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Name : Shal_0550 (Shal_0550) Accession : YP_001672784.1 Strain : Shewanella halifaxensis HAW-EB4 Genome accession: NC_010334 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 661411 - 663387 bp Length : 1977 bp Strand : - Note : TIGRFAM: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome c assembly protein; KEGG: son:SO_0478 cytochrome c-type biogenesis protein CcmF DNA sequence : ATGATCCCAGAGTTAGGACTTATTTTCCTTATCATTAGCACAGTCACTGCTGTGTTACTTGCGTTTATTCCGCTCTATGC GTCATATACTAAAAACCATTATTTATTTAGTTATGTAAAAACATTAACCGCATTAATGACGGTCACCATTAGCGCTTCTA TATTATGTTTGCTTATTTCATTTTTACTCGATGACTTCTCGGTTGCCTATGTTGCCAACCATTCCAATACGCAATTAGCC ACCCTATATAAAGTCGCCGCGGTATGGGGTAGCCATGAAGGCTCAATGCTGTTTTGGGTGGTATCGATAGCCATTTGGGG CTGTTTGATTGTGTTCTCATCGCGCTACCAAGATCCACTGTTTATTGGCCGCATGATTGCCATCTTGGCATTTGTTATTG CCGGCTTTAACTTATTCATGCTGTTTACCTCTAACCCCTTTGCGCGCTTGCTGCCAAACTTCCCGGTTGAAGGTCGTGAC CTTAACCCAATCTTGCAAGACATAGGCCTTATCTTCCATCCGCCGATGTTGTTCTTAGGCTATGTTGGCTTAACCATCAC CTTTGCCGCCGCGATTGCGGCGCTACTGGGGGGCAAGTTTACTCAACAACATGCTGGCTATTTGCGTCCTTGGGTGCTTA TGGCCTGGGTCTTTTTAACTGGTGGTAATGCCTTTGGCTCATGGTGGGCCTATAACGAACTTGGCTGGGGCGGATGGTGG TTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCGTTTATTCCCTGGTTGGTCTCCACTGCATTACTGCACAGCGTGGTACTGAGTCA GCAACGTAGCAGTTTTAAGATCACCACCCTGTTGCTGTGTTTACTGGCATTCTCATTGAGCTTATTAGGCACCTTCTTAG TGCGCTCAGGTATCGTACAATCGGTACACGCCTTTGCGTCAGACCCGACTCGCGGCATGTCAATTCTATTCCTATTGGGT GTTTTTGTGTGTGGCGCCTTAACCCTGTTTGCCTTAAAGGCTCATTTGATTAAGTCTAAGTCTGACTTTGCCCTCATCTC ACGAGATAGCGTGATGTTGCTCGGCAACATCGTCTTAATCGTGGCAGCTATCTCAGTGCTACTCGGCACCTTCTATCCAC TGCTATTCGAGCTATTAAATCTAGGTACCCTATCTGTTGGCGCGCCTTATTTTAATAGTATGTTCGTGCCACTGACCTTT GTCGCCGTATTGCTCATGGGCGCTGCGCCGCTTATTAAGTGGCAACAACAGACGTTAAATAGCTTATACCCACTACTTGG ATTATTTGCCGCGGCCGCAGTGATAGGTGTGCTGGTCGCAATACAAACTCGTGATGGCTTTAACCCTTGGGTATGGATTG GTGCCACTTCAGCTAGCTGGATATTGCTAACTCTTGGCTACTTAATGTTTAACCTACGCCAGCAAGGATTAGCCGTTATC GCTAACAAGGCTGCCATGTTGATCGCTCACCTTGGTGTGGCTGTCACAATTATCGGCGCTACAGCCGTATCCAACTTTGA AACGCAGGAGTTACTCAGAATGGGGCCGGGGCAAGGCAAGGTCGTTGCTGGATACACCTTTGTGTATGAAGACACCGTTG ATGTGGATGCCACGAGTTATACCGCGATTCAGGCTAACATTCGCGTCACCGATAGTGATGATAACTTTATCGGTTATATC ACCCCACAGCGCCAAACCTTTAAGACTAACGCCATGGAGACGACTCAAGCGGGCATTATGCGTAACTTAGCGCGCGATCT ATATGTCTCCAGTGGCCAACAATTGAGCGAGACTGAATACTTGGTACGTATTAGCCACAAACCACTGGCGTGTTGGCTCT GGATTGGTGGCTTGATGATGATGTTTGGCGGCACTATTGCGGCTTTTTCAGGCTTACATAACCTCCGTCAGCAAAAAGCA AAGGCTCACTCCTCGTCCTCACAAGTCACATCTAAGTATACCGAGGAATTAGCATGA Protein sequence : MIPELGLIFLIISTVTAVLLAFIPLYASYTKNHYLFSYVKTLTALMTVTISASILCLLISFLLDDFSVAYVANHSNTQLA TLYKVAAVWGSHEGSMLFWVVSIAIWGCLIVFSSRYQDPLFIGRMIAILAFVIAGFNLFMLFTSNPFARLLPNFPVEGRD LNPILQDIGLIFHPPMLFLGYVGLTITFAAAIAALLGGKFTQQHAGYLRPWVLMAWVFLTGGNAFGSWWAYNELGWGGWW FWDPVENASFIPWLVSTALLHSVVLSQQRSSFKITTLLLCLLAFSLSLLGTFLVRSGIVQSVHAFASDPTRGMSILFLLG VFVCGALTLFALKAHLIKSKSDFALISRDSVMLLGNIVLIVAAISVLLGTFYPLLFELLNLGTLSVGAPYFNSMFVPLTF VAVLLMGAAPLIKWQQQTLNSLYPLLGLFAAAAVIGVLVAIQTRDGFNPWVWIGATSASWILLTLGYLMFNLRQQGLAVI ANKAAMLIAHLGVAVTIIGATAVSNFETQELLRMGPGQGKVVAGYTFVYEDTVDVDATSYTAIQANIRVTDSDDNFIGYI TPQRQTFKTNAMETTQAGIMRNLARDLYVSSGQQLSETEYLVRISHKPLACWLWIGGLMMMFGGTIAAFSGLHNLRQQKA KAHSSSSQVTSKYTEELA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 4e-93 | 42 |
