTAGTGGGTACTGCGCTTGTGCACTCTTTGATTGTGACCGAGAA ACGCGGTGCCTTCCGTAACTGGACGGTATTGCTTTCCATCTTTGCTTTCTCTTTAAGCTTGCTTGGTACCTTTATTGTTC GCTCTGGCGTATTAACCTCAGTGCATTCATTTGCGGCAGATCCAAGCCGTGGTATGTTCATTCTGTTGTTACTTGGTTTA GCCATTGGTGGTTCTTTAACACTCTTTGCTTTCCGTGCCAGCGAAATGAGTAGCCCAGCACGTTTCGAGTTGAAGTCTAA AGAAACTATGCTGCTGATTTGTAACGTTCTGTTGACTGTTGCTACAGGTACTGTGTTATTAGGCACTTTATACCCACTGC TGATTGATGCACTTGGTATGGGTAAAATTTCTGTAGGGCCTCCATATTTCAATGCTGTATTTGTGCCTATCGTTTTAGTG TTGTTTGCTTTTATGGGTGTAGGTCCAATTATTCGCTGGAAAAAATCGAAGGCTGGCGAGCTTAGACGCCAACTACTGAT CCCAGCTCTAATTTCTGTCGCGATAGGGATAGTGACACCATTTATAGTTGATGGTGCATTTAACGCGTGGGTTGCATTTG GTATTGCAGCGGCGGTATGGATCATACTTGCTACGGCAAGAGCCGCTTATAATATTGTTAAACCTAAAGAAGGTGATATT AGTGTTGCTCGTATGGGGCGCAGTCAATTTGGGATGATCTTGGCCCACTTCGGCATTGCCGTCTCTGTTATTGGTGCCAC TATGGTATCTAACTATTCAGTTGAGAAAAGTGTCCGTATGGGACCAGGGGTTAGTCAAGAGTTAGCTGGTTATACCTTTA AGTATTTAGAGACAAAAAATGTCGTTGGCCCAAATTACACAGCTCAGCAGGGGCAAATTGAAATCTATAAAGATGACAAA TTGTTAACACTGCTAAAGCCTGATCGCCGTCAATACAATGTACGAACCATGGATATGACCGAAGCTGGTATTGATTGGGG TCTGTTCCGTGATTTGTATGTGACTATGGGTGACCCTATCAGTGCAACAGAGTTTGCGGTACGTTTGAACTATAAACCCT TTGTCCGTTGGTTGTGGTTTGGATCGATTTTTATGATGATTGGTGGTTTCTTCGCTGCATCAGATAAGCGTTATCGCTCA AAAGTGGCGGCGATTGTTAAGCCACAAGTAGATAAAGCTAAACTGGCAACCGCTCAATAG Protein sequence : MIPELGHFSLIIGVAFAFLLVSVPLIGVARKDQYLVRYAWPLAYGMFFFISLSVVSLGYSFAVDDFSVAYVAHHSNSQLP IFFKIAAVWGGHEGSLLFWVFSLATWAASVALFSKGLEEVFTARVLAVLAVIVIGFSLFMLLTSSPFERLFPMPAEGRDL NPMLQDVGLIFHPPMLYLGYVGFSVSFAFAIAALMSGRLDSAWARWSRPWTLAAWVFLTGGISLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASFMPWLVGTALVHSLIVTEKRGAFRNWTVLLSIFAFSLSLLGTFIVRSGVLTSVHSFAADPSRGMFILLLLGL AIGGSLTLFAFRASEMSSPARFELKSKETMLLICNVLLTVATGTVLLGTLYPLLIDALGMGKISVGPPYFNAVFVPIVLV LFAFMGVGPIIRWKKSKAGELRRQLLIPALISVAIGIVTPFIVDGAFNAWVAFGIAAAVWIILATARAAYNIVKPKEGDI SVARMGRSQFGMILAHFGIAVSVIGATMVSNYSVEKSVRMGPGVSQELAGYTFKYLETKNVVGPNYTAQQGQIEIYKDDK LLTLLKPDRRQYNVRTMDMTEAGIDWGLFRDLYVTMGDPISATEFAVRLNYKPFVRWLWFGSIFMMIGGFFAASDKRYRS KVAAIVKPQVDKAKLATAQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 3e-133 | 54 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-115 | 50 |
