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Name : secD (COSY_0902) Accession : YP_001219730.1 Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA Genome accession: NC_009465 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase SecD subunit Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0342 EC number : - Position : 939289 - 941136 bp Length : 1848 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATCATTATTCATGGCATAAAAATGCATTGATTGTATTTGTTTTATTGCTTTCAATATTGTATGCATTACCAAATAT ATTTGGTTCTGATTTAGCTATTCAAGTATCAAGTGTAGATAATGCTTTAATTGTTGATCAGGATTTGGTTAAAATTAAAA ATGTATTAAAGATTCAACAAATTAAGTTTAAATCTATTGAATTAATTAATCAAAGAATCTTAGTACGTTTTAAGAATAAG ATGCAACAGCTTTTAGCTAAAGATGCTCTTAATAAGGCACTGAGCCGGAGTTACGTGGTGGCGTTAAATTTGGCACCTTC TGTACCAGTTTGGTTGGCAAGTCTTGGTGGTAAGGCTATGTCACTTGGCTTAGACCTGAGAGGTGGTGTTCATTTTTTAT TAGAAGTTGATATGAAAGCGGTAATTTCAGCTTCAATGGATACAGCATACAATGAACTTCGTGTTTTATTACGTAAAGAT AGGCTATATAAAAGCATAAAGCAAAAAGGTAATAGTATTGTTATTCATTTTAAGCGATCTGAATTAAAAGACGAGGCATC CCAGTTAATTAAATCAGAATTGAGTGATTTAGTTCTGCTGAGTAATACAGATGATTTATTACTAAATATTGGTATTAGTG AGAGTGTACAAAAACAAGCTAAGAAAAGTGCACTTAAACAAAATATTACAACGTTACGTAATCGAGTGAATGAGTTAGGT GTAGCAGAGCCAATTATTCAACAGCAAGGCCTGGAACGTATTGTAGTCCAACTACCAGGTGTACAAGATACGGCTAGAGC AAAAGAAATTTTAGGTGCGGTAGCAACTTTAGAATTTAGACTAGTTGATGAAAAAAATGACCCACAAATAGCTATTCAGT CAGGGCGTTTACCAATTGGCTCAAAACTTTATTATTTTAAAGATGGTCGTCCGCTTTTGCTAAAAAGTCATGTGATTACA ACGGGTGAAAATATTACTGGTGCAACGTCTGGTGTTCACCAAGAAAATAACACGCCAATGGTTAATATCACACTTGATAG TGCTGGCGGTAGGGCAATGTTTAATACCACTAAAAAATACCTGCACCATCGTATGGCAGTTGTTTTTATTGAGAATAAAG TTGAAACAATTGTTAAAAATGGTAAAACCATTAAGAAGCGTACCACTACTAGAGATATTATTAATGCTGCTACAATTAAA GGTATATTTTCGTCACGGTTTCAGGTTACAGGTATTGATAATATCAAAGAGGCGCGTAATTTAGCGTTATTATTAAGGGC TGGTTCTCTTTCAGCGCCGATTGAAATTATTGAAGAGCGTACTATTGGTCCAAGTCTTGGTTCAGATAATATCACTAAAG GAGTTATATCAATATTAGTTGGATTTATTTTAGTGTTATTGTTTATGGCTATGCGTTATCAACTATTTGGTATGGTAGCA AATGTGGCTTTGACGCTTAATTTAGTGATGATTTTATCTATTTTGTCTTTATTACAAGCTACTCTTACACTGCCAGGTAT TGCAGGTATTGTGTTAACAGTAGGTATGGCAGTTGATGCTAATGTGTTAATCTTTGAACGTATTAAAGAAGAGATGGTAA TAAATAGAAATTTACCAAAAGCTATTTCAGTCGGTTATGATAAGGCGCTATTGACTATTTTAGATGCTAATATTACGACT TTGATTGCGGCATTGATTTTATTTAGTTTTGGTACTGGAGTAATTAAAGGTTTTGCGATTACTTTGTCAATTGGTATTAT TACTTCAATGTTTACAGCTATTATTGTTTCACGTGCAATTATTAATAAGATATATAGTGGTAAGAAGTTAGAAGAGATTT CAATATGA Protein sequence : MNHYSWHKNALIVFVLLLSILYALPNIFGSDLAIQVSSVDNALIVDQDLVKIKNVLKIQQIKFKSIELINQRILVRFKNK MQQLLAKDALNKALSRSYVVALNLAPSVPVWLASLGGKAMSLGLDLRGGVHFLLEVDMKAVISASMDTAYNELRVLLRKD RLYKSIKQKGNSIVIHFKRSELKDEASQLIKSELSDLVLLSNTDDLLLNIGISESVQKQAKKSALKQNITTLRNRVNELG VAEPIIQQQGLERIVVQLPGVQDTARAKEILGAVATLEFRLVDEKNDPQIAIQSGRLPIGSKLYYFKDGRPLLLKSHVIT TGENITGATSGVHQENNTPMVNITLDSAGGRAMFNTTKKYLHHRMAVVFIENKVETIVKNGKTIKKRTTTRDIINAATIK GIFSSRFQVTGIDNIKEARNLALLLRAGSLSAPIEIIEERTIGPSLGSDNITKGVISILVGFILVLLFMAMRYQLFGMVA NVALTLNLVMILSILSLLQATLTLPGIAGIVLTVGMAVDANVLIFERIKEEMVINRNLPKAISVGYDKALLTILDANITT LIAALILFSFGTGVIKGFAITLSIGIITSMFTAIIVSRAIINKIYSGKKLEEISI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 9e-105 | 45 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-105 | 45 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-105 | 45 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-105 | 45 |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 6e-105 | 45 |
