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Name : Fjoh_1164 (Fjoh_1164) Accession : YP_001193516.1 Strain : Flavobacterium johnsoniae UW101 Genome accession: NC_009441 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ABC transporter-like protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 1313351 - 1315501 bp Length : 2151 bp Strand : + Note : PFAM: ABC transporter, transmembrane region; ABC transporter related; peptidase C39, bacteriocin processing; SMART: AAA ATPase DNA sequence : ATGGCTTCAATAAAAATAAAACAACATGATATTAAAGATTGTGGCGCTGCTTGTCTGGTTTCTATTGGGAACTATTTTAA AGTTAATTTGCCCATAGCTAGAATACGTCATTATGCAAATACGGATAAACGTGGTACAAATGTGCTGGGAATAATTGAGG CTGCTGAAAAAATGGGTTTTATGGCAAAAGGCGTAAAAGGAAATTTAGATGCCATAAATAAAATTCCGCTTCCAGCTATT GCACATATTGTTACAAAAGAGCAGCTTCATCATTATGTTGTAGTTTATAAAATCGAAAAATCGAAAATTACAGTCATGGA TCCTGGGTATGGAAAAATGGAAGTTTATAATTTTGATGAATTTCAAAAAATATGGTCAGGAGTGCTAATACTTTTTGCTC CAAATGATGATTTTAAAATTAGAAACGAAAAAACTTCACCACTAAAAAGGTTTTGGAACTTAATTCAGCCGCATAAAACG ATTTTAATTCAGGCTTTAGTCGGAGCAATATTGTTTACCGTTTTAGGATTGGCAATGTCAGTTTACATACAAAAAATTAC AGATTATGTTTTAGTAGATGGAAATAGAAAACTATTAAATTTATTAAGTGTTTCTATGATTACACTTATTTTGCTTCAAT CTTATATTAATTCAAAGAAAAGCATATTTGTAATGAAAACGGGGCAATTAATAGATGCTCAATTAATTCTTGGTTATTAT AAGCATTTACTTCATTTGCCGCAACGTTTTTTTGATACTATGCAAATAGGAGAAATTACATCCAGAATAAACGATGCGGT AAAAATTCGTTCTTTTATAAATGAAGTGGCAATAGAAATGATTGTAAATGTTTTTATTGTCATTTTTTCATTTGTATTGA TGTTTACCTATTATTGGAAACTAGCTTTAGTTATTATTCTTGTTATACCTTTTTACATTTCTATATATTTTTTATTAAAT AAATTTAATAAAAAAGTAGAACGAAGCATTATGGAAAATGCTGCAGAATTACAAACTCAATTAGTAGAAAGCATTACCCA TATCAGAACAGTAAAAGAATTTGGAATCGAAGAGTTTTCGAATTTTAAAACTGAAAACAAATTTGTAAAACTTTTATTCT TTACTTATAAATCGGGTTTAAATGGAATTTTTGCGGCAACTTCAACGCAGTTTCTTGCTTCTCTATTTACTATAATTTTA ATGTGGATTGGCTCCGGTTATGTTATAGATCGAGAGATTACTCCTGGGGAATTATTTTCATTTTATGCGTTAATTGGATA TTTTACTTCTCCAGTTGCTTCGCTGATTAATATGAACAAAACATCACAAAACGCCTTAATCGCTGCAGAAAGGCTTTTTG AGATTATGGATTTAGAAAGAGAAGAAACAGAAAATAAAGTCGAATTACAAAAAGAAAACTTAGGAGATATAAAATTTGAA AACGTTTCTTTTCGTTATGGATCACGATTAGAAGTTTTTAAAAAATTTAATGCAGTATTTAAAAAGAATCAAACAACAGC TATAGTTGGGGAGAGTGGTAGTGGGAAGACAACATTGATTTCACTACTTCAGAACTTATACCCAATAAAAGAAGGGGAAA TTCTAATTGGCCAATATGATATTAAATTTATTCATTATCAAAGTTTAAGAAAAATGATTGGAGTTATTCCGCAACAGTTG AATTTATTTTCAGGAAATATTATCGAAAACATCGCTTTGGGAGATTCGTTTCCAAATATTCAAAGAGTCTTAGATTTATC GAAAGAATTAGGAATAACTGATTTTGTAGAAAAACTACCAAATGGTTTTGAAACGCAGATTGGTGAAAACGGAACAATGC TTTCGGGAGGACAAAAACAAAGAATTGCCATTGCAAGAGCATTATATAAAAAACCAGAAATTTTACTAATGGATGAAGCA ACAGCTTCGTTAGATACTAATTCAGAAGGAATAGTAAAAAGAGTGATTGACAAATTCAAAACACAAGAGAAAACGATAAT AGTTATAGCACATCGTTTAAGTACAATCGCAAATGCCGATACAATATTAGTTATGAAAAATGGAGAAATTATTGAATCAG GAAATCATTTAGAATTGTTGGAACAAAAATCAGAATATTATAATTTATGGAATAAACAGAATTTGCTTTAA Protein sequence : MASIKIKQHDIKDCGAACLVSIGNYFKVNLPIARIRHYANTDKRGTNVLGIIEAAEKMGFMAKGVKGNLDAINKIPLPAI AHIVTKEQLHHYVVVYKIEKSKITVMDPGYGKMEVYNFDEFQKIWSGVLILFAPNDDFKIRNEKTSPLKRFWNLIQPHKT ILIQALVGAILFTVLGLAMSVYIQKITDYVLVDGNRKLLNLLSVSMITLILLQSYINSKKSIFVMKTGQLIDAQLILGYY KHLLHLPQRFFDTMQIGEITSRINDAVKIRSFINEVAIEMIVNVFIVIFSFVLMFTYYWKLALVIILVIPFYISIYFLLN KFNKKVERSIMENAAELQTQLVESITHIRTVKEFGIEEFSNFKTENKFVKLLFFTYKSGLNGIFAATSTQFLASLFTIIL MWIGSGYVIDREITPGELFSFYALIGYFTSPVASLINMNKTSQNALIAAERLFEIMDLEREETENKVELQKENLGDIKFE NVSFRYGSRLEVFKKFNAVFKKNQTTAIVGESGSGKTTLISLLQNLYPIKEGEILIGQYDIKFIHYQSLRKMIGVIPQQL NLFSGNIIENIALGDSFPNIQRVLDLSKELGITDFVEKLPNGFETQIGENGTMLSGGQKQRIAIARALYKKPEILLMDEA TASLDTNSEGIVKRVIDKFKTQEKTIIVIAHRLSTIANADTILVMKNGEIIESGNHLELLEQKSEYYNLWNKQNLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 1e-124 | 42 |
