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Name : ccmF (COSY_0258) Accession : YP_001219111.1 Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA Genome accession: NC_009465 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 259120 - 261027 bp Length : 1908 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAATTGAAATTGGACATTTTGCATTGGTACTTGCGTTGGTGTTTGCAATGTTACAAGTGATTTTACCAACTATAGG TATGATTAAGTACGATGTTGTACTTTCTAGCTTATCTAGACCCTTGTTATGGATGCAATTCTTTTGGATACTGATTGCTT TTGTTATTCTTGTTAATGCTTTTGTTGTGGATGATTTCTCTGTTAGATACGTAGCAAGTAATTCAAATACTCAATTGCCC AATATTTTTAAAATGTCAGCTATTTGGGGTGCACATGAGGGGTCTTTGTTATTATGGGCTTTGATTTTAGCCGCTTGGAG TGTAGCAGTATCTTTATTTTCTAGACGTTTACCTGTTGAAGTATTAAACCATATTTTAATTATTCTTGGTTTAATTAGTA TTGGGTTTTTGTTGTTTTTGTTATTAACTTCTAATCCTTTTGAGCGTTTAGATATTGTGCCATTACAAGGCCGAGAACTT AACCCTTTGTTACAAGATTTTGGTTTAATTATTCATCCCCCTATGTTGTATATGGGTTATGTGGGAATGGCTATCCCTTT TGCTTTTGTTGTATCATCACTGATTCGTGGACAGTTAGATTCTACTTGGCTTAGGTGGTCACGCCCTTGGACGTTAATAG CATGGGCATTTTTAACGCTTGGAATCACACTTGGTTCTTGGTGGGCGTATTATGAACTTGGTTGGGGTGGTTGGTGGTTC TGGGATCCAGTAGAAAATGCTTCATTTATGCCATGGTTAGTGGCAACAGCATTGGTTCATTCTTTAAGTGTGAGTGAAAA GCGCAGTGCATTTAAACACTGGACTGTTCTATTGGCTATTTCTAGTTTTTCGTTAAGTTTATTAGGTACTTTTTTAGTTA GATCAGGTATCCTTACTTCAGTGCATTCATTTGCTACTGACCCTGATAGGGGTTTATTTGTTTTGATATTTTTAGTGATT GTGATTGGTGGCTCGTTAGTATTATATGCTTGGCGTGCTACTTTACTCATGCAAAGTAGTAATACCTTTTCTCTTTTATC AAGAGAGAGCGGTTTACTAGTTAACAATATATTATTAGTAGCTTCAATGTTAAGTGTTTTTTTAGGCACATTCTATCCAC TACTATTGGATGCATTAGGTTTGGGTAAAATTTCAGTAGGCGCACCTTATTTTGGTTCAGTGTTTGTACCTATTATGATT TTGGCAATATTGATTATGGCGATTATCCCCTTTTTACGTTGGAAGGAAGATACTACACAAAGAGTGGTTGACTTACTAAA GCGGGTTTGGATAGGTGTAGGTTTGTTGTTTGTGATTAGTGTATTTTTGATCGATAATATTTTAGTTTTGCTAGCCGTTT TTTTATTTATTTGGATAGTTTCACATTCATTAGTACTTTTGTTTCAAAGGTTAGGACAAAAAGGCAGTATAAATCTTGCT TTCATTGGCATGATCTTTGCTCATATTGGTATTGCCGTATTCTTATTAGGTGCTACAGTTACAACCCAATACGGCGTTGA AAAAGATATACAAATGGAAATTGACAAACCAATAACTATAAAAGGTTATGACTTTATTTTTAAAGGTGTGACACGTTTAT TTGGTCCAAATTATCAAGGAAATAAAGGTCATGTAGAGGTTTATTTTGAGGATGAAAAAATAGCAGATTTGAGACCTGAA AAACGCCAATACACTACAGGTATGCCAATGACTGAAGCGAGTATTGATTCATCATTATATCGTGATATTTATATTGCATT AGGTGAATCCTTAGAAGATGATTCATGGAGTTTAAGAATTTATTATAAACCTCTTGTGCGCTGGATTTGGTTGGGAGGTT TATTGATTTCATTAGGTGCGTTACTAAGTGCATTTGACAGAAGATATCGATTGAGAATAAAAGAATGA Protein sequence : MLIEIGHFALVLALVFAMLQVILPTIGMIKYDVVLSSLSRPLLWMQFFWILIAFVILVNAFVVDDFSVRYVASNSNTQLP NIFKMSAIWGAHEGSLLLWALILAAWSVAVSLFSRRLPVEVLNHILIILGLISIGFLLFLLLTSNPFERLDIVPLQGREL NPLLQDFGLIIHPPMLYMGYVGMAIPFAFVVSSLIRGQLDSTWLRWSRPWTLIAWAFLTLGITLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASFMPWLVATALVHSLSVSEKRSAFKHWTVLLAISSFSLSLLGTFLVRSGILTSVHSFATDPDRGLFVLIFLVI VIGGSLVLYAWRATLLMQSSNTFSLLSRESGLLVNNILLVASMLSVFLGTFYPLLLDALGLGKISVGAPYFGSVFVPIMI LAILIMAIIPFLRWKEDTTQRVVDLLKRVWIGVGLLFVISVFLIDNILVLLAVFLFIWIVSHSLVLLFQRLGQKGSINLA FIGMIFAHIGIAVFLLGATVTTQYGVEKDIQMEIDKPITIKGYDFIFKGVTRLFGPNYQGNKGHVEVYFEDEKIADLRPE KRQYTTGMPMTEASIDSSLYRDIYIALGESLEDDSWSLRIYYKPLVRWIWLGGLLISLGALLSAFDRRYRLRIKE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 4e-112 | 52 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 9e-107 | 50 |
