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Name : PsycPRwf_0802 (PsycPRwf_0802) Accession : YP_001279704.1 Strain : Psychrobacter sp. PRwf-1 Genome accession: NC_009524 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 955013 - 956962 bp Length : 1950 bp Strand : + Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein DNA sequence : ATGGTAATTACTGAGCTAGGGTATTTTGCTTTAGTGGCATCAATGGTATTGGCGTTACTGCAAGTGGTGCTACCAACTTT TGGCATTGTCCGGCAGCAGCCTCATTTGCAGCGTTTGGCTCCAAGCTTAGCTTGGGCACAGTTCGTGGCAGTAGGATTGT CCTTTTTGGCACTGATGGCTGGGTTTTATTATAACGACTTTACTTTAGTGTATGTCGCCCAGCACTCCAACTCTTTGCTG CCTTGGTACTATAAGCTATCTGCCACTTGGGGTGGTCACGAAGGGTCTTTACTATTGTGGGTAACCATTTTGGCTGGCTG GTCATCCATGGTGGCGTGGTTTAGCCGCGGCTTACCACTCAATATGCGTGCTCGCGTTTTAGTCATCTTAGCGGCTGTAC AGTTGATGATGTTGGCCATGCTGATTTTTACCTCATCACCTTTTGATCGCACCTTACCCAATGTCCCTGTGGATGGGGCG GATCTAACCCCCTTACTACAAGACCCCGGCTTAATTTTCCATCCACCTATGCTATATATGGGCTATGTGGGAATGGCAGT GCCGTTTGCATTTTGTATGGCGGCGCTTTGGGCCGGTCGTTTGGATGCGGTATGGACGCGTTGGTCTCGCCCGTGGGCGC TAGCGGCATGGGGCTTTTTGACCTTGGGTATCGCTTTGGGCTCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTTGGTTGGGGCGGTTGG TGGTTCTGGGATCCGGTTGAGAATGCATCCTTGATGCCTTGGCTGGCATGTACGGCCTTAATTCACTCGTTGGCGGTAAC TGAAAAGCGTGGGGTGTTTAAAGCGTGGACCATTATGCTGTCTATCTTCGCCTTTGCGCTAAGCTTACTGGGAACCTTCT TGGTGCGCTCAGGGGTGATTACCTCTGTGCATTCTTTTGCTGCTGATCCCACGCGTGGTTTGGCCATTTTAGCCATCTTA GGGGTGGTGATTGGCTCAGGGTTATTTGTGTTCGCTGTGCGCGGATGGCGCTTGACCGTTGAGAGTCATTATGGTCTAAA ATCACGTGAGACCTTATTAGTAATCAACAACATAGTAATATTAGTGGCCACCTTAGTGGTTCTACTAGGAACCTTGTATC CCATCATTGCTGACTCCTTTAATTTGGGTCAGGTATCGGTGGGCCCTCCTTACTTTAACGCCTTGTTCGTGCCTTTGGCG TGGCTGATTTTATTGACTATGGGTATGGGCTCAAACTTGCGCTGGAAGCAAGACAAACGCCCGCTGCTGGGTGCTGCCAC CACCATTTTGGTAAGCAGTGCATTGTTAGCCGGTATTATTACCTACCTCATTACCAAAAGTCTTAATGTCCAAATTATTA TCACCGGTTTATTGTGTTTGTGGGTGCTGGGCTGGATGTTGTATGACATCAAAGAAAAAACCCGCAATGCACCAAGCCTT GGGCGAGGTCTAAAGCGTTTAAAAGCTCATTATTGGGGCATGCAAATTGCGCATGTGGGCGTATTGATTGTCGCTTTGGG TATTGGTGTGACCACCGCGCTGAGTGTCGAAAAAGATGTGGCAATGACGGTGGGCGATACTGTGGATGTCAATGATTACC ACTTTACTTTAGTTGACTTTGAACAAGTGCGCGGCAAAAACTATGATGCCACTCAAGCGGAGATTAAGGTCGAAAAAGAC GGTAAGTTTGTGACCACGTTATACCCACAAAAACGTGATTATGTGGTCAGTAGCATGCCTATGACCGAAGCGGGTATCCA AACCACTATGCTACGAGATGTCTATGTGGCCCTAGGCGAGCCGATTAATGTCAATGAGCCTGAGGGTAATTGGGCAGTGC GTGTGTATGTTAAGCCCATGATTGCATGGCTATGGCTTGGTGCCATAGTGATGGCGTTAGGCGGCATTATCAGTATGCTA GATCGCCGTTATCGCCTAAAAAAATCTTAA Protein sequence : MVITELGYFALVASMVLALLQVVLPTFGIVRQQPHLQRLAPSLAWAQFVAVGLSFLALMAGFYYNDFTLVYVAQHSNSLL PWYYKLSATWGGHEGSLLLWVTILAGWSSMVAWFSRGLPLNMRARVLVILAAVQLMMLAMLIFTSSPFDRTLPNVPVDGA DLTPLLQDPGLIFHPPMLYMGYVGMAVPFAFCMAALWAGRLDAVWTRWSRPWALAAWGFLTLGIALGSWWAYYELGWGGW WFWDPVENASLMPWLACTALIHSLAVTEKRGVFKAWTIMLSIFAFALSLLGTFLVRSGVITSVHSFAADPTRGLAILAIL GVVIGSGLFVFAVRGWRLTVESHYGLKSRETLLVINNIVILVATLVVLLGTLYPIIADSFNLGQVSVGPPYFNALFVPLA WLILLTMGMGSNLRWKQDKRPLLGAATTILVSSALLAGIITYLITKSLNVQIIITGLLCLWVLGWMLYDIKEKTRNAPSL GRGLKRLKAHYWGMQIAHVGVLIVALGIGVTTALSVEKDVAMTVGDTVDVNDYHFTLVDFEQVRGKNYDATQAEIKVEKD GKFVTTLYPQKRDYVVSSMPMTEAGIQTTMLRDVYVALGEPINVNEPEGNWAVRVYVKPMIAWLWLGAIVMALGGIISML DRRYRLKKS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-114 | 49 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 9e-122 | 49 |
