|
Name : cycK (Btr_0702) Accession : YP_001609123.1 Strain : Bartonella tribocorum CIP 105476 Genome accession: NC_010161 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C-type biogenesis protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 741214 - 743214 bp Length : 2001 bp Strand : + Note : cytochrome c-type biogenesis protein (cycK) (ccmF),InterPro; Cytochrome c assembly protein; hypothetical protein DNA sequence : GTGTGGAGAAATAATTCGATTGTGCTTGTCGAACTGGGGCATATTTTTTTAGCTGCAGCACTTGCTGTAAGCTTATTAGA AGCTTTCTTACCTGCTTTAGGTTTTTGGAAGAAAGAGCGTTTGTTAATGCAAACAGCTATTCCTTTAACATACATCACTT TTACATTATTGCTCTTATCTTTTTTAGTAATGATTTACGCTCACGCCGTATCTGATTTTTCTGTTTTGAACGTTATTGAG AATTCTCATTCAGAAAAACCGATGCTCTATAAAATCACGGGTATTTGGGGCAACCACGAAGGTTCTATGTTGTTATGGGT TTTATGTCTCACTTTTTTTAGTGCATTGATGGCTTTCTTTAGCCAAGATTTGCCAGAAGATTTTAAGACACTCATTTTAA TTTGCCAAAGTTGGATTACAAGCGCTTTTCTTTTATTTATTCTTTTTGTATCGAACCCATTTTTACGTGTGTATCCACCA GCATTACAGGGAAATGATCTCAATCCTCTTTTACAAGATATCGCATTAGCGATTCATCCCCCCCTTCTTTATTTAGGTTA TGTTGGTTTTTCACTCTGCTTTTCTTTTGCCATTGCGGCATTGATTATCGGGCATATCGATAAGATTTGGGCACGTTGGG TGCGTCCTTGGCTTTTACTTTCTTGGTGTTTTTTGACATTGGGGATTATGGTTGGCTCCTATTGGGCTTATTATGAGCTA GGGTGGGGAGGGTATTGGTTTTGGGATCCTGTTGAAAATGTTTCGTTTATGCCTTGGCTTTCAGGAACGGCTCTTTTACA TTCTGCTCTTGTTCTCGAAAAACGAGGAATATTGAAAAGTTGGACTTTGTTTTTAGCATTGCTCACTTTTTCTTTTTCTC TGATGGGAACGTTTCTTGTTCGTTCGGGACTTTTGGTTTCTGTTCATAGTTTTGCTGTTGATCCAGCACGGGGGCAAGCA ATTCTTGCAATTTTATTTTTCTTCACGGGAGCGGCTTTTCTTCTTTTTGCTTTGCGCATCCCTCTTTTAAGAACAGAAAG CTTTTTTCAACCAATTTCGCGTGAAGGGTTTATTGTTTTAAATAACTTATTACTAACAACAACAACAGCAACAGTATTGA TTGGTACGCTCTATCCTTATTTTATTGAGATGTTAACAGGGCAAAAAATTTCTGTAGGGGCTGCTTTTTTTAATCTTACC TGTGGACCGCTCATGCTTTTGCTGTTGTTTCTTGTTCCGTTTGGGCCAATGATGGCATGGAAACGCGGTGATTTTTTCGC AGTTTTTGAACGGTTGTGGTTTGTTTTTGTCTTAGTTGCTACTGTCTGTTTTATATTATTTTATGCGACATCTTTGCGTG ATATTCTCGCAGTTTTAGGCATTGGGCTCTCAGCATTTGTTTTTTTAGGCAGTTTAGCGGATCTGTGGGGAAAGAGTGGT TATGGCAAGAAAGCTTTTTCAGTACGTGTTAAGAGATTTCTTGGATTGCCATGGTCTGTTTTTGGTGCAGCAATGGCACA TATGGGATTGGGCGTTACATTATTTGGTATTGTTTGTGTGGCAAGTTTCGGGCAAGAACGTATTTTAACCATGAACATAG GAGAGTGGGTGACGATAGCAGATAAAACGCTTCATTTTGATACCGTGCATAATCGTTTTGGTTCGAATTATTCGGCAATG GAGTTTCGTTTTAAAATATATGAAAATAAAAAAATCGTGGGTCATGTAACAGCTTCAAAGAGATTTTATGCAAGCCAAAA TACATCAACAACAGAAGTTGGTCTTCAAAATCATGGTTTATCGCAGCTCTATATTGTGCCGGGACATTTCGATAATCGGG GGCTTGTTGTGCATATATGGTGGAAGCCTTATATCATATGCATTTGGTTAGGGGCATTCATGATGGCTATGGGAGGATGT TTTTCTCTTCTGGGGTATTGGTTTCGCACTGGAGTGTACAAGAGGGGGCTGTTTGCTTTAAATTTTTGGAGAAGATATTG A Protein sequence : MWRNNSIVLVELGHIFLAAALAVSLLEAFLPALGFWKKERLLMQTAIPLTYITFTLLLLSFLVMIYAHAVSDFSVLNVIE NSHSEKPMLYKITGIWGNHEGSMLLWVLCLTFFSALMAFFSQDLPEDFKTLILICQSWITSAFLLFILFVSNPFLRVYPP ALQGNDLNPLLQDIALAIHPPLLYLGYVGFSLCFSFAIAALIIGHIDKIWARWVRPWLLLSWCFLTLGIMVGSYWAYYEL GWGGYWFWDPVENVSFMPWLSGTALLHSALVLEKRGILKSWTLFLALLTFSFSLMGTFLVRSGLLVSVHSFAVDPARGQA ILAILFFFTGAAFLLFALRIPLLRTESFFQPISREGFIVLNNLLLTTTTATVLIGTLYPYFIEMLTGQKISVGAAFFNLT CGPLMLLLLFLVPFGPMMAWKRGDFFAVFERLWFVFVLVATVCFILFYATSLRDILAVLGIGLSAFVFLGSLADLWGKSG YGKKAFSVRVKRFLGLPWSVFGAAMAHMGLGVTLFGIVCVASFGQERILTMNIGEWVTIADKTLHFDTVHNRFGSNYSAM EFRFKIYENKKIVGHVTASKRFYASQNTSTTEVGLQNHGLSQLYIVPGHFDNRGLVVHIWWKPYIICIWLGAFMMAMGGC FSLLGYWFRTGVYKRGLFALNFWRRY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 5e-62 | 41 |
