Name : pgk (OTT_0004) Accession : YP_001936696.1 Strain : Orientia tsutsugamushi Ikeda Genome accession: NC_010793 Putative virulence/resistance : Unknown Product : phosphoglycerate kinase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0126 EC number : - Position : 8802 - 10022 bp Length : 1221 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATACAGTTAAGACAACTTTCAGATGTTATAGTAAAAGATAAAGTAGTTTTACTAAGACTGGATCTTAATATACCTCA AGAAGGTGGCAAAATAACTGATAATACACGTATAGTTCGTACTATACCAACAATAAAATATCTAATTTTACATGGAGCAA AGGTAGTAATTATCTCACACCTTGGAAACCCAAAAGGTAGAATAGAATTAACATTATCGCTAAGATCAGTTGTGACTGAA CTTGAAGCATTGTTAAATATTAAGGTGCAATTTTGTCCTGAATCAATTGGATCAACTCCTAAAAACGCTATAATAAAGAT GAAAGCCGGAGAAGTTTTATTGCTTGAAAATTTAAGATTTAATTCAGGAGAAGAGCTAAACGATGCTACTTTCGTTAACG AACTTAGTAGCTTAGGAGATATATATGTTAACGATGCTTTTTCTTGCTCTCATAGAAAACATGCATCTATTTGTGGTTTA CCAGCTAAATTACCTTCAGCAGCTGGGTTTTTATTATTAAGCGAGCTAAAACATTTAACTTCAATTTTTAGTAACGCTAA TAAGCCATTTACTGTAATTATAGGCGGAGCAAAAATGTCCACAAAATTAGATTTGTTGAATAGTTTGATTACTAAAGCAG ATTATTTAATCGTTGCTGGTGCTATGGCTAATATTTTTCTAGCTATGAAGCGCTTTAATATTGGAGCATCATTATATAAA CCAGAACTGGTAAATGTAGCTTCACTAATTTTAAAAAAAGCAACTTCGACAAATTGTAAAATAATACTTCCGTTCGATGC AGTAATACAAAATTTTAATAGTAACAACATAACTATAATAGAATTAAACTCCTCTTTAGTGATGCAATCTAATGCTAAAA TTATGGATATTGGTCCTAAAACAATTGCTCAGATAATTAACATAATAAAAATATCTAAAACTATAGTATGGAATGGACCA GTTGGCGCCTTTGAACAACTCCCTTTTGATCATGGCTCAACCTACCTAAGTAAAGCAATAGCCGAAAAAACTAGAACTGG CAGCCTTTGTAGTGTTGCTGGTGGCGGAGATACCATATCAGCAATAAAAAAGTCTGGAGTTATTGACGATTTTAGCTATA TCTCAACTGGAGGCGGCGCTTTTCTTGAATGGTTACAAGGTAAAACATTGCCAGGAGTTGAAGCTTTGATGCAAAAATTA GATACAGCTAAATACATATAA Protein sequence : MIQLRQLSDVIVKDKVVLLRLDLNIPQEGGKITDNTRIVRTIPTIKYLILHGAKVVIISHLGNPKGRIELTLSLRSVVTE LEALLNIKVQFCPESIGSTPKNAIIKMKAGEVLLLENLRFNSGEELNDATFVNELSSLGDIYVNDAFSCSHRKHASICGL PAKLPSAAGFLLLSELKHLTSIFSNANKPFTVIIGGAKMSTKLDLLNSLITKADYLIVAGAMANIFLAMKRFNIGASLYK PELVNVASLILKKATSTNCKIILPFDAVIQNFNSNNITIIELNSSLVMQSNAKIMDIGPKTIAQIINIIKISKTIVWNGP VGAFEQLPFDHGSTYLSKAIAEKTRTGSLCSVAGGGDTISAIKKSGVIDDFSYISTGGGAFLEWLQGKTLPGVEALMQKL DTAKYI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
pgk | AAO17214.1 | Pgk | Not tested | tcd island | Protein | 3e-48 | 41 |