Gene Information

Name : tgt (BDU_817)
Accession : YP_002222445.1
Strain : Borrelia duttonii Ly
Genome accession: NC_011229
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : queuine tRNA-ribosyltransferase
Function : -
COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis
COG ID : COG0343
EC number : 2.4.2.29
Position : 872332 - 873459 bp
Length : 1128 bp
Strand : +
Note : Exchanges the guanine residue with 7-aminomethyl-7-deazaguanine in tRNAs with GU(N) anticodons (tRNA-Asp, -Asn, -His and -Tyr)

DNA sequence :
ATGTTTAATATTATCAAAAATGATAAAAATTCTAATGCAAGACTTGGTATACTTGAACTTCCTCATGGGAATGTTGCAAC
GCCATGTTTTATGCCGGTTGGTACTTTGGGTGTTATGAAGGCTTTAAAGCATGATGTGCTTGAAAAATTGGGATGTGATT
TAATGCTTGCAAATACTTATCACTTGTATTTAAGACCTGGTATTGATGTAATAAAAAAATATGGAAATTTGCATAATTTT
ACGACTTGGAATAAAAATTTTTTGACAGATTCTGGAGGTTTTCAAGTTTTCTCTTTATCTAATTTTAGAAAAATTGAGGA
TGAAGGGGTAGATTTTAAATCTCATATTGATGGGTCTAGACACTATTTTACACCTGAGAGTGTATTTAGTATGCAAGAGA
CTTTTGAGAGTGATATTATTATGGCTCTTGATATTTGTAGTCCTTATGGTATTGATTATGATGAGGCAAGTTTGTATACA
AATATTACAACTTCTTGGGCTCGTCGTACATTGTGTGCTTATAAAAATAGAAAAGAGGGGTATGAGGGTCTTTTATTTTT
AATAACGCAGGGTAATTTTTTTAAAGATCTAAGAAAAAGAAGCACTGAATCAATTTTGGAATTAAATAGTCCTGGTATTG
CGATTGGTGGGATATCTGTTGGGGAACCAAGAGATAGATATTTAGAAATTCTTGAATATAATTCTTCACTAATACCTAAA
GATAAACCAAAGTACGTAATGGGTATTGGTACTCCTCATTATATATTAGATGCAATATATAATGGGATTGATATTTTTGA
TTGTGTTAATCCTACAAGAATTGCTAGACATGGTTCACTTTTGACTGATAATGGAATACTTCGTATTAATCGAGCTGAAT
TTCGTTTTGATACTTGTTCTGTTGAAAGAGAATGTTCTTGTACGTTATGTACGAGATATTCAAGGGGATATTTAAGGCAT
TTATTTAAATCAGAAGAAGCACTTGGAGTTATGTTAGCTAGTGAGCACAACATTCATTATATGTTTAGACTAATTAACAA
GGCTAAAAATGCAATTATGAATGATAATTTTGTAAAATTTAGAAAGCTTTATTTGGATAAGTATGATGAAGGTAATTTGA
ATGAGTAG

Protein sequence :
MFNIIKNDKNSNARLGILELPHGNVATPCFMPVGTLGVMKALKHDVLEKLGCDLMLANTYHLYLRPGIDVIKKYGNLHNF
TTWNKNFLTDSGGFQVFSLSNFRKIEDEGVDFKSHIDGSRHYFTPESVFSMQETFESDIIMALDICSPYGIDYDEASLYT
NITTSWARRTLCAYKNRKEGYEGLLFLITQGNFFKDLRKRSTESILELNSPGIAIGGISVGEPRDRYLEILEYNSSLIPK
DKPKYVMGIGTPHYILDAIYNGIDIFDCVNPTRIARHGSLLTDNGILRINRAEFRFDTCSVERECSCTLCTRYSRGYLRH
LFKSEEALGVMLASEHNIHYMFRLINKAKNAIMNDNFVKFRKLYLDKYDEGNLNE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tgt AAT96041.1 Tgt Not tested T-PAI Protein 2e-72 42
tgt AAT96105.1 Tgt Not tested T-PAI Protein 2e-72 42
tgt AAT96121.1 Tgt Not tested T-PAI Protein 2e-72 42
tgt AAT96069.1 Tgt Not tested T-PAI Protein 1e-72 42
tgt AAT96181.1 Tgt Not tested T-PAI Protein 1e-72 42