Gene Information

Name : glcD (MAE_52600)
Accession : YP_001660274.1
Strain : Microcystis aeruginosa NIES-843
Genome accession: NC_010296
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : glycolate oxidase subunit
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0277
EC number : -
Position : 4822430 - 4823896 bp
Length : 1467 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTTACTCAAAAATCCCCCGAAAATCTCCCCCAATCTGATCAAACAGTTAGAAGCGATCCTTGGCAAAGATGGAGTCAT
CCGTCGCAAAGATGAATTATTAACCTACGAGTGCGATGGTATCACAGGATACAGACAAAGACCCGCTCTTGTGGTACTGC
CTCGCAGCACCGCAGAAATTGCGGCGGTGGTGAAACTCTGTCACGATAACGAGATTGCCTGGGTAGCGAGGGGTGCAGGA
ACGGGCTTATCGGGAGGGGCGTTACCCTTAGAAGAGGGGATTCTCATCGTCACGGCGCGGATGAATCAGATTCTCAGGGT
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GGGTGCGGTACCGGAACAACCGGGCTATGATTTAACCGGTTTATTTGTGGGTTCCGAGGGAACTTTAGGCATCGCCACGG
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GGAAGATGTGGTGGCTACCGGCTGTTATCCCCGGGATGCCGAGTCAGTTTTGTTAGTGGAATTGGATGGTTTAGGGGTAG
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GAAACCCGCTTGAAACTCTGGAAGGGCAGAAAAGCGGCTTTTGCGGCGGCGGGGAAAATTAGCCCTAATTATTTTGTGCA
AGATGGGGTGATTCCCCGCACTCAATTGGTCTATGTTCTTCAGGAAATTAAGGCTTTAAGTGAAAAATACGGCTATAAAA
TCGCCAATGTTTTCCACGCCGGTGATGGTAATTTACACCCGTTGATTCTCTACGATAATAAGGTGGAGGGGGCCTGGGAA
GAAGTGGAAGAATTAGGCGGTGAAATTCTCAAGCTTTGTGTGCGGGTTGGCGGCAGTTTATCGGGGGAACACGGTATCGG
CATCGATAAAAATTGTTATATGCCCGCCATGTTCAACGAGATTGACTTAGAAACTATGGGCTATGTGCGGGACTGTTTTA
ATCCCAAAGGTTTAGCTAACCCGGGGAAATTATTCCCCACCCCGCGCAGCTGTGGGGAAGCCGCTAATGCCAAAATACAA
GGGTTTGCGGGGGTGGATGTGTTTTAG

Protein sequence :
MLLKNPPKISPNLIKQLEAILGKDGVIRRKDELLTYECDGITGYRQRPALVVLPRSTAEIAAVVKLCHDNEIAWVARGAG
TGLSGGALPLEEGILIVTARMNQILRVDLDNQRVVVQPGVINNWVTQAVSGAGFYYAPDPSSQIICSIGGNVAENSGGVH
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ETRLKLWKGRKAAFAAAGKISPNYFVQDGVIPRTQLVYVLQEIKALSEKYGYKIANVFHAGDGNLHPLILYDNKVEGAWE
EVEELGGEILKLCVRVGGSLSGEHGIGIDKNCYMPAMFNEIDLETMGYVRDCFNPKGLANPGKLFPTPRSCGEAANAKIQ
GFAGVDVF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcD CAE85245.1 GlcD protein Not tested PAI V 536 Protein 2e-103 50