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Name : Shew185_3878 (Shew185_3878) Accession : YP_001368065.1 Strain : Shewanella baltica OS185 Genome accession: NC_009665 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 4602432 - 4604498 bp Length : 2067 bp Strand : + Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein; KEGG: son:SO0478 cytochrome c-type biogenesis protein CcmF DNA sequence : ATGACAAATATGATTCCAGAGCTAGGGCACATATTGCTGATCATGAGTACTGTGTTGGCATTATTGTCGGCTAGTCATCA TTTAATCGGTAGCTACCGGAATAACTTTTACCTAATCAGCTTTGGCAATAAATTATTCTACGCTCTCTTTTTTACCTTAC TGGCAGCATTATTTAGCTTAATTTTTAGCTTTATTACCGATAACTTTTCAGTCGCCTATGTTGCCAATCATTCTAATAGT CAGCTCGCCCTCGGTTATAAAATCGCGGCGGTGTGGGGCAGCCACGAAGGCTCAATGTTATTTTGGGTGTTCGCCATTGC CCTGTGGGGTGCGGTGATCAATTGGCGTCAAGCGACGCATAACGCCAAGCTCGCCAATTTACAGGCTGATAGGGCTTACT TTGGCAGAGTTCTCGCTATTTTGGCCTTAGTGATCCTCGGCTTTAATTTGTTTTTACTCTTTACCTCCAATCCCTTTGCC CGCTTACTCCCAAACATTCCAGTCGAAGGACGCGACCTTAACCCCATATTGCAGGACATTGGCTTAATACTGCATCCACC AATGCTGTTTTTAGGTTATGTCGGGCTAACGGTTTGCTTTGCCGCAGCACTGGCATCACTCATTGGGGGCAAATTACCTG CTCGCCACCTCGATTACCTTCGCCCTTGGGTGTTACTGGCGTGGATTTTCCTTACTGGTGGCAATGCCTTTGGTTCTTGG TGGGCCTATAACGAACTGGGCTGGGGCGGATGGTGGTTTTGGGACCCTGTAGAAAACGCGTCATTTATCCCTTGGCTTGT CGCTACAGCATTAGTCCATTCCATTGTTCTGACGAAACGCACTAATGGCTTTCAAATCACAACATTGCTGCTGTGCCTAT TAGCTTTCTCACTCAGTTTGCTGGGCAGTTTTTTGGTACGTTCCGGCATAGTGCAATCGGTGCATGCCTTTGCCGCTGAT CCTACCCGTGGTATGTCAATCCTCTGTTTATTAATACTTTTTGTTAGCGTAGCTCTGCTCACCTTTGCACTTAAAGCCAA TAACTTCAGACACTCAGTTCGGCATAGCATTTTCAGTAAAGAAACGCTGTTGCTACTCGGTATTGTAATATTAGTCGTAG CGGCATTTTCCGTTCTACTCGGTACCTTCTATCCCTTGCTCTATGAATTACTTGGTTTAGGTACACTTTCTGTCGGTGCC CCTTATTTTAATGCGATCTTTGTACCTCTGACCTTCTTACTCGTACTCTTGATGGGTGTCGCCCCTTTAGCTGGTTGGCA AAAAGCATCCAAAGCTCAAGTTAAGCCTTTGATCATACCCGGTGCACTGATCTTAACTGCAGCTCTGTGGATAAGCTTAC AAGCAGCAACTGGCAACAATTTATTTCTGTTACTTGGCACTGCAGCAGCGCTTTGGTTACTCGTTTGCTTATTATTAACA TTGATAGCAGCATTAGGATTAAAAAATAAAAATCACCAAAATAAACAGCCTGTTAAAGAAAATATAAATACAGCTAAGCC TCTCCCTAAACGACGCCTCATGGCCATGCTGCTTGCTCATTTAGGCGTGGCTGTAACTATAATAGGTGCGACGGCCGTCT CTTTCTTTGAACAAGAAGCCCTGCTAAGAATGGGCCCAGGCCAAGGTAAGCCGTTAGCGGGTTATGTCTTAGTTTATGAA AGTACCGAGAATATCGAGACCAAGAGTTTTACTGCGATTCAAGCCAATATCAGTATCCGTGATGCAGCCCAAGATGAGCT GGTACTAGGTTATATCACCCCACAACGACAAACCTTCAAAAGCAATGCCATGGAAATGTCCCATGCTGGTATTGATCACG GCCTATGGCGGGATATTTATGTCTCGATGGGATTGCAACTTAGTGATAACGAATACCTGATCCGCATCAGCTATAAACCC CTTGCCAGTTGGATCTGGCTTGGGGCACTGCTAATGATGTTAGGTGGAACTGTCGCCGCTTGGCCTACTCGCAGCCTGAG TTATTACCCGAAACCAGCAGCCTTACCTAACTCATCCCATTCATTGCAAAGGGAAATGCTTGCCTAA Protein sequence : MTNMIPELGHILLIMSTVLALLSASHHLIGSYRNNFYLISFGNKLFYALFFTLLAALFSLIFSFITDNFSVAYVANHSNS QLALGYKIAAVWGSHEGSMLFWVFAIALWGAVINWRQATHNAKLANLQADRAYFGRVLAILALVILGFNLFLLFTSNPFA RLLPNIPVEGRDLNPILQDIGLILHPPMLFLGYVGLTVCFAAALASLIGGKLPARHLDYLRPWVLLAWIFLTGGNAFGSW WAYNELGWGGWWFWDPVENASFIPWLVATALVHSIVLTKRTNGFQITTLLLCLLAFSLSLLGSFLVRSGIVQSVHAFAAD PTRGMSILCLLILFVSVALLTFALKANNFRHSVRHSIFSKETLLLLGIVILVVAAFSVLLGTFYPLLYELLGLGTLSVGA PYFNAIFVPLTFLLVLLMGVAPLAGWQKASKAQVKPLIIPGALILTAALWISLQAATGNNLFLLLGTAAALWLLVCLLLT LIAALGLKNKNHQNKQPVKENINTAKPLPKRRLMAMLLAHLGVAVTIIGATAVSFFEQEALLRMGPGQGKPLAGYVLVYE STENIETKSFTAIQANISIRDAAQDELVLGYITPQRQTFKSNAMEMSHAGIDHGLWRDIYVSMGLQLSDNEYLIRISYKP LASWIWLGALLMMLGGTVAAWPTRSLSYYPKPAALPNSSHSLQREMLA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-86 | 42 |
