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Name : glcD (COSY_0294) Accession : YP_001219147.1 Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA Genome accession: NC_009465 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate oxidase subunit GlcD Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0277 EC number : 1.1.3.15 Position : 296934 - 298364 bp Length : 1431 bp Strand : + Note : (S)-2-hydroxy-acid oxidase, FAD-linked subunit DNA sequence : ATGACAATTGTTAATCAATTAACTCGTGCCTTCCCTAAGGGTATTGTACTTACGTCTAACGAAAATACACGACCATTTGA ATGCGATGGTCTAAGTGTGTACAGACAAAAGCCTTTGGCGGTAGTATTGCCAGATAATGTTATGCAAATTAAGCAAGTAT TAAAAATTTGCAAGATTAATAACATACCAATTGTAACACGGGGTGCAGGGACGGGTTTATCTGGCGGGGCGATGCCACTT GAAAAATCTATTGTGTTAGGGTTGTCTAAATTAAATAAGGTGAAATTAATTGATGTTGAAAATCAATTAGCTGTGGTTGA GCCAGGTGTAAGGAATATTGCTATTAGTGAAGCAGTGGCACAATACGGGTTGTATTATGCTCCAGATCCATCTAGCCAAA TTGCTTGTACAATTGGTGGTAATGTGTCTGAAAATTCTGGTGGAGTGCATTGTTTAAAATATGGGTTAACAGTGCATAAT GTTGAAGCAATTAGAATGTTAACTATCGATGGTGATGAATTAATATTATCTTGTCAAGATGATGGGTTGGGACTATTGGC ACTAATGAATGGTTCTGAAGGTTTGTTAGGTGTTATTACCGAAGTTACAGTTAAGCTTACGCCAAATCCTGCATTTGTTA AGATGGTAATGGCAGGGTTTGATTCTGTTCGAGATTGTGCTAATGCAGTGACTAATATTATTAAGGCAGGTATTATTCCT GCTGGGTTGGAAATGATGGACAGTTTTGCCATTAAAGCAGCTGAAGGATTTGCTCAAGTGGGTTATCCTTTAGATGCTAA GGCGTTATTGCTTTGTGAACTTGATGGTATACAAACGCAAGTTCAATTAGAGCTTGATAATGTGTTAAAAATTTTATCAG GAGCATCGACTTTAAAAGTATCTGAAAGTGAAGAAGAACGACTTAATTTTTGGAAAGGACGTAAGTCTGCTTTTTCTGCG GTAGGTACACTATCTCCTGATTATTATTGTATGGACGGCACTATTCCGCGTCGTTATTTGGCAGATATGTTGGAAAAAAT TCACAAGTTGAGCAAGAAATATCAACTTAGAGTTGCTAATGTTTTTCATGCTGGTGATGGTAATTTACATCCACTTATTT TATATGATGCTAATGTGACAGGAGAGTTAGAAAGGACTGAAGAATTTGGCACTGAAATCTTAAAACTTAGTGTGGATATG GGAGGTACAATTACAGGCGAGCATGGTGTCGGTGTAGAAAAATTAAATGCTATGTGTCATCAATTTAACACGCAAGAATT AGAAATTTTTCATAAAATTAAACAAGTTTTTGATGAGGATTCATTGTTTAATCCTGGTAAAGCAGTGCCAGAATTACATC GCTGTGCTGAGTTGGGTGCGATGCATATACATCGTGGTGAATTGCCATATCCAGAACTAGAGCGTTTTTAA Protein sequence : MTIVNQLTRAFPKGIVLTSNENTRPFECDGLSVYRQKPLAVVLPDNVMQIKQVLKICKINNIPIVTRGAGTGLSGGAMPL EKSIVLGLSKLNKVKLIDVENQLAVVEPGVRNIAISEAVAQYGLYYAPDPSSQIACTIGGNVSENSGGVHCLKYGLTVHN VEAIRMLTIDGDELILSCQDDGLGLLALMNGSEGLLGVITEVTVKLTPNPAFVKMVMAGFDSVRDCANAVTNIIKAGIIP AGLEMMDSFAIKAAEGFAQVGYPLDAKALLLCELDGIQTQVQLELDNVLKILSGASTLKVSESEEERLNFWKGRKSAFSA VGTLSPDYYCMDGTIPRRYLADMLEKIHKLSKKYQLRVANVFHAGDGNLHPLILYDANVTGELERTEEFGTEILKLSVDM GGTITGEHGVGVEKLNAMCHQFNTQELEIFHKIKQVFDEDSLFNPGKAVPELHRCAELGAMHIHRGELPYPELERF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 5e-141 | 59 |
