Gene Information

Name : pgk (OTT_0004)
Accession : YP_001936696.1
Strain : Orientia tsutsugamushi Ikeda
Genome accession: NC_010793
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phosphoglycerate kinase
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG0126
EC number : -
Position : 8802 - 10022 bp
Length : 1221 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGATACAGTTAAGACAACTTTCAGATGTTATAGTAAAAGATAAAGTAGTTTTACTAAGACTGGATCTTAATATACCTCA
AGAAGGTGGCAAAATAACTGATAATACACGTATAGTTCGTACTATACCAACAATAAAATATCTAATTTTACATGGAGCAA
AGGTAGTAATTATCTCACACCTTGGAAACCCAAAAGGTAGAATAGAATTAACATTATCGCTAAGATCAGTTGTGACTGAA
CTTGAAGCATTGTTAAATATTAAGGTGCAATTTTGTCCTGAATCAATTGGATCAACTCCTAAAAACGCTATAATAAAGAT
GAAAGCCGGAGAAGTTTTATTGCTTGAAAATTTAAGATTTAATTCAGGAGAAGAGCTAAACGATGCTACTTTCGTTAACG
AACTTAGTAGCTTAGGAGATATATATGTTAACGATGCTTTTTCTTGCTCTCATAGAAAACATGCATCTATTTGTGGTTTA
CCAGCTAAATTACCTTCAGCAGCTGGGTTTTTATTATTAAGCGAGCTAAAACATTTAACTTCAATTTTTAGTAACGCTAA
TAAGCCATTTACTGTAATTATAGGCGGAGCAAAAATGTCCACAAAATTAGATTTGTTGAATAGTTTGATTACTAAAGCAG
ATTATTTAATCGTTGCTGGTGCTATGGCTAATATTTTTCTAGCTATGAAGCGCTTTAATATTGGAGCATCATTATATAAA
CCAGAACTGGTAAATGTAGCTTCACTAATTTTAAAAAAAGCAACTTCGACAAATTGTAAAATAATACTTCCGTTCGATGC
AGTAATACAAAATTTTAATAGTAACAACATAACTATAATAGAATTAAACTCCTCTTTAGTGATGCAATCTAATGCTAAAA
TTATGGATATTGGTCCTAAAACAATTGCTCAGATAATTAACATAATAAAAATATCTAAAACTATAGTATGGAATGGACCA
GTTGGCGCCTTTGAACAACTCCCTTTTGATCATGGCTCAACCTACCTAAGTAAAGCAATAGCCGAAAAAACTAGAACTGG
CAGCCTTTGTAGTGTTGCTGGTGGCGGAGATACCATATCAGCAATAAAAAAGTCTGGAGTTATTGACGATTTTAGCTATA
TCTCAACTGGAGGCGGCGCTTTTCTTGAATGGTTACAAGGTAAAACATTGCCAGGAGTTGAAGCTTTGATGCAAAAATTA
GATACAGCTAAATACATATAA

Protein sequence :
MIQLRQLSDVIVKDKVVLLRLDLNIPQEGGKITDNTRIVRTIPTIKYLILHGAKVVIISHLGNPKGRIELTLSLRSVVTE
LEALLNIKVQFCPESIGSTPKNAIIKMKAGEVLLLENLRFNSGEELNDATFVNELSSLGDIYVNDAFSCSHRKHASICGL
PAKLPSAAGFLLLSELKHLTSIFSNANKPFTVIIGGAKMSTKLDLLNSLITKADYLIVAGAMANIFLAMKRFNIGASLYK
PELVNVASLILKKATSTNCKIILPFDAVIQNFNSNNITIIELNSSLVMQSNAKIMDIGPKTIAQIINIIKISKTIVWNGP
VGAFEQLPFDHGSTYLSKAIAEKTRTGSLCSVAGGGDTISAIKKSGVIDDFSYISTGGGAFLEWLQGKTLPGVEALMQKL
DTAKYI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
pgk AAO17214.1 Pgk Not tested tcd island Protein 3e-48 41