|
Name : secF (COSY_0901) Accession : YP_001219729.1 Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA Genome accession: NC_009465 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase SecF subunit Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0341 EC number : - Position : 938378 - 939292 bp Length : 915 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGTTTTAAAGTATTAAATATTCCAACAATTAACTTTATAGGTAAGCGTACTTATGCCATTATATTTTCAGTGTTATT GATTTCAGTTAGTATTTTTTCATTAACTACAAAAGGACTTAAATTAGGCATTGATTTTAAAGGGGGTACTTTAATTGAAG TAGGATATCAACAAAGTGTTGATTTAGCTGAGATTAGAGCTATTTTGGTGAATGCAAATTTTAAAAGGGCTAATGTTCAA TATTTTGGTTCAACCAATGAAATTTTAATTCGTTTAGAACCTCAATTAATTTCTAATGCTAAGCTAAGTTCAAAAATTAT TTATTTATTGGGTGATGATGTTGATATTCGTCGGGTTGAATTTGTGGGTCCTAAGGTGGGTGAAGAGCTTACAAATGATG GTGGTCTAGCAATGTTATATGCCCTGATTGGTATTTTGATTTATGTGTTATTTCGTTTTGAATATCGTTTTTCATTGGGC TCAATTGCAGCTCTTATTCATGATGTTATCATCATTTTAGGTGTTTTTTCATTATTTCAAATCGAGTTTGATTTGACGGT ACTGGCTGCTATATTAGCAGTTATTGGTTACTCTTTGAATGATACTATTGTGGTGTTTGATCGAATTCGTGAGAATTTCT TGTTAACACACCATGTTGAATCCTCTAGGATTATTAATGATGCACTTAACCAAACATTATCTAGAACAATAACGACCTCT TTGACTACTTTATTGGTATTATTGGCACTGTTCTTTTTAGGCGGTGAGATTATTCATAATTTTTCTTTAGCATTACTAAT TGGTGTAGTAATTGGCACTTATTCTTCTATTTATGTTGCAAGTTTGATGATTCTTGAATTAGGTATTACAAAGGAAAATT TGTTTTCATCTGATAAATCAAAGTCTAGACCTTAA Protein sequence : MSFKVLNIPTINFIGKRTYAIIFSVLLISVSIFSLTTKGLKLGIDFKGGTLIEVGYQQSVDLAEIRAILVNANFKRANVQ YFGSTNEILIRLEPQLISNAKLSSKIIYLLGDDVDIRRVEFVGPKVGEELTNDGGLAMLYALIGILIYVLFRFEYRFSLG SIAALIHDVIIILGVFSLFQIEFDLTVLAAILAVIGYSLNDTIVVFDRIRENFLLTHHVESSRIINDALNQTLSRTITTS LTTLLVLLALFFLGGEIIHNFSLALLIGVVIGTYSSIYVASLMILELGITKENLFSSDKSKSRP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secF | AAT96066.1 | SecF | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-53 | 50 |
| secF | AAT96102.1 | SecF | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-53 | 50 |
